對(duì)海南地區(qū)Bt菌株cry基因的鑒定、克隆及蛋白活性分析
【學(xué)位授予單位】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類(lèi)號(hào)】:S482.39;Q78
【圖文】:
東北農(nóng)業(yè)大學(xué)理學(xué)碩士學(xué)位論文最后,同源性高于 95%的蛋白在第四等級(jí)里進(jìn)行類(lèi)別區(qū)分[18]。不管怎樣,這種法可為每個(gè)獨(dú)立編碼蛋白的基因序列進(jìn)行分類(lèi),因此,盡管有些蛋白可能在第四但實(shí)際上它們的氨基酸序列也可能是相同的[18]。這種命名系統(tǒng)通常用于 Bt 蛋素(Cry 和 Cyt)和分泌蛋白(Vip 和 Sip)的命名與分類(lèi)。到目前為止,共Cry1-Cry74,Cyt1-Cyt3,Vip1-Vip4,Sip)包括 349 種模式基因。
盡管結(jié)果發(fā)現(xiàn)這九種毒素蛋白的氨基酸序列和殺蟲(chóng)特異性差別較大,但它們活性區(qū)域卻具有一致的結(jié)構(gòu):即大部分ICPs的結(jié)構(gòu)域主要包括Domain I、Domain II和Domain III(圖1-3)。Domain I位于活性Cry蛋白的N-末端于1991年由Li等首次報(bào)道[30]。它包括一個(gè)α-螺旋束,在這個(gè)α-螺旋束中,一個(gè)疏水的 -螺旋中心由有6個(gè)反向平行的 -螺旋圍繞著形成(圖1-3)。有研究認(rèn)為Domain I會(huì)與毒素寡發(fā)生聚化、插入細(xì)胞膜以及空洞形成有關(guān)[31],在Domain Ⅱ中是由三個(gè)反向平行的β-折疊構(gòu)成一個(gè)β棱柱( -prism)結(jié)構(gòu)(圖1-3)[30],其中兩個(gè)折疊片暴露在外側(cè)表面的而且是由希臘鑰匙的四條單鏈組成的。這種結(jié)構(gòu)被形象地稱(chēng)為“Greek Key”拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)由由四個(gè)反向平行的 -折疊片段構(gòu)成。還發(fā)現(xiàn)與幼蟲(chóng)中腸蛋白的特異結(jié)合有關(guān)是暴露在外面的Loop區(qū)域[31]。近年來(lái)有研究表明,某些氨基酸的位點(diǎn)或區(qū)域與殺蟲(chóng)特異性有很大的關(guān)系是因?yàn)镃ry蛋白的DomainⅡ結(jié)構(gòu)上的Cry毒素結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)。Cry毒素結(jié)構(gòu)是DomainⅡ中變化最多的結(jié)構(gòu)域[32],DomainⅡ的該區(qū)域與免疫球蛋白的相似性足可以表明毒素蛋白的DomainⅡ區(qū)域在與受體結(jié)合中起著非常重要的作用[30]
Bt BJH500 Bt BJH498圖 3-1 光學(xué)顯微鏡下蘇云金芽胞桿菌的晶體形態(tài)Fig. 3-1 The crystal shape of Bt strains under a microcope3.2 標(biāo)準(zhǔn)菌株基因組提取對(duì)從海南地區(qū)篩選出的 755 株標(biāo)準(zhǔn)菌株進(jìn)行基因組的提取,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)如圖 3-2。從電泳結(jié)果圖中可以看出,提取的基因組質(zhì)量和濃度較高,將提取質(zhì)量高的基因組作為模板用于后續(xù) PCR 擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)。
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 張金波;李海濤;劉榮梅;束長(zhǎng)龍;高繼國(guó);;Bt菌株DQ89的sip基因的克隆、表達(dá)及殺蟲(chóng)活性分析[J];中國(guó)生物防治學(xué)報(bào);2015年04期
2 孟鑫睿;路楊;劉艷微;徐文靜;馮樹(shù)丹;張正坤;;蘇云金芽胞桿菌一新菌株的鑒定及其殺蟲(chóng)活性[J];植物保護(hù)學(xué)報(bào);2015年03期
3 陳桂花;束長(zhǎng)龍;李穎;宋福平;郭媛媛;李國(guó)勛;張杰;;基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-高通量測(cè)序(PCR-HTS)聯(lián)用的cry2A基因鑒定方法[J];中國(guó)生物防治學(xué)報(bào);2014年05期
4 關(guān)雄;蔡峻;;我國(guó)蘇云金桿菌研究60年[J];微生物學(xué)通報(bào);2014年03期
5 劉艷杰;李海濤;劉榮梅;高繼國(guó);;Bt新型基因sip的克隆、表達(dá)和生物信息學(xué)分析[J];生物技術(shù)通報(bào);2012年12期
6 王繼磊;劉迪秋;丁元明;葛鋒;李文嫻;田榮歡;;Bt轉(zhuǎn)基因抗蟲(chóng)植物研究進(jìn)展[J];生物學(xué)雜志;2010年04期
7 宋敏;林祥明;劉麗軍;;Cry基因家族的專(zhuān)利分布研究[J];生物技術(shù)通報(bào);2010年01期
8 賈春生;;利用SPSS軟件計(jì)算殺蟲(chóng)劑的LC_(50)[J];昆蟲(chóng)知識(shí);2006年03期
9 王和平,丁峰;生物農(nóng)藥Bt的科學(xué)使用[J];現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技;2005年11期
10 蔡啟良,劉子鐸,喻子牛;蘇云金芽胞桿菌生物活性成分研究進(jìn)展[J];應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào);2003年02期
本文編號(hào):2757422
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/2757422.html