小菜蛾肽聚糖識別蛋白PGRP-S2基因的克隆及其微生物結(jié)合功能分析
【學(xué)位授予單位】:福建師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S433.4
【圖文】:
蛋白質(zhì)為水溶性蛋白質(zhì)。逡逑用Protscale對PGRP-S2氨基酸序列的親疏水性進(jìn)行分析,正值表示疏水性,正逡逑值越高表明疏水性越強(qiáng);負(fù)值表示親水性,負(fù)值越低表明親水性越強(qiáng)。從圖1-5可逡逑以看出,該蛋白質(zhì)的多肽鏈在第113位的氨基酸具有最低值為-2.178,親水性最強(qiáng);逡逑多肽鏈在第7位跟第11位的氨基酸具有最高值為2.722,疏水性最強(qiáng)。從整體來看,逡逑整條肽鏈的大多數(shù)氨基酸為親水性的氨基酸且多于疏水性的氨基酸,表明PGRP-S2逡逑所編碼的蛋白質(zhì)為親水性蛋白質(zhì),該結(jié)果跟Protparam分析的結(jié)果一致。逡逑 ̄'邐Hphob.邋/邋Kyte邋S<邋Doolittle邋-逡逑2-5邋-fA逡逑2邋 ̄邋I邋I邐邐-逡逑"1:邋%邋'()邋y邋,邋I邋L邐■逡逑:::____霉逡逑-2邋-邐I逡逑_2邋5邐■邐i邐i邐1邐1邐I邐I邐I邐I逡逑20邐40邐60邐80邐100邐120邐140邐160邐180逡逑Position逡逑圖1-5邋PGRP-S2的親疏水性分析逡逑Table邋1-5邋Hydrophobicity邋of邋the邋predicted邋PGRP-S2逡逑21逡逑
福建師范大學(xué)吳程碩士學(xué)位論文3.3.2信號肽與跨膜結(jié)構(gòu)分析逡逑用SignalP4.1分析該蛋白是否存在信號肽(圖1-6),結(jié)果表明該蛋白存在一信號肽,其位置由起始位點(diǎn)開始至第21個(gè)氨基酸結(jié)束。用TMHMM預(yù)測該蛋白否存在跨膜結(jié)構(gòu)(圖1-7),結(jié)果表明該蛋白沒有典型的跨膜曲線,其并未從細(xì)跨越至細(xì)胞外,指示該蛋白不存在跨膜結(jié)構(gòu)。結(jié)合該蛋白含有信號肽,預(yù)測該為分泌蛋白,其發(fā)揮作用的機(jī)理是當(dāng)受到外界的感染時(shí),該蛋白由其信號肽指而分泌至細(xì)胞外與侵染物結(jié)合而發(fā)揮其作用。逡逑 ̄’0■邋score邐_邋邐:""逡逑?邐逡逑
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