【摘要】：紅樹(shù)林生態(tài)系統(tǒng)是全球排名第四的高服務(wù)價(jià)值生態(tài)系統(tǒng)。紅樹(shù)林所具有的,如吸附有害物質(zhì)等其他特殊能力,使之成為稀有微生物棲息地的極佳選擇,因此吸引了廣大科研人員的目光,以期能通過(guò)對(duì)紅樹(shù)林環(huán)境微生物的研究,得到紅樹(shù)林微生物多樣性與維持環(huán)境穩(wěn)態(tài)之間的關(guān)系,以及微生物的功能性等多方面的發(fā)現(xiàn)。本研究在福建省漳州市紫泥鎮(zhèn)富營(yíng)養(yǎng)條件下兩條河流間紅樹(shù)林等距離四個(gè)位點(diǎn)土壤進(jìn)行取樣,對(duì)其TN、TC、TS、TP、EC、Water content、pH在內(nèi)的理化性質(zhì)進(jìn)行檢測(cè),結(jié)合土壤微生物總量分析土壤情況與微生物間相互作用。通過(guò)純培養(yǎng)的方式,對(duì)土壤中可培養(yǎng)的細(xì)菌、放線(xiàn)菌進(jìn)行分離,探索其多樣性。通過(guò)宏基因組分類(lèi)學(xué)測(cè)定,對(duì)土壤中原核微生物與真核微生物的類(lèi)群及豐度進(jìn)行檢測(cè)。對(duì)比純培養(yǎng)及免培養(yǎng)兩種方法,綜合分析土壤微生物多樣性。利用宏基因組全基因組檢測(cè)法,對(duì)混合土樣的功能基因進(jìn)行分析。通過(guò)對(duì)四個(gè)土樣微生物進(jìn)行純培養(yǎng),獲得330株細(xì)菌,75株放線(xiàn)菌。經(jīng)16S rRNA鑒定,其中P1位點(diǎn)共分離細(xì)菌3個(gè)門(mén)6個(gè)屬,放線(xiàn)菌2個(gè)門(mén)5個(gè)屬;P2位點(diǎn)共分離細(xì)菌3個(gè)門(mén)7個(gè)屬,放線(xiàn)菌1個(gè)門(mén)3個(gè)屬;P3位點(diǎn)分離細(xì)菌3個(gè)門(mén)10個(gè)屬,放線(xiàn)菌1個(gè)門(mén)3個(gè)屬;P4位點(diǎn)分離細(xì)菌1個(gè)門(mén)3個(gè)屬,放線(xiàn)菌2個(gè)門(mén)3個(gè)屬。四個(gè)樣品中細(xì)菌共分離出5個(gè)門(mén)15個(gè)屬、放線(xiàn)菌共分離出2個(gè)門(mén)7個(gè)屬,細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌群為芽孢桿菌(Bacillus)(82.12%),土壤放線(xiàn)菌的優(yōu)勢(shì)菌群則為小單孢屬(Micromonospora)(72%)。使用菌種發(fā)酵液進(jìn)行抑菌試驗(yàn),篩選出18株放線(xiàn)菌存在抑菌活性,其中小單孢屬12株(66.67%),鏈霉菌屬4株(22.22%),馬杜拉屬2株(11.11%)。利用宏基因組分類(lèi)學(xué)檢測(cè),原核微生物分類(lèi)分析得:P1樣品中存在40個(gè)門(mén),67個(gè)綱,89個(gè)目,179個(gè)科,499個(gè)屬;P2樣品中存在38個(gè)門(mén),67個(gè)綱,88個(gè)目,168個(gè)科,491個(gè)屬;P3樣品中存在41個(gè)門(mén),71個(gè)綱,92個(gè)目,171個(gè)科,814個(gè)屬。P4樣品中存在39個(gè)門(mén),71個(gè)綱,96個(gè)目,183個(gè)科,482個(gè)屬。四個(gè)土樣中變形菌門(mén)(Proteobacteria)皆為優(yōu)勢(shì)門(mén)(50.26%-52.53%),脫硫化念球菌屬(Desulfomonile)皆為優(yōu)勢(shì)屬(3.46%-4.07%)。四個(gè)位點(diǎn)土壤樣品的原核微生物多樣性及豐富度基本相似。真核微生物分類(lèi)分析得:P1樣品中存在31個(gè)門(mén),45個(gè)綱,61個(gè)目,61個(gè)科,186個(gè)屬;P2樣品中存在32個(gè)門(mén),46個(gè)綱,56個(gè)目,69個(gè)科,177個(gè)屬;P3樣品中存在32個(gè)門(mén),43個(gè)綱,52個(gè)目,62個(gè)科,186個(gè)屬;P4樣品中存在34個(gè)門(mén),47個(gè)綱,54個(gè)目,5個(gè)科,163個(gè)屬。真核微生物均以頂復(fù)動(dòng)物亞門(mén)(Apicomplexa)為優(yōu)勢(shì)門(mén),馬拉色霉菌屬(Malassezia)(11.18%-39.84%)為優(yōu)勢(shì)屬。通過(guò)宏全基因組學(xué)全基因組分析,基因集蛋白序列于COG數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)將功能基因歸類(lèi)于能源產(chǎn)生和轉(zhuǎn)換(Energy production and conversion)等23項(xiàng)分類(lèi)�？股乜剐曰虮葘�(duì)中,將抗生素基因統(tǒng)計(jì)為49種,以大環(huán)內(nèi)酯物為最高值,其次為桿菌肽、枯草桿菌抗生素。通過(guò)碳水化合物活性酶比對(duì),分析其中活性酶類(lèi)的數(shù)量值,由高到低分別為糖苷水解酶糖類(lèi)酯解酶氧化還原酶碳水化合物結(jié)合結(jié)構(gòu)域多糖裂解酶。在GO數(shù)據(jù)庫(kù)中將基因歸納至分子功能(molecular function)、所處的細(xì)胞位置(cellular component)、參與的生物過(guò)程(biological process)三方面。通過(guò)SEED數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),將功能基因歸類(lèi)于碳水化合物(Carbohydrates)等28個(gè)具體分類(lèi)。
【圖文】：

實(shí)驗(yàn)技術(shù)路線(xiàn)

圖 2-1 采樣點(diǎn)衛(wèi)星地圖Fig.2-1 The satellite map of sample location用的試劑如表 2-2 所示：表 2-2 主要生化試劑及來(lái)源
【學(xué)位授予單位】：陜西理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類(lèi)號(hào)】：S714.3

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2701138