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版納微型豬近交系BARD1基因克

發(fā)布時(shí)間:2020-05-30 23:53
【摘要】:BARD1基因在精子形成過(guò)程中起重要作用。以Gen Bank下載的牛、鼠BARD1基因序列以及豬EST序列克隆豬BARD1基因,設(shè)計(jì)特異引物克隆版納微型豬近交系(BMI)BARD1基因。應(yīng)用q PCR分析15個(gè)重要組織的mRNA表達(dá)譜,并對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行功能生物信息學(xué)分析,構(gòu)建多物種系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。研究獲得了BMI BARD1 2 334 bp的編碼區(qū)序列(Gen Bank登錄號(hào)KU705640,對(duì)應(yīng)的氨基酸登錄號(hào)AOC89058),編碼777個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子量(Mw)為86.15 ku,等電點(diǎn)(p I)為8.84。多組織熒光定量表達(dá)分析表明:BARD1基因在睪丸和尿道球腺中高表達(dá),在肝臟、脾臟、肺、十二指腸、結(jié)腸中中度表達(dá),在心臟、腎臟、胃臟、腦、肌肉、精囊腺、前列腺、附睪中低表達(dá)。功能生物信息學(xué)分析表明,BARD1蛋白質(zhì)存在3個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,無(wú)跨膜結(jié)構(gòu),無(wú)信號(hào)肽序列;N末端疏水,C末端親水;有6類功能活性位點(diǎn),位于細(xì)胞核的概率是94.1%。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,BMI與牛、羊的親緣關(guān)系最近。

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