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FTO、IRX3基因遺傳變異對(duì)廣州市中小學(xué)生肥胖的影響

發(fā)布時(shí)間:2020-04-12 14:27
【摘要】:目的:探討廣州市中小學(xué)生肥胖的環(huán)境相關(guān)因素;識(shí)別FTO、IRX3基因遺傳變異及其基因-環(huán)境交互作用對(duì)兒童青少年肥胖的影響。研究方法:依托廣州市中小學(xué)生常規(guī)體檢工作,采用病例對(duì)照研究方法分析FTO、IRX3基因遺傳變異、環(huán)境因素與兒童青少年肥胖的關(guān)聯(lián)性。對(duì)39所中小學(xué)校二年級(jí)、初一、高一學(xué)生進(jìn)行篩查獲得超重肥胖、腹型肥胖病例,按性別、年齡、學(xué)校分層的頻數(shù)匹配原則納入對(duì)照。通過(guò)問(wèn)卷調(diào)查收集研究對(duì)象的一般人口學(xué)特征、飲食、運(yùn)動(dòng)及生活作息等信息;綜合生物信息學(xué)功能預(yù)測(cè)結(jié)果及既往文獻(xiàn)選擇FTO、IRX3基因潛在功能性遺傳變異;應(yīng)用TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR進(jìn)行基因型檢測(cè)。擬合優(yōu)度χ~2檢驗(yàn)評(píng)價(jià)遺傳變異基因型分布是否符合Hardy-Weinberg平衡;非條件Logistic回歸模型估計(jì)環(huán)境因素和單個(gè)遺傳變異對(duì)肥胖發(fā)生的影響;SKAT及SKAT-O方法挖掘低頻變異聯(lián)合效應(yīng),遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分法分析陽(yáng)性遺傳變異累積效應(yīng);分別采用Logistic回歸模型、非線性混合效應(yīng)模型法探索基因-環(huán)境相乘、相加交互作用。統(tǒng)計(jì)分析均使用SAS 9.4、R 3.2.5軟件完成。結(jié)果:(1)共納入2059例超重肥胖病例及2727例非超重肥胖對(duì)照。環(huán)境因素分析顯示工作日視屏?xí)r間≥2h/天(OR=1.29,95%CI=1.10~1.50)、食欲好(OR=1.48,95%CI=1.32~1.66)和飲用含糖飲料≥500ml/周(OR=1.19,95%CI=1.05~1.36)與超重肥胖呈正關(guān)聯(lián);睡眠時(shí)間≥8h/天(OR=0.77,95%CI=0.67~0.88)和進(jìn)餐速度≥10min/餐(OR=0.75,95%CI=0.62~0.90)與超重肥胖呈負(fù)關(guān)聯(lián)。FTOrs16952522、rs9939609與超重肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)存在統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)。校正性別、年級(jí)等因素后,加性模型下rs16952522、rs9939609每增加一個(gè)危險(xiǎn)等位基因,超重肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)均增加約33%。遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分結(jié)果顯示,1、2和≥3分者超重肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)逐漸升高(OR=1.33~1.62,P0.05)。未發(fā)現(xiàn)上述兩個(gè)遺傳變異與環(huán)境影響因素對(duì)超重肥胖存在交互作用。(2)共納入腹型肥胖病例1266人,非腹型肥胖對(duì)照1381人。工作日視屏?xí)r間≥2h/天(OR=1.38,95%CI=1.11~1.71)、食欲好(OR=1.68,95%CI=1.42~1.98)和飲用含糖飲料≥500ml/周(OR=1.27,95%CI=1.06~1.53)與腹型肥胖呈正關(guān)聯(lián);而中高等強(qiáng)度運(yùn)動(dòng)≥60min/天(OR=0.78,95%CI=0.61~0.99)與腹型肥胖呈負(fù)關(guān)聯(lián)。FTO rs16952522、rs9939609與腹型肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)存在統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)。校正性別、年級(jí)等因素后,加性模型下FTOrs16952522、rs9939609每增加一個(gè)危險(xiǎn)等位基因,腹型肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)分別增加1.39倍(OR=1.39,95%CI=1.15~1.67)和1.34倍(OR=1.34,95%CI=1.14~1.57)。與遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分0分者相比,2和≥3分者腹型肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)分別為1.35(1.09~1.67)和2.02(1.13~3.61)。交互作用分析發(fā)現(xiàn)遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分與食欲對(duì)腹型肥胖發(fā)生存在相加交互作用(P_(add)、P_(add-FDR)均0.05)。結(jié)論:視屏?xí)r間長(zhǎng)、食欲好、過(guò)量飲用含糖飲料為廣州市中小學(xué)生超重肥胖、腹型肥胖的危險(xiǎn)因素;睡眠充足、進(jìn)餐速度慢為超重肥胖的保護(hù)因素;中高等強(qiáng)度運(yùn)動(dòng)充足為腹型肥胖的保護(hù)因素。FTOrs16952522、rs9939609與兒童青少年超重肥胖、腹型肥胖均存在統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián),且與食欲存在交互作用可增加兒童青少年腹型肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。
【圖文】:

原理圖,探針,原理,孔板


圖 2-1 TaqMan MGB 探針原理基因分型實(shí)驗(yàn)步驟如下:(1)定制 TaqMan MGB 探針TaqMan MGB 探針由賽默飛世爾科技(中國(guó))有限公司生產(chǎn)。定制前首先登錄其官方網(wǎng)站(http://www.thermofisher.com/cn/zh/home.html)查詢(xún)所需探針是否已被用于定制;若尚無(wú),可通 NCBI 檢索遺傳變異上下游 50bpd 的片段序列進(jìn)行探針合成。(2)稀釋 DNA 模板根據(jù) DNA 提取后測(cè)得的濃度,用雙蒸水稀釋 DNA 模板至 10-20ng/μl,,并轉(zhuǎn)存至96 孔板中,-80℃條件下儲(chǔ)存?zhèn)溆。?)配置 Real-Time PCR 反應(yīng)體系本研究 Real-Time PCR 反應(yīng)體系為 5μl/孔,包括 TaqMan Assays 工作液、MasterMix、DNA 模板。考慮到損耗問(wèn)題,每塊 384 孔板多配置出 15%的反應(yīng)體系。具體配置比例見(jiàn)表 2-2,配成混合液后,輕搖混勻,1000rpm 離心 30s。(4)加樣 384 孔板

遺傳變異,基因,單體型,連鎖不平衡


廣東藥科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文連鎖不平衡及單體型分析Haploview 軟件計(jì)算 FTO、IRX3 基因內(nèi)各遺傳變異之間的連鎖不示,F(xiàn)TOrs16952522 與 rs9939609 呈中等連鎖不平衡,r2=0.729極弱或無(wú)連鎖不平衡,r2<0.005。采用 Phase 2 構(gòu)建單體型,非條算各單體型 OR 值及其 95%CI,結(jié)果如表 3-8 所示。相對(duì)于 C上的 CAA( OR=1.36, 95%CI=1.11~1.68 )和 GAA 單體型9~1.54)可增加超重肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。IRX3 基因上的各單體型未險(xiǎn)存在統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)。
【學(xué)位授予單位】:廣東藥科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類(lèi)號(hào)】:R723.14

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本文編號(hào):2624823


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