用不同方法探討基因與基因、環(huán)境因素的交互作用對高尿酸血癥的影響
發(fā)布時間:2020-04-12 01:06
【摘要】:目的用logistic回歸、MDR和叉生分析探討基因與基因、環(huán)境因素的交互作用對高尿酸血癥的影響,為深入研究高尿酸血癥的治病原因奠定早期基礎(chǔ);同時為寧夏地區(qū)不同民族間高尿酸血癥的群體遺傳學(xué)研究提供理論依據(jù),從而對高尿酸血癥群體采取更加科學(xué)合理的防治。方法1.研究對象:選擇寧夏回族自治區(qū)銀川市某健康體檢機構(gòu)2014年5月-10月期間進行身體檢查的人群,依據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn)最終有362名無血緣關(guān)系的高尿酸血癥患者被列為病例組,采用1∶1匹配的病例對照研究,依照年齡(相差≤5歲)、性別及民族,同時選擇該機構(gòu)同一時段內(nèi)無血緣關(guān)系且背景資料相近的362名健康人群為對照組。人口學(xué)特征:病例組男性為229(63.3%),女性為133(36.7%),回族194(53.6%),漢族168(46.4%),年齡區(qū)間為29~80歲之間,平均年齡56.71±9.39歲;對照組年齡區(qū)間在28~81歲,平均年齡56.68±9.46歲。2.研究方法:培訓(xùn)達標(biāo)的調(diào)查員以調(diào)查問卷、體格檢查及實驗室生化指標(biāo)的檢測收集研究對象的基本資料、用藥情況及其他相關(guān)資料。體格檢查指標(biāo)為身高、血壓、體重等;實驗室生化檢測及DNA提取通過靜脈血的采集來實現(xiàn),檢測指標(biāo)包括(SUA、Crea、TC、TG、BUN、HDL及LDL)等。采用Sequenom Mass ARRAY iPLEX GOLD技術(shù)分別檢測兩組SLC2A9-rs6811287、rs7663032和SLC22A12-rs559946和LRRC16A-rs742132單核苷酸位點的多態(tài)性。基因型頻率分布是否具有群體遺傳代表性采用Hardy-Weinberg平衡定律進行檢驗,配對t檢驗用于對不同組生化指標(biāo)均值間的比較,卡方檢驗用于比較不同組基因型及等位基因的分布,多元logistic回歸用于探討高尿酸血癥的影響因素;SLC2A9基因rs6811287位點、rs7663032位點和SLC22A12基因rs559946位點和LRRC16A基因rs742132位點間基因的交互效應(yīng)采用MDR軟件、叉生分析及條件Logistic回歸進行研究。結(jié)果1.兩組間生化指標(biāo)的比較對照組的甘油三酯(TG)、肌酐(Crea)、收縮壓(SBP)、總膽固醇(TC)和體質(zhì)指數(shù)(BMI)較病例組低,兩組間差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(p0.05);尿素氮(BUN)、血糖(FBG)、HDL、LDL、舒張壓(DBP)在兩組間差異無統(tǒng)計學(xué)意義(p0.05)。2.兩組基因型頻率的比較SLC22A12基因rs559946位點、SLC2A9基因rs6811287和rs7663032位點、LRRC16A基因rs742132位點的基因型頻數(shù)分布在兩組間的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(p0.05)。3.在病例組中,LRRC16A的rs742132的基因型和等位基因分布在不同性別之間存在統(tǒng)計學(xué)意義,均P0.05。在病例組或?qū)φ战M,其余SLC22A12、SLC2A9及LRRC16A基因的各SNP位點在不同民族和性別間,基因型及等位基因的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(p0.05)。4.多元logistic回歸分析結(jié)果表明:Crea(肌酐)、TC(總膽固醇)和BMI(體質(zhì)指數(shù))為高尿酸血癥的發(fā)病的危險因素(p0.05)。5.交互效應(yīng)基于多因子降維法(MDR)發(fā)現(xiàn)3因子模型(SLC22A12-rs559946,LRRC16A-rs742132和甘油三酯)具有更高的交叉驗證一致性和檢驗平衡準(zhǔn)確度,為最佳模型。由于三位點模型的檢驗平衡準(zhǔn)確度為0.5912,p=0.1071,差異無統(tǒng)計學(xué)意義,提示rs559946,rs742132和甘油三酯之間不存在交互作用;跅l件logistic回歸發(fā)現(xiàn)SLC2A9位點rs6811287能增加高尿酸血癥的發(fā)病風(fēng)險,SLC22A12-rs559946和LRRC16A-rs742132之間存在相乘的交互作用;通過叉生分析,進行模型的統(tǒng)計學(xué)檢驗后基于相加模型,發(fā)現(xiàn)LRRC16A-rs742132位點與甘油三酯間交互作用有統(tǒng)計學(xué)意義(U=2.146,p0.05);基于相乘模型表明SLC22A12-rs559946和LRRC16A-rs742132之間存在相乘的正交互作用(Orint=1.287,P0.05)。結(jié)論1.在高尿酸血癥組,LRRC16A基因rs742132位點的基因頻數(shù)和等位基因在男女性別間差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。2.TC(甘油三酯)、Crea(肌酐)和BMI(體質(zhì)指數(shù))為高尿酸血癥可能的危險因素。3.交互作用表明:SLC2A9-rs6811287是高尿酸血癥可能的危險因素,SLC22A12-rs559946和LRRC16A-rs742132之間存在相乘的正交互作用;LRRC16A-rs742132與甘油三酯間存在相加的正交互作用。
【圖文】:
圖2 MDR 分析所得位點之間的交互作用樹狀圖2.6.2 應(yīng)用條件邏輯回歸探討各因素的交互效應(yīng)應(yīng)用logistic回歸對基因與環(huán)境的交互效應(yīng)進行探討,結(jié)果表明:SLC2A9基因rs6811287是高尿酸血癥可能的危險因素(OR=8.778,95% CI:1.151-66.919);SLC22A12-rs559946和LRRC16A-rs742132位點之間存在交互作用。(OR=7.085,95%1.135-44.243)。其他位點之間以及位點與環(huán)境因素之間均未發(fā)現(xiàn)交互作用(p>0結(jié)果見表14。表14 用logistic回歸探討基因-基因以及基因-環(huán)境因素的交互效應(yīng)因素 B SE Walds P OR(95% CI)rs559946 -1.035 1.002 1.067 0.302 0.355(0.050-2.53rs6811287 2.172 1.036 4.393 0.036 8.778(1.151-66.9rs7663032 -1.185 1.102 1.157 0.282 0.306(0.035-2.65rs742132 -2.015 1.081 3.477 0.062 0.133(0.016-1.10肌酐 0.725 1.926 0.142 0.707 2.064(0.047-89.9甘油三酯 -0.749 1.041 0.518 0.472 0.473(0.061-3.63
寧夏醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文 結(jié)果23圖1 最佳模型的環(huán)狀圖圖2為交互作用樹狀圖,結(jié)果顯示,rs742132位點和甘油三酯距離較近,它們之間的作用較強且為協(xié)同作用,但此圖只有在最佳模型成立時才有意義。圖2 MDR 分析所得位點之間的交互作用樹狀圖2.6.2 應(yīng)用條件邏輯回歸探討各因素的交互效應(yīng)應(yīng)用logistic回歸對基因與環(huán)境的交互效應(yīng)進行探討,結(jié)果表明:SLC2A9基因rs6811287是高尿酸血癥可能的危險因素(OR=8.778,95% CI:1.151-66.919);SLC22A12-rs559946和LRRC16A-rs742132位點之間存在交互作用。(OR=7.085,95% CI:1.135-44.243)。其他位點之間以及位點與環(huán)境因素之間均未發(fā)現(xiàn)交互作用(p>0.05),,結(jié)果見表14。表14 用logistic回歸探討基因-基?
【學(xué)位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R589.7
【圖文】:
圖2 MDR 分析所得位點之間的交互作用樹狀圖2.6.2 應(yīng)用條件邏輯回歸探討各因素的交互效應(yīng)應(yīng)用logistic回歸對基因與環(huán)境的交互效應(yīng)進行探討,結(jié)果表明:SLC2A9基因rs6811287是高尿酸血癥可能的危險因素(OR=8.778,95% CI:1.151-66.919);SLC22A12-rs559946和LRRC16A-rs742132位點之間存在交互作用。(OR=7.085,95%1.135-44.243)。其他位點之間以及位點與環(huán)境因素之間均未發(fā)現(xiàn)交互作用(p>0結(jié)果見表14。表14 用logistic回歸探討基因-基因以及基因-環(huán)境因素的交互效應(yīng)因素 B SE Walds P OR(95% CI)rs559946 -1.035 1.002 1.067 0.302 0.355(0.050-2.53rs6811287 2.172 1.036 4.393 0.036 8.778(1.151-66.9rs7663032 -1.185 1.102 1.157 0.282 0.306(0.035-2.65rs742132 -2.015 1.081 3.477 0.062 0.133(0.016-1.10肌酐 0.725 1.926 0.142 0.707 2.064(0.047-89.9甘油三酯 -0.749 1.041 0.518 0.472 0.473(0.061-3.63
寧夏醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文 結(jié)果23圖1 最佳模型的環(huán)狀圖圖2為交互作用樹狀圖,結(jié)果顯示,rs742132位點和甘油三酯距離較近,它們之間的作用較強且為協(xié)同作用,但此圖只有在最佳模型成立時才有意義。圖2 MDR 分析所得位點之間的交互作用樹狀圖2.6.2 應(yīng)用條件邏輯回歸探討各因素的交互效應(yīng)應(yīng)用logistic回歸對基因與環(huán)境的交互效應(yīng)進行探討,結(jié)果表明:SLC2A9基因rs6811287是高尿酸血癥可能的危險因素(OR=8.778,95% CI:1.151-66.919);SLC22A12-rs559946和LRRC16A-rs742132位點之間存在交互作用。(OR=7.085,95% CI:1.135-44.243)。其他位點之間以及位點與環(huán)境因素之間均未發(fā)現(xiàn)交互作用(p>0.05),,結(jié)果見表14。表14 用logistic回歸探討基因-基?
【學(xué)位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R589.7
【參考文獻】
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本文編號:2624075
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