【摘要】：角鱉(Apalone Spinifera)別名刺鱉,分布于北美洲中部地區(qū),多生活于池塘、湖泊、沼澤等淡水水域。角鱉作為一種極具經(jīng)濟價值的淡水養(yǎng)殖動物,養(yǎng)殖前景看好,市場開發(fā)潛力較大。我國近年雖已開始引進試養(yǎng),但由于其繁殖力不高,苗種較貴,且性別導(dǎo)致的生長速度差異很大,一直未能形成養(yǎng)殖規(guī)模,制約了角鱉養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展。為了探索角鱉生長發(fā)育的相關(guān)分子機制,本研究采用高通量轉(zhuǎn)錄組測序方法,對角鱉肝臟的轉(zhuǎn)錄組信息及其生長相關(guān)基因進行了研究。結(jié)果表明:試驗以生長存在顯著差異的兩組角鱉肝臟為材料,采用Illumina HiSeq~(TM) 2500高通量測序平臺進行轉(zhuǎn)錄組分析,經(jīng)過拼接組裝共獲得264 757 372條Clean reads,148 093個Unigene,序列平均長度為900.8 bp。將Unigene與NR、SWISSPROT、KOG、KEGG和GO進行比對,共有34 666條得到了注釋結(jié)果。對獲得的Unigene進行GO功能注釋,共得到了20 973條Unigene的GO注釋信息,涉及三大類中64個功能小類。對獲得Unigene進行KEGG代謝通路分析,在角鱉肝臟轉(zhuǎn)錄組中,共有11 197條unigene比對到364條Pathway中。通過以生長速度快的雌性個體為對照組FM,生長速度慢的雄性個體為實驗組M進行基因表達情況對比,結(jié)果顯示有2 246個基因表達存在差異,其中顯著性上調(diào)的基因1264個,顯著性下調(diào)的基因982個。對篩選的差異基因進行GO富集,結(jié)果顯示共有1264個差異表達基因被注釋到2122條GO term中,且這些差異共被注釋到272條代謝通路中,通過利用qRT-PCR技術(shù)對篩選到的部分生長發(fā)育基因進行轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果驗證,結(jié)果顯示BIRC6、GADD45、GZMB、IGF1、ITPR3、MCM3、MCM5和PERP八個基因下調(diào)表達,MAPK1、PI3KR2、SSTR2和YWHAG_H下調(diào)表達,并且變化趨勢與轉(zhuǎn)錄組測序分析結(jié)果一致。
【學(xué)位授予單位】：湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：S917.4

【參考文獻】

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1 馬細蘭;張勇;陳勇智;周立斌;;性類固醇激素E_2、MT對尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)雌、雄生長差異的影響[J];海洋與湖沼;2015年06期

2 王忠良;丁q，

本文編號：2590748