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高通量測(cè)序時(shí)代下持家基因定義的發(fā)展

發(fā)布時(shí)間:2020-03-17 13:06
【摘要】:持家基因一般指在所有細(xì)胞中均穩(wěn)定表達(dá)的一類(lèi)組成型基因,其產(chǎn)物是維持細(xì)胞基本生命活動(dòng)所必需的。持家基因的定義及其發(fā)展,反映了其本質(zhì)和時(shí)代特征。本文從基因表達(dá)水平量化技術(shù)的角度,結(jié)合作者利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)豬持家基因的分析,討論了持家基因的定義及其發(fā)展,尤其是技術(shù)的進(jìn)步及數(shù)據(jù)量的劇增對(duì)持家基因的定義所引發(fā)的問(wèn)題。本文總結(jié)發(fā)現(xiàn),應(yīng)該在研究技術(shù)的進(jìn)步中,動(dòng)態(tài)地認(rèn)識(shí)持家基因定義所具有的層次性,從而對(duì)持家基因的定義不斷賦予新的時(shí)代特征。
【圖文】:

廣泛性,基因表達(dá)


基可以提供單堿定義過(guò)程中,變異[56,57],從第三,轉(zhuǎn)錄組使其能夠準(zhǔn)確測(cè)序具有較好可檢測(cè)性。不定量表達(dá)值不些特點(diǎn),利用提高了基因的序時(shí)代下持家基組出家除計(jì)eder對(duì)標(biāo)基,因況表基一平篩達(dá)的的家基堿從組確好不不用的可檢測(cè)且可利持家基定義的2.4.3為本文從format獲取了(肌肉、小腦、網(wǎng)膜、淋巴);,并下4個(gè)個(gè)組織本在不本在所小于4持家基在21遠(yuǎn)多于數(shù)據(jù)定為平的定的表達(dá)組織。圖2Fig.2基因定義的發(fā)展測(cè)性,也可準(zhǔn)利用不同的操基因,進(jìn)而進(jìn)的可靠性。以豬轉(zhuǎn)錄組家基因的優(yōu)為了探索RN從NCBI(Natiotion)的SRA(了15個(gè)實(shí)驗(yàn)用、心、肝、脾枕葉皮層、腸系膜、子。利用FPKM并對(duì)基因表達(dá)個(gè)標(biāo)準(zhǔn)定義持織中均表達(dá);不同組織中的所有樣本中的,進(jìn)一步針基因的所有轉(zhuǎn)個(gè)組織中,microarrays定義持家基因?yàn)楸苊馍鲜龆喽,選取單一達(dá)穩(wěn)定性。該利用K-S一致豬基因表達(dá)廣Thebreadth展準(zhǔn)確的評(píng)估基操作單元(轉(zhuǎn)錄進(jìn)行相互驗(yàn)證組數(shù)據(jù)為例,優(yōu)勢(shì)NA-seq數(shù)據(jù)定onalCenterSequenceRe用的21種豬脾、肺、腎、子宮內(nèi)膜、子宮、卵巢、M方法對(duì)RN達(dá)的廣泛性進(jìn)行持家基因:((2)通過(guò)K-S的表達(dá)水平穩(wěn)的任一表達(dá)值針對(duì)表達(dá)穩(wěn)定轉(zhuǎn)錄本都必須6072(約20%s數(shù)據(jù)檢測(cè)量因具有較大檢多個(gè)實(shí)驗(yàn)間的一實(shí)驗(yàn)(PRJE實(shí)驗(yàn)共有10致性檢驗(yàn)評(píng)估廣泛性分布distributionof基因表達(dá)的穩(wěn)錄本和外顯子證,加強(qiáng)了對(duì)探索RNA-s定義持家基因forBiotechneadAchieve)豬組織的RNA、下丘腦、額性腺、皮下睪丸、胎盤(pán)NA-seq數(shù)據(jù)行檢測(cè)(圖2)

廣泛性,基因表達(dá)


基可以提供單堿定義過(guò)程中,變異[56,57],從第三,轉(zhuǎn)錄組使其能夠準(zhǔn)確測(cè)序具有較好可檢測(cè)性。不定量表達(dá)值不些特點(diǎn),利用提高了基因的序時(shí)代下持家基組出家除計(jì)eder對(duì)標(biāo)基,因況表基一平篩達(dá)的的家基堿從組確好不不用的可檢測(cè)且可利持家基定義的2.4.3為本文從format獲取了(肌肉、小腦、網(wǎng)膜、淋巴);,并下4個(gè)個(gè)組織本在不本在所小于4持家基在21遠(yuǎn)多于數(shù)據(jù)定為平的定的表達(dá)組織。圖2Fig.2基因定義的發(fā)展測(cè)性,,也可準(zhǔn)利用不同的操基因,進(jìn)而進(jìn)的可靠性。以豬轉(zhuǎn)錄組家基因的優(yōu)為了探索RN從NCBI(Natiotion)的SRA(了15個(gè)實(shí)驗(yàn)用、心、肝、脾枕葉皮層、腸系膜、子。利用FPKM并對(duì)基因表達(dá)個(gè)標(biāo)準(zhǔn)定義持織中均表達(dá);不同組織中的所有樣本中的,進(jìn)一步針基因的所有轉(zhuǎn)個(gè)組織中,microarrays定義持家基因?yàn)楸苊馍鲜龆喽,選取單一達(dá)穩(wěn)定性。該利用K-S一致豬基因表達(dá)廣Thebreadth展準(zhǔn)確的評(píng)估基操作單元(轉(zhuǎn)錄進(jìn)行相互驗(yàn)證組數(shù)據(jù)為例,優(yōu)勢(shì)NA-seq數(shù)據(jù)定onalCenterSequenceRe用的21種豬脾、肺、腎、子宮內(nèi)膜、子宮、卵巢、M方法對(duì)RN達(dá)的廣泛性進(jìn)行持家基因:((2)通過(guò)K-S的表達(dá)水平穩(wěn)的任一表達(dá)值針對(duì)表達(dá)穩(wěn)定轉(zhuǎn)錄本都必須6072(約20%s數(shù)據(jù)檢測(cè)量因具有較大檢多個(gè)實(shí)驗(yàn)間的一實(shí)驗(yàn)(PRJE實(shí)驗(yàn)共有10致性檢驗(yàn)評(píng)估廣泛性分布distributionof基因表達(dá)的穩(wěn)錄本和外顯子證,加強(qiáng)了對(duì)探索RNA-s定義持家基因forBiotechneadAchieve)豬組織的RNA、下丘腦、額性腺、皮下睪丸、胎盤(pán)NA-seq數(shù)據(jù)行檢測(cè)(圖2)

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 ;The Transcript-centric Mutations in Human Genomes[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2012年01期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前5條

1 魏凱;馬磊;;高通量測(cè)序時(shí)代下持家基因定義的發(fā)展[J];遺傳;2017年02期

2 Jun Yu;;Precision Medicine: What Do We Expect in the Scope of Basic Biomedical Sciences?[J];Genomics,Proteomics & Bioinformatics;2016年01期

3 ;The Pendulum Model for Genome Compositional Dynamics:from the Four Nucleotides to the Twenty Amino Acids[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2012年04期

4 ;Life on Two Tracks[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2012年03期

5 ;Challenges to the Common Dogma[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2012年02期

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 朱芷葳;董常生;;持家基因作為相對(duì)定量?jī)?nèi)標(biāo)物的穩(wěn)定性比較[J];生物技術(shù)通訊;2006年05期

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條

1 陳中旭;主要作物持家基因及小麥種子特異基因挖掘[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年



本文編號(hào):2587526

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