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高通量測序時代下持家基因定義的發(fā)展

發(fā)布時間:2020-03-17 13:06
【摘要】:持家基因一般指在所有細胞中均穩(wěn)定表達的一類組成型基因,其產(chǎn)物是維持細胞基本生命活動所必需的。持家基因的定義及其發(fā)展,反映了其本質和時代特征。本文從基因表達水平量化技術的角度,結合作者利用轉錄組數(shù)據(jù)對豬持家基因的分析,討論了持家基因的定義及其發(fā)展,尤其是技術的進步及數(shù)據(jù)量的劇增對持家基因的定義所引發(fā)的問題。本文總結發(fā)現(xiàn),應該在研究技術的進步中,動態(tài)地認識持家基因定義所具有的層次性,從而對持家基因的定義不斷賦予新的時代特征。
【圖文】:

廣泛性,基因表達


基可以提供單堿定義過程中,變異[56,57],從第三,轉錄組使其能夠準確測序具有較好可檢測性。不定量表達值不些特點,利用提高了基因的序時代下持家基組出家除計eder對標基,因況表基一平篩達的的家基堿從組確好不不用的可檢測且可利持家基定義的2.4.3為本文從format獲取了(肌肉、小腦、網(wǎng)膜、淋巴)。化,并下4個個組織本在不本在所小于4持家基在21遠多于數(shù)據(jù)定為平的定的表達組織。圖2Fig.2基因定義的發(fā)展測性,也可準利用不同的操基因,進而進的可靠性。以豬轉錄組家基因的優(yōu)為了探索RN從NCBI(Natiotion)的SRA(了15個實驗用、心、肝、脾枕葉皮層、腸系膜、子。利用FPKM并對基因表達個標準定義持織中均表達;不同組織中的所有樣本中的,進一步針基因的所有轉個組織中,microarrays定義持家基因為避免上述多定量,選取單一達穩(wěn)定性。該利用K-S一致豬基因表達廣Thebreadth展準確的評估基操作單元(轉錄進行相互驗證組數(shù)據(jù)為例,優(yōu)勢NA-seq數(shù)據(jù)定onalCenterSequenceRe用的21種豬脾、肺、腎、子宮內膜、子宮、卵巢、M方法對RN達的廣泛性進行持家基因:((2)通過K-S的表達水平穩(wěn)的任一表達值針對表達穩(wěn)定轉錄本都必須6072(約20%s數(shù)據(jù)檢測量因具有較大檢多個實驗間的一實驗(PRJE實驗共有10致性檢驗評估廣泛性分布distributionof基因表達的穩(wěn)錄本和外顯子證,加強了對探索RNA-s定義持家基因forBiotechneadAchieve)豬組織的RNA、下丘腦、額性腺、皮下睪丸、胎盤NA-seq數(shù)據(jù)行檢測(圖2)

廣泛性,基因表達


基可以提供單堿定義過程中,變異[56,57],從第三,轉錄組使其能夠準確測序具有較好可檢測性。不定量表達值不些特點,利用提高了基因的序時代下持家基組出家除計eder對標基,因況表基一平篩達的的家基堿從組確好不不用的可檢測且可利持家基定義的2.4.3為本文從format獲取了(肌肉、小腦、網(wǎng)膜、淋巴);,并下4個個組織本在不本在所小于4持家基在21遠多于數(shù)據(jù)定為平的定的表達組織。圖2Fig.2基因定義的發(fā)展測性,,也可準利用不同的操基因,進而進的可靠性。以豬轉錄組家基因的優(yōu)為了探索RN從NCBI(Natiotion)的SRA(了15個實驗用、心、肝、脾枕葉皮層、腸系膜、子。利用FPKM并對基因表達個標準定義持織中均表達;不同組織中的所有樣本中的,進一步針基因的所有轉個組織中,microarrays定義持家基因為避免上述多定量,選取單一達穩(wěn)定性。該利用K-S一致豬基因表達廣Thebreadth展準確的評估基操作單元(轉錄進行相互驗證組數(shù)據(jù)為例,優(yōu)勢NA-seq數(shù)據(jù)定onalCenterSequenceRe用的21種豬脾、肺、腎、子宮內膜、子宮、卵巢、M方法對RN達的廣泛性進行持家基因:((2)通過K-S的表達水平穩(wěn)的任一表達值針對表達穩(wěn)定轉錄本都必須6072(約20%s數(shù)據(jù)檢測量因具有較大檢多個實驗間的一實驗(PRJE實驗共有10致性檢驗評估廣泛性分布distributionof基因表達的穩(wěn)錄本和外顯子證,加強了對探索RNA-s定義持家基因forBiotechneadAchieve)豬組織的RNA、下丘腦、額性腺、皮下睪丸、胎盤NA-seq數(shù)據(jù)行檢測(圖2)

【參考文獻】

相關期刊論文 前1條

1 ;The Transcript-centric Mutations in Human Genomes[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2012年01期

【共引文獻】

相關期刊論文 前5條

1 魏凱;馬磊;;高通量測序時代下持家基因定義的發(fā)展[J];遺傳;2017年02期

2 Jun Yu;;Precision Medicine: What Do We Expect in the Scope of Basic Biomedical Sciences?[J];Genomics,Proteomics & Bioinformatics;2016年01期

3 ;The Pendulum Model for Genome Compositional Dynamics:from the Four Nucleotides to the Twenty Amino Acids[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2012年04期

4 ;Life on Two Tracks[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2012年03期

5 ;Challenges to the Common Dogma[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2012年02期

【相似文獻】

相關期刊論文 前1條

1 朱芷葳;董常生;;持家基因作為相對定量內標物的穩(wěn)定性比較[J];生物技術通訊;2006年05期

相關碩士學位論文 前1條

1 陳中旭;主要作物持家基因及小麥種子特異基因挖掘[D];四川農(nóng)業(yè)大學;2015年



本文編號:2587526

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