煙草NtNHX1-1基因特征分析
發(fā)布時(shí)間:2020-03-14 11:15
【摘要】:煙草是中國重要的經(jīng)濟(jì)作物之一。鹽脅迫對煙草生產(chǎn)造成巨大危害,克隆鹽脅迫響應(yīng)基因,為從分子水平抵御鹽脅迫提供基因資源。本研究克隆了Na+/H+反向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因。該基因編碼的蛋白為膜蛋白,具有12個(gè)跨膜區(qū)。進(jìn)化分析表明,Nt NHX1-1與番茄的Sl-NHX1遺傳距離最近,相似性為95%,其次為甜辣椒的Ca-NHX2,相似性為94%。組織特性表達(dá)分析表明,NtNHX1-1基因在莖中表達(dá)最高、其次為葉、花和根。NaCl處理后NtNHX1-1基因的表達(dá)明顯上調(diào),表明該基因可能在煙草抵抗鹽脅迫中發(fā)揮重要功能。通過調(diào)控NtNHX1-1基因的表達(dá)有望獲得耐鹽脅迫煙草新品系。
【圖文】:
Bassiletal.,2011)等生理過程中發(fā)揮重要功能。煙草是中國重要的經(jīng)濟(jì)作物之一,中國鹽漬化土壤日益加重,培育耐鹽漬化煙草品種可以增加煙草種植面積。同時(shí),提高鉀含量可以提高煙葉品質(zhì)。所以克隆煙草NHX1基因并研究其功能,對煙葉生產(chǎn)意義重大。1結(jié)果與分析1.1煙草NtNHX1-1基因克隆通過NCBI數(shù)據(jù)庫比對、ORF分析獲得煙草NtNHX1-1基因序列信息。通過PCR擴(kuò)增獲得1600bp左右一個(gè)片段(圖1),回收后測序,結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫中的序列100%一致。NtNHX1-1基因全長CDS和推測的氨基酸序列(圖2)。1.2NtNHX1-1蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及進(jìn)化分析利用在線工具預(yù)測NtNHX1-1蛋白的理論等電點(diǎn)為6.86,分子量為58.90kD。WolfpSORT預(yù)測NtNHX1-1為膜蛋白,TMpred分析NtNHX1-1具有12個(gè)跨膜區(qū),與擬南芥AtNHX1-1一致。SignalP4.1預(yù)測NtNHX1-1沒有信號肽。二級結(jié)構(gòu)預(yù)測NtNHX1-1主要含有ɑ螺旋,,占34.89%,其次是β折疊和無規(guī)則卷曲,分別占28.17%和26.87%,β轉(zhuǎn)角占10.07%。將NtNHX1-1與擬南芥AtNHX1蛋白序列進(jìn)行比對,序列比對結(jié)果顯示在12個(gè)跨膜區(qū)NtNHX1-1與AtNHX高度同源(圖3),與TMpred預(yù)測結(jié)果一致。將煙草NtNHX1-1與番茄(Sl-NHX1:NP_00123-3885.2)、甜辣椒(Ca-NHX2:XP_016553152.1),棗(Zj-NHX2:XP_015875303.1)、冰菜(Mc-NHX1:CAN995-89.1)、木豆(Cc-NHX1:KYP74415.1)、番杏(Tt-NHX1:AAQ08988.1)、大豆(Gm-NHX1:AAY43006.1)、綠豆(Vr-NHX2:NP_001304257.1)、葡萄(Vv-NHX1:XP_010649604.1)、花生(Ai-NHX1:XP_016175144.1)、胡楊(Pe-NHX1:XP_011032540.1)、苜蓿(Mt-NHX1:XP_013469021.1;Ms-NHX1:AAR19085.1)、蓖麻(Rc-NH-X1:NP_001310702.1)、川桑(Mn
本文編號:2586974
【圖文】:
Bassiletal.,2011)等生理過程中發(fā)揮重要功能。煙草是中國重要的經(jīng)濟(jì)作物之一,中國鹽漬化土壤日益加重,培育耐鹽漬化煙草品種可以增加煙草種植面積。同時(shí),提高鉀含量可以提高煙葉品質(zhì)。所以克隆煙草NHX1基因并研究其功能,對煙葉生產(chǎn)意義重大。1結(jié)果與分析1.1煙草NtNHX1-1基因克隆通過NCBI數(shù)據(jù)庫比對、ORF分析獲得煙草NtNHX1-1基因序列信息。通過PCR擴(kuò)增獲得1600bp左右一個(gè)片段(圖1),回收后測序,結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫中的序列100%一致。NtNHX1-1基因全長CDS和推測的氨基酸序列(圖2)。1.2NtNHX1-1蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及進(jìn)化分析利用在線工具預(yù)測NtNHX1-1蛋白的理論等電點(diǎn)為6.86,分子量為58.90kD。WolfpSORT預(yù)測NtNHX1-1為膜蛋白,TMpred分析NtNHX1-1具有12個(gè)跨膜區(qū),與擬南芥AtNHX1-1一致。SignalP4.1預(yù)測NtNHX1-1沒有信號肽。二級結(jié)構(gòu)預(yù)測NtNHX1-1主要含有ɑ螺旋,,占34.89%,其次是β折疊和無規(guī)則卷曲,分別占28.17%和26.87%,β轉(zhuǎn)角占10.07%。將NtNHX1-1與擬南芥AtNHX1蛋白序列進(jìn)行比對,序列比對結(jié)果顯示在12個(gè)跨膜區(qū)NtNHX1-1與AtNHX高度同源(圖3),與TMpred預(yù)測結(jié)果一致。將煙草NtNHX1-1與番茄(Sl-NHX1:NP_00123-3885.2)、甜辣椒(Ca-NHX2:XP_016553152.1),棗(Zj-NHX2:XP_015875303.1)、冰菜(Mc-NHX1:CAN995-89.1)、木豆(Cc-NHX1:KYP74415.1)、番杏(Tt-NHX1:AAQ08988.1)、大豆(Gm-NHX1:AAY43006.1)、綠豆(Vr-NHX2:NP_001304257.1)、葡萄(Vv-NHX1:XP_010649604.1)、花生(Ai-NHX1:XP_016175144.1)、胡楊(Pe-NHX1:XP_011032540.1)、苜蓿(Mt-NHX1:XP_013469021.1;Ms-NHX1:AAR19085.1)、蓖麻(Rc-NH-X1:NP_001310702.1)、川桑(Mn
本文編號:2586974
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