楊梅果糖激酶基因MrFRK2的克隆及在成熟期果實(shí)中的表達(dá)分析
【圖文】:
ACE技術(shù)獲得了長(zhǎng)度約為1060bp和160bp的5′和3′端序列(圖1,B、C),將這2條序列與中間片段序列進(jìn)行拼接,獲得基因全長(zhǎng)cDNA序列,共1279bp。MrFRK2全長(zhǎng)cDNA序列包含1個(gè)ATG起始密碼子和TAG終止密碼子,其中3′端非編碼區(qū)227bp,5′端非編碼區(qū)56bp。ORF閱讀框全長(zhǎng)996bp,編碼1個(gè)含有332個(gè)氨基酸殘基的蛋白,預(yù)測(cè)的等電點(diǎn)(pI)為4.80,預(yù)測(cè)分子量為35.67kD。根據(jù)獲得的基因全長(zhǎng)cDNA序列設(shè)計(jì)全長(zhǎng)特異引物fFRK2F和fFRK2R進(jìn)行RT-PCR,得到1條長(zhǎng)1268bp(圖1,D)的片段,并通過(guò)測(cè)序驗(yàn)證與軟件拼接獲得的MrFRK2全長(zhǎng)cDNA序列一致。圖1MrFRK2的克隆電泳圖A:中間片段擴(kuò)增;B:5′-RACE擴(kuò)增;C:3′-RACE擴(kuò)增;D:cDNA全長(zhǎng)擴(kuò)增;M:DL100marker。Fig.1GelelectrophoresisofMrFRK2cDNAsA:Middlesegment;B:5′-RACEsegment;C:3′-RACEsegment;D:Full-lengthcDNA;M:DL100marker.
RK2(苜蓿Medicagotruncatula,KEH30339.1)、PtFRK2(楊樹Populustrichocarpa,XP_006372861.1)、CcFRK2(克萊門柚Citrusclementina,XP_006443006.1)、VvFRK2(葡萄Vitisvinifera,XP_002268097.1)、AcFRK2(獼猴桃Actinidiachinensis,AFO84081.1)、SlFRK2(番茄Solanumlycopersicum,NP_001233888.1)、AtFRK2(擬南芥Arabidopsisthaliana,NP_172093.1)、StFRK2(馬鈴薯Solanumtuberosum,ABB29956.1)、MdFK4(蘋果Malus×domestica,NP_001281027.1)和EjFRK2(枇杷Eriobotryajaponica,ACL01290.1),比對(duì)結(jié)果如圖2所示。結(jié)果發(fā)現(xiàn),MrFRK2氨基酸序列含有碳水化合物磷酸果糖激酶家族(pfkBfamily)高度保守功能結(jié)構(gòu)域,包括1個(gè)ATP結(jié)合域(ATPbindingdomain),,2個(gè)底物識(shí)別域(substraterecognitiondomains)以及2個(gè)蛋白磷酸化位點(diǎn)(pfkB)。圖2楊梅果實(shí)MrFRK2的氨基酸序列對(duì)比圖Fig.2AlignmentofthededucedMrFRK2aminoacidsequenceswithFRK2sfromotherplants
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