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銀杏性別決定相關(guān)基因的篩選

發(fā)布時(shí)間:2020-03-01 16:33
【摘要】:【目的】銀杏為典型的雌雄異株裸子植物,成熟雌、雄個(gè)體在形態(tài)特征和生長(zhǎng)習(xí)性等方面存在顯著差異,這些差異的產(chǎn)生與性別決定機(jī)制相關(guān)。本文擬通過(guò)對(duì)銀杏性別決定相關(guān)基因的篩選為進(jìn)一步探討銀杏的性別決定機(jī)制奠定基礎(chǔ)!痉椒ā坷肦NA-Seq技術(shù)對(duì)來(lái)源于同一家系的25年生銀杏雌、雄花芽(CY,XY)及大、小孢子葉球(CH,XH)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生物信息學(xué)分析,以期發(fā)現(xiàn)可能參與銀杏性別決定過(guò)程的相關(guān)基因。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法對(duì)隨機(jī)挑選的26個(gè)差異表達(dá)基因的表達(dá)量進(jìn)行驗(yàn)證!窘Y(jié)果】通過(guò)對(duì)8個(gè)c DNA文庫(kù)的測(cè)序共得到大約60 Gb的高質(zhì)量序列,利用高質(zhì)量序列進(jìn)行de novo組裝共得到108 307條unigene。unigene的平均長(zhǎng)度為796 bp。26個(gè)隨機(jī)挑選差異表達(dá)基因的實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果與RNA-Seq結(jié)果的相關(guān)性較高。在所有的unigene中有51 953條(47.97%)unigene在核苷酸或蛋白質(zhì)公共數(shù)據(jù)庫(kù)中得到功能注釋。差異表達(dá)分析結(jié)果表明分別有4 709和9 802個(gè)基因在XY/CY和XH/CH中差異表達(dá)。11個(gè)在XY/CY和XH/CH中共同差異表達(dá)參與植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因與轉(zhuǎn)錄因子(如PYL、SNRK2和EIN3等)以及編碼甲基轉(zhuǎn)移酶的基因(如MET1和COMT1等)可能參與了銀杏的性別決定過(guò)程!窘Y(jié)論】參與多種調(diào)控途徑的功能基因可能在銀杏的性別決定中發(fā)揮作用,性別決定相關(guān)基因的篩選可為全面理解銀杏的性別決定機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

【參考文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2584085

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