半定量RT-PCR方法檢測(cè)FADX基因在油桐種子發(fā)育過程中的表達(dá)
【圖文】:
圖1油桐總RNA提取電泳圖Figure1ElectrophoresisoftotalRNAofVerniciafordii用手段,具有靈敏度高,特異性強(qiáng),操作簡(jiǎn)單的特點(diǎn),已經(jīng)廣泛應(yīng)用于植物基因的表達(dá)研究領(lǐng)域。采用此技術(shù),張麗娜等(2005)以小麥穩(wěn)定表達(dá)的肌動(dòng)蛋白基因(Actin)作為對(duì)照,對(duì)與抗白粉病有關(guān)的小麥TaM-lo-A1c基因的表達(dá)進(jìn)行了研究;蔣倫偉等(2012)分析了RAV基因家族在黃瓜各組織中的表達(dá)情況;張艷等(2012)采用該方法發(fā)現(xiàn)了三個(gè)水孔蛋白基因在幼苗根與糖分直接接觸時(shí)明顯上調(diào);姚曉華等(2014)對(duì)青稞種子胚胎成熟晚期豐富蛋白(LEA)基因Hva1與青稞抗旱性的關(guān)系進(jìn)行了分析。通常,RT-PCR實(shí)驗(yàn)會(huì)引入內(nèi)參基因校正不同樣本和實(shí)驗(yàn)條件帶來的數(shù)據(jù)差異(Bustin,2002;Andersenetal.,2004)。為保證實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性,需要選擇在樣品各種組織或發(fā)育階段均能穩(wěn)定表達(dá)的基因作為內(nèi)參基因(胡瑞波等,2009)。本研究篩選出油桐種子表達(dá)分析內(nèi)參基因GAPDH,,并以此為基礎(chǔ)研究了桐酸合成關(guān)鍵基因FADX的表達(dá)模式,有助于桐油品質(zhì)改良和油桐分子輔助育種的研究。1結(jié)果與分析1.1總RNA提取及cDNA第一鏈合成提取的油桐種仁總RNA經(jīng)凝膠電泳檢測(cè)(圖1),可觀測(cè)到清晰的28s和18s條帶,28srRNA條帶基本為18srRNA條帶亮度的2倍,表明提取的RNA完整性好,基本沒有降解,可以用于其后的研究,另外,由于LiCl對(duì)小分子核酸尤其是tRNA的沉淀效果不好,5s的條帶基本不可見。用紫外分光光度計(jì)測(cè)量提取的RNA樣品的A230,A260,A280值,所有樣品的A260nm/A230nm均在2.0~2.4之間,A260nm/A280nm在1.7~2.0之間,表明所提RNA質(zhì)量符合要求,可以滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)要求。反轉(zhuǎn)錄體系中RNA量均為3μg,通過調(diào)整起始RNA的量,以等量的TotalRNA反轉(zhuǎn)錄合成不同的cDNA樣品之間可
分子植物育種MolecularPlantBreeding圖24個(gè)內(nèi)參基因的RT-PCR分析注:A:瓊脂糖凝膠電泳圖;M:DNAmarker;1~5分別表示7.11,8.10,8.21,9.9以及10.30五個(gè)時(shí)間點(diǎn)的油桐樣品;B:QuantityOne數(shù)據(jù)分析;C:GeNorm程序數(shù)據(jù)分析表Figure2Analysisofthe4internalcontrolgenesNote:A:Agarosegelelectrophoresofthe4genes;M:DNAmarker;1~5:Thesamplecollectedin7.11,8.10,8.21,9.9and10.30;B:Analysisofthequantityonedata;C:DataforGeNormprogram步分析。GeNorm程序是專門用于RT-PCR方法選擇內(nèi)參基因的程序,可以從一系列不同功能的候選內(nèi)參基因中選擇出表達(dá)穩(wěn)定度最高的內(nèi)參基因,在內(nèi)參基因的評(píng)價(jià)和篩選方面具有重要的作用(Vandes-ompeleetal.,2002)。在本研究中,我們利用GeNorm程序計(jì)算表達(dá)穩(wěn)定度平均值(M)對(duì)4個(gè)內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定度進(jìn)行了排序,最終確定了GAPDH為FADX基因在油桐種子不同發(fā)育時(shí)期RT-PCR半定量檢測(cè)的內(nèi)參基因。它是糖異生、糖酵解及光合作用碳固定循環(huán)過程中的關(guān)鍵酶,在生物進(jìn)化的早期出現(xiàn),是最為常用的內(nèi)參基因之一(董曉麗等,2009,中國(guó)畜牧獸醫(yī),36(9):83-85)。前人對(duì)油桐果實(shí)生長(zhǎng)發(fā)育規(guī)律的研究(藺定運(yùn)和倪善慶,1980,植物生理學(xué)通訊,(3):37-40;何方等,1988,中國(guó)油桐科技論文選,pp.422-426)表明,油桐脂肪酸的含量從5月底到8月中旬都是逐步上升的,只是增值幅度不大,含油量不到10%,從8月中旬開始,脂肪酸的含量開始急速上升,8月底就能達(dá)到40%。從本實(shí)驗(yàn)結(jié)果可以看到,在油桐果實(shí)的發(fā)育早期(7月至8月中旬)的樣品中,F(xiàn)ADX一直維持在較低的表達(dá)水平上,但是從果實(shí)發(fā)育中期(8月中旬)開始,F(xiàn)ADX的表達(dá)顯著上升且一直保持這一水平至果實(shí)凈成熟階段(10月底),這也從一個(gè)方面證明FADX與油桐的油脂合成緊密相關(guān)?
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