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桉樹焦枯病菌CpSit1基因的鑒定與表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2020-02-12 04:45
【摘要】:利用Blast及TCDB數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)桉樹焦枯病菌(Calonectria pseudoreteaudii)的Cpsit1基因進(jìn)行鑒定;再利用SMART數(shù)據(jù)庫(kù)和Prot Param、TMHMM、PHD、Pro Comp 9.0在線分析工具對(duì)Cpsit1基因編碼蛋白的理化性質(zhì)、跨膜螺旋、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞定位進(jìn)行預(yù)測(cè)分析;最后采用qRT-PCR方法對(duì)CpSit1基因在焦枯病菌侵染桉樹過(guò)程中的表達(dá)情況進(jìn)行分析.結(jié)果表明:CpSit1基因長(zhǎng)度為1 780 bp,其編碼的蛋白序列共有592個(gè)氨基酸殘基組成,并將其鑒定為鐵載體-鐵:H+同向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白.其保守結(jié)構(gòu)域?yàn)镸FS_1;共含有14個(gè)跨膜螺旋;在二級(jí)結(jié)構(gòu)中α螺旋占45.10%,延伸鏈占26.01%,無(wú)規(guī)則卷曲占28.89%.通過(guò)qRT-PCR相對(duì)定量的方法分析焦枯病菌侵染桉樹24、48和72 h后CpSit1基因的表達(dá)情況,結(jié)果顯示,CpSit1基因在這3個(gè)時(shí)段均發(fā)生上調(diào)表達(dá),但24 h的表達(dá)量明顯大于48和72 h.說(shuō)明桉樹焦枯病菌CpSit1基因在病原菌侵染寄主的過(guò)程中通過(guò)調(diào)控鐵載體-鐵化合物的轉(zhuǎn)運(yùn)來(lái)完成鐵元素的攝入,協(xié)助其在寄主中的定植.
【圖文】:

堿基序列,親水性,蛋白


鰲,

本文編號(hào):2578701

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