桉樹焦枯病菌CpSit1基因的鑒定與表達(dá)
發(fā)布時間:2020-02-12 04:45
【摘要】:利用Blast及TCDB數(shù)據(jù)庫對桉樹焦枯病菌(Calonectria pseudoreteaudii)的Cpsit1基因進(jìn)行鑒定;再利用SMART數(shù)據(jù)庫和Prot Param、TMHMM、PHD、Pro Comp 9.0在線分析工具對Cpsit1基因編碼蛋白的理化性質(zhì)、跨膜螺旋、蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞定位進(jìn)行預(yù)測分析;最后采用qRT-PCR方法對CpSit1基因在焦枯病菌侵染桉樹過程中的表達(dá)情況進(jìn)行分析.結(jié)果表明:CpSit1基因長度為1 780 bp,其編碼的蛋白序列共有592個氨基酸殘基組成,并將其鑒定為鐵載體-鐵:H+同向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白.其保守結(jié)構(gòu)域?yàn)镸FS_1;共含有14個跨膜螺旋;在二級結(jié)構(gòu)中α螺旋占45.10%,延伸鏈占26.01%,無規(guī)則卷曲占28.89%.通過qRT-PCR相對定量的方法分析焦枯病菌侵染桉樹24、48和72 h后CpSit1基因的表達(dá)情況,結(jié)果顯示,CpSit1基因在這3個時段均發(fā)生上調(diào)表達(dá),但24 h的表達(dá)量明顯大于48和72 h.說明桉樹焦枯病菌CpSit1基因在病原菌侵染寄主的過程中通過調(diào)控鐵載體-鐵化合物的轉(zhuǎn)運(yùn)來完成鐵元素的攝入,協(xié)助其在寄主中的定植.
【圖文】:
鰲,
本文編號:2578701
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