【摘要】：為進(jìn)一步研究辣椒ARF(Auxin Response Factor)基因家族在其生長(zhǎng)發(fā)育及逆境脅迫中的作用,利用生物信息學(xué)方法從辣椒基因組中鑒定出20個(gè)ARF基因,這些基因不均勻地分布在辣椒12條染色體上。進(jìn)化關(guān)系顯示辣椒ARF基因可分為ClassⅠ和Ⅱ兩大類,進(jìn)一步可細(xì)分為Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7個(gè)亞類�；蚪Y(jié)構(gòu)圖表明,該基因家族由1~15個(gè)外顯子構(gòu)成,且各基因在不同發(fā)育時(shí)期不同組織中的表達(dá)量不同,具有一定的特異性。qRT-PCR結(jié)果表明,高鹽脅迫可以明顯激活或抑制ARF基因家族的表達(dá)。
【圖文】：

０００４５２２４６３８２０９０．２７５．７４ＡＴ１Ｇ３０３３０ＡＲＦ６０Ｃａｐａｎａ１０ｇ００１４６１１１３４３７７４２．５１７．１０ＡＴ４Ｇ３００８０ＡＲＦ１６Ｅ－１２３Ｃａｐａｎａ１１ｇ００００７６２０６７６８８７６．０６８．５８ＡＴ２Ｇ２８３５０ＡＲＦ１００Ｃａｐａｎａ１１ｇ０００１０５２２５９７５２８３．９１６．１１ＡＴ５Ｇ６０４５０ＡＲＦ４０Ｃａｐａｎａ１２ｇ００１３５４２４９９８３２９２．７８６．２９ＡＴ５Ｇ６２０００ＡＲＦ２，ＡＲＦ１－ＢＰ，ＨＳＳ，ＯＲＥ１４０圖１辣椒ＡＲＦ基因家族保守結(jié)構(gòu)域比對(duì)Ｆｉｇ．１ＡｌｉｇｎｍｅｎｔｏｆｃｏｎｓｅｒｖｅｄｄｏｍａｉｎｓｏｆＡＲＦｇｅｎｅｆａｍｉｌｙｉｎｐｅｐｐｅｒ１０５０西北植物學(xué)報(bào)３７卷

圖２辣椒ＡＲＦ基因家族在染色體上的位置Ｆｉｇ．２ＴｈｅｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｌｏｃａｔｉｏｎｓｏｆＡＲＦｇｅｎｅｆａｍｉｌｙｉｎｐｅｐｐｅｒ所以有些基因在染色體上的分布暫時(shí)還不清楚，，此研究把這些基因暫時(shí)定位在假設(shè)的０號(hào)染色上。由圖２的定位信息可知，辣椒ＡＲＦ基因家族共２０個(gè)成員分布在１２條染色體上，其中分布在０號(hào)和４號(hào)染色體上的最多，各有３條基因；其次在７號(hào)、８號(hào)、９號(hào)和１１號(hào)染色體上各有２條基因；在２號(hào)、３號(hào)、５號(hào)、６號(hào)、１０號(hào)和１２號(hào)染色體上各有１條基因，且這些基因主要分布在染色體的下端；１號(hào)染色體上沒有基因的分布。２．５辣椒ＡＲＦ基因家族的進(jìn)化與擬南芥和番茄的同源關(guān)系為更進(jìn)一步了解辣椒ＡＲＦ基因家族與擬南芥的同源關(guān)系，構(gòu)建辣椒、擬南芥與番茄ＡＲＦ基因家族系統(tǒng)進(jìn)化樹（圖３）。由圖３可知，辣椒ＡＲＦ基因家族可分為２組及７個(gè)亞組，ＣｌａｓｓⅠ可分為ａ、ｂ、ｃ、ｄ和ｅ５個(gè)亞類，分別含有３、４、２、５和１個(gè)ＡＲＦ基因，ＣｌａｓｓⅡ可分為ａ和ｂ２個(gè)亞組，分別含有１和４個(gè)ＡＲＦ基因。ＣｌａｓｓⅠｃ和Ⅰｄ有一個(gè)自展值為１００的直系同源基因?qū)Γǎ樱欤粒遥疲矗茫幔粒遥疲�、ＳｌＡＲＦ１８／ＣａＡＲＦ９Ａ），且Ⅰｃ中還有１對(duì)自展值為９９的直系同源基因?qū)Γǎ樱欤粒遥疲担茫幔粒遥疲担�，Ⅰｄ中有２�?duì)自展值為９９的直系同源基因?qū)Γǎ樱欤粒遥疲保茫幔粒遥疲�、ＳｌＡＲＦ９Ａ／ＣａＡＲＦ９Ｂ）。此外，從圖中可以看出擬南芥和番茄中含有旁系同源基因?qū)Γǎ粒簦粒遥疲保梗粒簦粒遥疲�、ＡｔＡＲＦ２２／ＡｔＡＲＦ１４、ＡｔＡＲＦ１１／ＡｔＡＲＦ１８、ＡｔＡＲＦ１６／ＡｔＡＲＦ１０、ＡｔＡＲＦ２３／ＡｔＡ�?

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