【摘要】：采用亞硫酸氫鹽測序技術(shù),檢測了Cu脅迫對(duì)海州香薷(Elsholtzia haichowensis Sun)Cu抗性和非抗性種群酸性轉(zhuǎn)化酶基因啟動(dòng)子甲基化的影響。結(jié)果表明,海州香薷液泡轉(zhuǎn)化酶基因(v INV)和細(xì)胞壁轉(zhuǎn)化酶基因(cw INV)的啟動(dòng)子在CG位點(diǎn)分別表現(xiàn)出超甲基化和低甲基化的現(xiàn)象。酸性轉(zhuǎn)化酶基因啟動(dòng)子CHG和CHH位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)受Cu脅迫影響較大。Cu脅迫下,v INV和cw INV啟動(dòng)子分別有1個(gè)CHG和6個(gè)CHH位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)在Cu抗性種群和非抗性種群之間表現(xiàn)出較大差異�？笴u種群中這些甲基化差異位點(diǎn)對(duì)Cu脅迫不敏感,但在非抗性種群中這些位點(diǎn)的甲基化水平在Cu脅迫后出現(xiàn)大幅上升或下降。有些甲基化差異位點(diǎn)位于或者臨近預(yù)測的啟動(dòng)子順式作用元件區(qū)域,可能參與Cu脅迫下酸性轉(zhuǎn)化酶基因的表達(dá)調(diào)控。
【圖文】：

(a)NMP的甲基化模式。(b)MP的甲基化模式。彩色短線表示啟動(dòng)子上所有的胞嘧啶位點(diǎn)相對(duì)于ATG的位置;加粗紅線表示預(yù)測的CG位點(diǎn)簇(－1315至－1019bp)。(c)vINV啟動(dòng)子圖示。+1表示ATG起始密碼子，紅色矩形表示預(yù)測的順式作用元件;黑色豎直箭頭表示2個(gè)甲基化差異位點(diǎn)。(d)－1061bp處CHG位點(diǎn)的甲基化百分比;(e)－107bp處CHH位點(diǎn)的甲基化百分比。(a)MethylationpatternofNMP．(b)MethylationpatternofMP．Shortcolorbarsbeneaththe100%lineshowthepositionsofallcytosinesinthevINVpromoterrelativetotheATG(notdrawntoscale)．PredictedCGclusterisshownwithaboldredline(－1315to－1019bp)．(c)SchematicrepresentationofthevINVpromoter．+1indicatestheATGstartcodon．Ｒedsolidboxesrepresentputativecis-actingelements．Blackverticalarrowsindicatethetwodifferentiallymethylatedcytosines．(d)Methylationpercentageofthe－1061bpCHG．(e)Methylationpercentageofthe－107bpCHH．圖2海州香薷vINV啟動(dòng)子胞嘧啶位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)Fig.2CytosinemethylationatindividualsitesinthevINVpromoterofElsholtziahaichowensis圖3不同抗性種群海州香薷cwINV啟動(dòng)子整體甲基化水平Fig.3CytosinemethylationlevelsofthecwINVpromoterinElsholtziahaichowensis在海州香薷cwINV啟動(dòng)子上這些甲基化差異位點(diǎn)中，，有4個(gè)位于預(yù)測的順式作用元件上或處于附近位置(圖4:c)。－1478和－1265bp處的CHH位點(diǎn)分別在5'UTＲPy-richstretch和Skn-1_motif上，而－1447和－1068bp處的CHH位點(diǎn)則分別在GAＲE-motif和TATC-box上游和下游2bp的位置。使用和vINV啟動(dòng)子相同的程序設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)，并沒有在cwINV啟動(dòng)子上找到預(yù)測的CpG島或者CG位點(diǎn)簇。578植物科學(xué)學(xué)報(bào)第35卷

(a)NMP的甲基化模式。(b)MP的甲基化模式。彩色短線表示啟動(dòng)子上所有的胞嘧啶位點(diǎn)相對(duì)于ATG的位置;加粗紅線表示預(yù)測的CG位點(diǎn)簇(－1315至－1019bp)。(c)vINV啟動(dòng)子圖示。+1表示ATG起始密碼子，紅色矩形表示預(yù)測的順式作用元件;黑色豎直箭頭表示2個(gè)甲基化差異位點(diǎn)。(d)－1061bp處CHG位點(diǎn)的甲基化百分比;(e)－107bp處CHH位點(diǎn)的甲基化百分比。(a)MethylationpatternofNMP．(b)MethylationpatternofMP．Shortcolorbarsbeneaththe100%lineshowthepositionsofallcytosinesinthevINVpromoterrelativetotheATG(notdrawntoscale)．PredictedCGclusterisshownwithaboldredline(－1315to－1019bp)．(c)SchematicrepresentationofthevINVpromoter．+1indicatestheATGstartcodon．Ｒedsolidboxesrepresentputativecis-actingelements．Blackverticalarrowsindicatethetwodifferentiallymethylatedcytosines．(d)Methylationpercentageofthe－1061bpCHG．(e)Methylationpercentageofthe－107bpCHH．圖2海州香薷vINV啟動(dòng)子胞嘧啶位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)Fig.2CytosinemethylationatindividualsitesinthevINVpromoterofElsholtziahaichowensis圖3不同抗性種群海州香薷cwINV啟動(dòng)子整體甲基化水平Fig.3CytosinemethylationlevelsofthecwINVpromoterinElsholtziahaichowensis在海州香薷cwINV啟動(dòng)子上這些甲基化差異位點(diǎn)中，有4個(gè)位于預(yù)測的順式作用元件上或處于附近位置(圖4:c)。－1478和－1265bp處的CHH位點(diǎn)分別在5'UTＲPy-richstretch和Skn-1_motif上，而－1447和－1068bp處的CHH位點(diǎn)則分別在GAＲE-motif和TATC-box上游和下游2bp的位置。使用和vINV啟動(dòng)子相同的程序設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)，并沒有在cwINV啟動(dòng)子上找到預(yù)測的CpG島或者CG位點(diǎn)簇。578植物科學(xué)學(xué)報(bào)第35卷
【作者單位】： 武漢大學(xué)資源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(21477093)~~
【分類號(hào)】：Q943.2

【參考文獻(xiàn)】

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1 丁國華;郭丹蒂;關(guān)e

本文編號(hào)：2550590