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植物乳桿菌及其近緣種部分看家基因的系統(tǒng)發(fā)育分析

發(fā)布時間:2019-09-27 19:26
【摘要】:本文研究了16S rRNA基因、pheS和pyr G部分基因序列對Lactobacillus plantarum(L.plantarum)及其近緣種的區(qū)分能力,采用分離自酸面團、酸牛奶和泡菜中的10株L.plantarum為研究對象,以其看家基因pheS和pyr G部分基因序列作為分子標記,結(jié)合已上傳至Gene Bank的近緣種的相應(yīng)序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹并與以16S rRNA基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹進行比較。結(jié)果表明:基于16S rRNA基因序列不能區(qū)分L.plantarum及其近緣種,而看家基因pheS和pyr G部分基因序列能夠很好的區(qū)分植物乳桿菌種及其近緣種,其中,pheS在植物乳桿菌種內(nèi)分型時相較于pyr G基因效果更好,以及將pheS和pyr G部分基因序列串聯(lián)使用后,試驗菌株與參考菌株的分類關(guān)系更加明晰,因此,聯(lián)合基因(pheS-pyr G)可作為16S rRNA基因的輔助工具用于L.plantarum及近緣種和植物乳桿菌種內(nèi)分型的快速分類鑒定。
【作者單位】: 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點實驗室;錫林郭勒盟蒙醫(yī)研究所;
【基金】:內(nèi)蒙古科技重大專項(20140125) 中國農(nóng)業(yè)研究體系(CARS-37)
【分類號】:TS201.3

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