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植物乳桿菌及其近緣種部分看家基因的系統(tǒng)發(fā)育分析

發(fā)布時(shí)間:2019-09-27 19:26
【摘要】:本文研究了16S rRNA基因、pheS和pyr G部分基因序列對(duì)Lactobacillus plantarum(L.plantarum)及其近緣種的區(qū)分能力,采用分離自酸面團(tuán)、酸牛奶和泡菜中的10株L.plantarum為研究對(duì)象,以其看家基因pheS和pyr G部分基因序列作為分子標(biāo)記,結(jié)合已上傳至Gene Bank的近緣種的相應(yīng)序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)并與以16S rRNA基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)進(jìn)行比較。結(jié)果表明:基于16S rRNA基因序列不能區(qū)分L.plantarum及其近緣種,而看家基因pheS和pyr G部分基因序列能夠很好的區(qū)分植物乳桿菌種及其近緣種,其中,pheS在植物乳桿菌種內(nèi)分型時(shí)相較于pyr G基因效果更好,以及將pheS和pyr G部分基因序列串聯(lián)使用后,試驗(yàn)菌株與參考菌株的分類關(guān)系更加明晰,因此,聯(lián)合基因(pheS-pyr G)可作為16S rRNA基因的輔助工具用于L.plantarum及近緣種和植物乳桿菌種內(nèi)分型的快速分類鑒定。
【作者單位】: 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;錫林郭勒盟蒙醫(yī)研究所;
【基金】:內(nèi)蒙古科技重大專項(xiàng)(20140125) 中國(guó)農(nóng)業(yè)研究體系(CARS-37)
【分類號(hào)】:TS201.3

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本文編號(hào):2542836

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