【摘要】：從桃基因組數(shù)據(jù)庫篩選出了12個(gè)假定的成束狀阿拉伯半乳糖蛋白(FLA)基因序列。對其蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,結(jié)果顯示PpFLA7不具有特定的阿拉伯糖或半乳糖糖基化位點(diǎn),不屬于典型的FLA家族。PpFLA6的氨基酸組成和保守域的分布與其他成員相比差別較大。聚類分析結(jié)果表明PpFLAs家族可以分為CladeⅠ、CladeⅡ和CladeⅢ3類。利用熒光定量PCR(qPCR)對不同組織和成熟階段果實(shí)中的FLA進(jìn)行表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)各個(gè)成員在不同時(shí)期的組織中差異化表達(dá),其中PpFLA4在果實(shí)成熟階段顯著上調(diào)表達(dá),暗示其可能在桃果實(shí)的成熟階段扮演重要角色。
【圖文】：

BianKun，ShaoJiarong，XuLiwei，，ShenZiming，ChenWei，YangZhenfeng.BioinformaticandexpressionanalysisofFasciclin-likearabinogalactanproteins（FLAs）genefamilyinpeach.658ActaHorticulturaeSinica，2017，44(4)：653 663.圖1桃（Pp）和擬南芥（At）FLA蛋白成束區(qū)域序列比對結(jié)果Fig.1Alignmentofmultiplesequencesencodingthefasciclin-likedomainsofPpFLAsandAtFLAs圖2桃FLA蛋白結(jié)構(gòu)簡圖Fig.2SchematicrepresentationofFLAsinpeach

BianKun，ShaoJiarong，XuLiwei，ShenZiming，ChenWei，YangZhenfeng.BioinformaticandexpressionanalysisofFasciclin-likearabinogalactanproteins（FLAs）genefamilyinpeach.658ActaHorticulturaeSinica，2017，44(4)：653 663.圖1桃（Pp）和擬南芥（At）FLA蛋白成束區(qū)域序列比對結(jié)果Fig.1Alignmentofmultiplesequencesencodingthefasciclin-likedomainsofPpFLAsandAtFLAs圖2桃FLA蛋白結(jié)構(gòu)簡圖Fig.2SchematicrepresentationofFLAsinpeach
【作者單位】： 上海海洋大學(xué)食品學(xué)院;浙江萬里學(xué)院生物與環(huán)境學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31371866) 浙江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(LQ15C200004) 浙江省重中之重學(xué)科學(xué)生創(chuàng)新項(xiàng)目(1740002979)
【分類號】：S662.1

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 宋春波;晁青青;梁敏華;邵佳蓉;陳偉;楊震峰;;桃果實(shí)PpOAT和PpP5CS的克隆及其對外源GABA處理的響應(yīng)表達(dá)[J];園藝學(xué)報(bào);2015年11期

2 陳克明;陳偉;楊震峰;;桃果實(shí)采后可溶性糖和果膠類物質(zhì)的變化與低溫冷害的關(guān)系[J];核農(nóng)學(xué)報(bào);2013年05期

3 金昌海;索標(biāo);闞娟;王紅梅;汪志君;;桃果實(shí)采后貯藏過程中細(xì)胞壁多糖的變化(英文)[J];植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報(bào);2006年06期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 卞坤;邵佳蓉;徐利偉;沈子明;陳偉;楊震峰;;桃FLA家族基因的生物信息學(xué)及表達(dá)分析[J];園藝學(xué)報(bào);2017年04期

2 邵佳蓉;宋春波;卞坤;陳偉;楊震峰;;桃果實(shí)PpSIZ1基因?qū)Φ蜏睾屯庠赐屎谒靥幚淼捻憫?yīng)[J];園藝學(xué)報(bào);2016年07期

3 宋春波;方怡楠;吳哲銘;邵佳蓉;梁敏華;陳偉;楊震峰;;γ-氨基丁酸對低溫脅迫下桃果實(shí)多胺代謝的影響[J];果樹學(xué)報(bào);2016年05期

4 宋春波;晁青青;梁敏華;邵佳蓉;陳偉;楊震峰;;桃果實(shí)PpOAT和PpP5CS的克隆及其對外源GABA處理的響應(yīng)表達(dá)[J];園藝學(xué)報(bào);2015年11期

5 孫志棟;田方;張仁杰;馬建芳;陳惠云;史婷婷;李共國;;1-MCP和溫度處理對采后芋頭貯藏品質(zhì)的影響[J];核農(nóng)學(xué)報(bào);2015年09期

6 梁敏華;雷建敏;邵佳蓉;蘇新國;楊震峰;陳偉;;UV-C處理對桃果實(shí)酚類物質(zhì)代謝和貯藏品質(zhì)的影響[J];核農(nóng)學(xué)報(bào);2015年06期

7 劉春泉;宋江峰;王遠(yuǎn);李大婧;;外源精胺對菜用大豆貯藏冷害及蔗糖代謝的影響[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2015年08期

8 賀帆;王濤;武圣江;徐成龍;宮長榮;;密集烘烤烤煙不同品種煙葉質(zhì)地和顏色變化[J];核農(nóng)學(xué)報(bào);2014年09期

9 王俊寧;呂慶芳;豐鋒;謝江輝;魏長斌;李映暉;葉春海;;濕包類型菠蘿蜜采后呼吸躍變和主要成分的變化[J];園藝學(xué)報(bào);2014年02期

10 劉景安;何洪巨;郭紹貴;張海英;任毅;宮國義;許勇;;西瓜果實(shí)成熟軟化的生理生化機(jī)制[J];果樹學(xué)報(bào);2013年05期

【二級參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前7條

1 陳偉;蘇新國;郜海燕;楊震峰;;低溫對桃果實(shí)采后冷害及其內(nèi)源激素的影響[J];核農(nóng)學(xué)報(bào);2013年08期

2 陳克明;陳偉;楊震峰;;桃果實(shí)采后可溶性糖和果膠類物質(zhì)的變化與低溫冷害的關(guān)系[J];核農(nóng)學(xué)報(bào);2013年05期

3 張海英;王有年;韓濤;李麗萍;許麗;;外源甜菜堿對黃瓜果實(shí)冷藏期間延緩冷害的影響[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年08期

4 ;Methyl Jasmonate Reduces Chilling Injury and Maintains Postharvest Quality in Peaches[J];Agricultural Sciences in China;2003年11期

5 馮磊,鄭永華,汪峰,張?zhí)m;茉莉酸甲酯處理對冷藏水蜜桃品質(zhì)的影響[J];食品科學(xué);2003年09期

6 茅林春,張上隆;間歇低溫脅迫對桃果實(shí)細(xì)胞壁代謝的影響[J];植物生理學(xué)報(bào);2001年02期

7 胡小松;丁雙陽;;桃采后呼吸和乙烯釋放規(guī)律及多效唑的影響[J];北京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);1993年01期

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 陳成;生物信息學(xué)的現(xiàn)狀與未來[J];生物技術(shù)通報(bào);2000年02期

2 龐洪泉 ,樊龍江;有關(guān)生物信息學(xué)的幾點(diǎn)誤解[J];生物技術(shù)通報(bào);2002年02期

3 ;《生物信息學(xué)導(dǎo)論》出版[J];遺傳學(xué)報(bào);2005年01期

4 刁雪濤;張小芳;宋潔;金梅;;生物信息學(xué)研究進(jìn)展[J];安徽農(nóng)學(xué)通報(bào);2008年22期

5 M.澤瓦勒貝;JO.鮑姆;;理解生物信息學(xué)[J];新疆農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年02期

6 施季森,何禎祥;21世紀(jì)的生物信息學(xué)述評[J];南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2001年02期

7 鄭國清,張瑞玲,段韶芬,徐麗敏;生物信息學(xué)的形成與發(fā)展[J];河南農(nóng)業(yè)科學(xué);2002年11期

8 鄭國清,段韶芬,徐麗敏;生物信息學(xué)研究領(lǐng)域概述[J];河南農(nóng)業(yè)科學(xué);2002年12期

9 鄭國清,黃靜,段韶芬,徐麗敏;生物信息學(xué)研究進(jìn)展與展望[J];河南農(nóng)業(yè)科學(xué);2003年01期

10 鄭珂暉;生物信息學(xué)的背景、現(xiàn)狀及前景[J];農(nóng)業(yè)網(wǎng)絡(luò)信息;2005年02期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 唐一源;沈鈞賢;徐志敏;;生物信息學(xué)與神經(jīng)信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的整合[A];第九次全國生物物理大會(huì)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2002年

2 高亞梅;韓毅強(qiáng);余麗蕓;;生物信息學(xué)本科教學(xué)研究初探[A];高教科研2006（中冊：教學(xué)改革）[C];2006年

3 楊劍;;生物信息學(xué)在新發(fā)再發(fā)傳染病研究中的應(yīng)用[A];新發(fā)和再發(fā)傳染病防治熱點(diǎn)研討會(huì)論文集[C];2011年

4 潘潔;;生物信息學(xué)對中藥現(xiàn)代化的作用[A];2006第六屆中國藥學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2006年

5 葛劍徽;李成;謝迅雷;;生物信息學(xué)發(fā)展現(xiàn)狀與前景展望[A];2008年中華臨床醫(yī)學(xué)工程及數(shù)字醫(yī)學(xué)大會(huì)暨中華醫(yī)學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)工程學(xué)分會(huì)第九次學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2008年

6 劉湘軍;;生物信息學(xué)的研究現(xiàn)狀[A];第九次全國生物物理大會(huì)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2002年

7 孫金立;李路路;王棟;;生物信息學(xué)多媒體教學(xué)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)框架[A];圖書館改革與發(fā)展——陜西省社會(huì)科學(xué)信息學(xué)會(huì)第六次學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2003年

8 陸文聰;鈕冰;;基于數(shù)據(jù)挖掘的生物信息學(xué)研究進(jìn)展[A];中國化學(xué)會(huì)第27屆學(xué)術(shù)年會(huì)第15分會(huì)場摘要集[C];2010年

9 康曉東;;生物信息學(xué)及其研究對象[A];2003年全國醫(yī)學(xué)影像技術(shù)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2003年

10 呂暉;;生物信息學(xué)與個(gè)體化醫(yī)學(xué)[A];第九屆全國遺傳病診斷與產(chǎn)前診斷學(xué)術(shù)交流會(huì)暨產(chǎn)前診斷和醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)新技術(shù)研討會(huì)論文集[C];2014年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條

1 劉義;生物信息學(xué)產(chǎn)業(yè)浮出水面[N];中國高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導(dǎo)報(bào);2000年

2 張雅麗;加強(qiáng)交流 立足中國生物信息學(xué)最新進(jìn)展[N];科技日報(bào);2000年

3 本報(bào)記者 白毅;生物信息學(xué)院士談[N];中國醫(yī)藥報(bào);2002年

4 劉麗麗;高性能計(jì)算為生物信息學(xué)加速[N];計(jì)算機(jī)世界;2007年

5 中科院生物學(xué)部 張春霆;對生物信息學(xué)的展望[N];北京科技報(bào);2000年

6 魏中文;生物信息學(xué)是開啟后基因組時(shí)代的“金鑰匙”[N];北京科技報(bào);2002年

7 記者 王雪飛;我國科學(xué)家向政府建議——加強(qiáng)生物信息學(xué)學(xué)科建設(shè)[N];健康報(bào);2000年

8 白毅;加強(qiáng)生物信息學(xué)建設(shè)推動(dòng)人類基因組研究[N];中國醫(yī)藥報(bào);2002年

9 王雪飛 吳黎;中國生物信息學(xué)研究快速發(fā)展[N];健康報(bào);2002年

10 春曉;國外生物信息學(xué)的發(fā)展與現(xiàn)狀[N];中國醫(yī)藥報(bào);2002年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前6條

1 楊帥;面向組學(xué)大數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2016年

2 喬立安;基于網(wǎng)格的生物信息學(xué)計(jì)算流程系統(tǒng)的研究[D];清華大學(xué);2005年

3 賴煦卉;基于生物信息學(xué)的抗結(jié)核藥物靶點(diǎn)的篩選與驗(yàn)證[D];復(fù)旦大學(xué);2008年

4 張成崗;基于本地和WEB的生物信息學(xué)綜合分析體系的建立及部分新基因的初步實(shí)驗(yàn)研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2000年

5 朱英杰;藥用植物基因資源的生物信息學(xué)研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

6 王嫻;蛋白殘基可溶性預(yù)測及基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析方法研究[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2007年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 李中輝;Ⅱ型糖尿病相關(guān)基因的生物信息學(xué)研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2015年

2 佘曾溧;生物信息學(xué)科學(xué)論文中的非文獻(xiàn)資源引用行為研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

3 張書欣;生物信息學(xué)若干問題研究報(bào)告[D];吉林大學(xué);2012年

4 劉維;生物信息學(xué)中的并行處理[D];揚(yáng)州大學(xué);2007年

5 張景祥;關(guān)于生物信息學(xué)的幾個(gè)問題[D];江南大學(xué);2008年

6 雷國慶;面向生物信息學(xué)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域的算法加速器設(shè)計(jì)[D];國防科學(xué)技術(shù)大學(xué);2010年

7 劉丙強(qiáng);生物信息學(xué)中的若干組合問題[D];山東大學(xué);2006年

8 周萍;生物信息學(xué)多序列比對及種系生成樹的幾種技術(shù)和算法研究[D];電子科技大學(xué);2007年

9 湯思捷;蛋白質(zhì)可溶性預(yù)測的生物信息學(xué)模型及應(yīng)用[D];蘇州大學(xué);2014年

10 黃金;聚類和分類技術(shù)在生物信息學(xué)中的應(yīng)用[D];黑龍江大學(xué);2005年

本文編號：2529831