楊樹MYB基因應(yīng)答非生物脅迫的表達(dá)特性
發(fā)布時(shí)間:2019-08-19 13:10
【摘要】:MYB轉(zhuǎn)錄因子以其含有的保守MYB結(jié)構(gòu)域?yàn)樘卣?是植物轉(zhuǎn)錄因子中數(shù)量最多的家族之一,廣泛參與植物生長(zhǎng)發(fā)育和代謝的調(diào)節(jié)。利用生物信息學(xué)分析獲得222條楊樹MYB基因,用實(shí)時(shí)定量PCR篩選出8條對(duì)鹽脅迫有強(qiáng)烈應(yīng)答的基因,研究其在鹽、干旱、ABA等非生物脅迫下的表達(dá)模式;結(jié)果表明:這8條MYB基因雖然在楊樹根、莖、葉組織中均有表達(dá),但是在不同脅迫條件和不同組織中的表達(dá)水平明顯不同。在鹽和干旱脅迫條件下,8個(gè)基因在根、莖、葉中均被誘導(dǎo)表達(dá),表現(xiàn)為相似的表達(dá)模式。在ABA處理?xiàng)l件下,而多數(shù)基因無(wú)明顯應(yīng)答。說(shuō)明楊樹MYB基因在應(yīng)答環(huán)境變化與激素調(diào)節(jié)中具有不同的作用,并且在不同組織中的作用有所差異。
【圖文】:
圖1楊樹MYB結(jié)構(gòu)域氨基酸序列比對(duì)表3楊樹MYB基因應(yīng)答鹽脅迫表達(dá)模式基因名稱根的相對(duì)表達(dá)量莖的相對(duì)表達(dá)量葉相對(duì)表達(dá)量PtrMYB171.429±0.051.136±0.076.948±0.92PtrMYB961.244±0.101.265±0.357.101±0.48PtrMYB1391.609±0.621.392±0.388.052±0.99PtrMYB1626.704±0.212.918±0.024.262±0.43PtrMYB1649.501±1.262.427±0.0410.797±0.97PtrMYB1682.519±08.750±0.117.714±1.15PtrMYB1854.454±0.241.902±0.988.558±0.39PtrMYB2122.655±0.062.934±0.054.212±0.90注:表中數(shù)據(jù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。2.3楊樹MYB基因應(yīng)答干旱脅迫表達(dá)模式在干旱迫條件下,8個(gè)MYB基因在葉中均被誘導(dǎo)表達(dá),但多數(shù)基因在根和莖中的表達(dá)水平比在葉中的表達(dá)水平低,這種基因表達(dá)趨勢(shì)與在鹽脅迫條件下的的表達(dá)趨勢(shì)相似(表4)。PtrMYB17、PtrMYB139和PtrMYB168只在葉中被干旱誘導(dǎo)表達(dá)2倍以上,在根和莖中的表達(dá)水平變化不明顯;PtrMYB164和PtrMYB185在根和葉中可被干旱誘導(dǎo)表達(dá),而在莖中的表達(dá)水平則無(wú)明顯變化;PtrMYB162在莖和葉中可被干旱誘導(dǎo)表達(dá),而在根中的表達(dá)水平則無(wú)明顯變化;PtrMYB96在干旱脅迫條件下,無(wú)論在根和莖中還是葉中,其表達(dá)水平變化不明顯,均未超過(guò)2倍?梢奝trMYB96雖然響應(yīng)鹽脅迫,但對(duì)干旱脅迫無(wú)明顯應(yīng)答(表4)。說(shuō)明有些楊樹MYB基因在干旱脅迫條件下也表現(xiàn)出一定的組織特異性。表4楊樹MYB基因應(yīng)答PEG脅迫表達(dá)模式基因名稱根的相對(duì)表達(dá)量莖的相對(duì)表達(dá)量葉的相對(duì)表達(dá)量PtrMYB171.932±0.571.231±0.072.930±0.15PtrMYB961.540±0.061.667±0.371.808±0.55PtrMYB1391.488±0.201.833±0.132.294±0.09PtrMYB1621.065±0.423.813±0.232.299±
圖1楊樹MYB結(jié)構(gòu)域氨基酸序列比對(duì)表3楊樹MYB基因應(yīng)答鹽脅迫表達(dá)模式基因名稱根的相對(duì)表達(dá)量莖的相對(duì)表達(dá)量葉相對(duì)表達(dá)量PtrMYB171.429±0.051.136±0.076.948±0.92PtrMYB961.244±0.101.265±0.357.101±0.48PtrMYB1391.609±0.621.392±0.388.052±0.99PtrMYB1626.704±0.212.918±0.024.262±0.43PtrMYB1649.501±1.262.427±0.0410.797±0.97PtrMYB1682.519±08.750±0.117.714±1.15PtrMYB1854.454±0.241.902±0.988.558±0.39PtrMYB2122.655±0.062.934±0.054.212±0.90注:表中數(shù)據(jù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。2.3楊樹MYB基因應(yīng)答干旱脅迫表達(dá)模式在干旱迫條件下,,8個(gè)MYB基因在葉中均被誘導(dǎo)表達(dá),但多數(shù)基因在根和莖中的表達(dá)水平比在葉中的表達(dá)水平低,這種基因表達(dá)趨勢(shì)與在鹽脅迫條件下的的表達(dá)趨勢(shì)相似(表4)。PtrMYB17、PtrMYB139和PtrMYB168只在葉中被干旱誘導(dǎo)表達(dá)2倍以上,在根和莖中的表達(dá)水平變化不明顯;PtrMYB164和PtrMYB185在根和葉中可被干旱誘導(dǎo)表達(dá),而在莖中的表達(dá)水平則無(wú)明顯變化;PtrMYB162在莖和葉中可被干旱誘導(dǎo)表達(dá),而在根中的表達(dá)水平則無(wú)明顯變化;PtrMYB96在干旱脅迫條件下,無(wú)論在根和莖中還是葉中,其表達(dá)水平變化不明顯,均未超過(guò)2倍?梢奝trMYB96雖然響應(yīng)鹽脅迫,但對(duì)干旱脅迫無(wú)明顯應(yīng)答(表4)。說(shuō)明有些楊樹MYB基因在干旱脅迫條件下也表現(xiàn)出一定的組織特異性。表4楊樹MYB基因應(yīng)答PEG脅迫表達(dá)模式基因名稱根的相對(duì)表達(dá)量莖的相對(duì)表達(dá)量葉的相對(duì)表達(dá)量PtrMYB171.932±0.571.231±0.072.930±0.15PtrMYB961.540±0.061.667±0.371.808±0.55PtrMYB1391.488±0.201.833±0.132.294±0.09PtrMYB1621.065±0.423.813±0.232.299±
【作者單位】: 林木遺傳育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(東北林業(yè)大學(xué));
【基金】:國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(201610225001)
【分類號(hào)】:Q943.2
本文編號(hào):2528275
【圖文】:
圖1楊樹MYB結(jié)構(gòu)域氨基酸序列比對(duì)表3楊樹MYB基因應(yīng)答鹽脅迫表達(dá)模式基因名稱根的相對(duì)表達(dá)量莖的相對(duì)表達(dá)量葉相對(duì)表達(dá)量PtrMYB171.429±0.051.136±0.076.948±0.92PtrMYB961.244±0.101.265±0.357.101±0.48PtrMYB1391.609±0.621.392±0.388.052±0.99PtrMYB1626.704±0.212.918±0.024.262±0.43PtrMYB1649.501±1.262.427±0.0410.797±0.97PtrMYB1682.519±08.750±0.117.714±1.15PtrMYB1854.454±0.241.902±0.988.558±0.39PtrMYB2122.655±0.062.934±0.054.212±0.90注:表中數(shù)據(jù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。2.3楊樹MYB基因應(yīng)答干旱脅迫表達(dá)模式在干旱迫條件下,8個(gè)MYB基因在葉中均被誘導(dǎo)表達(dá),但多數(shù)基因在根和莖中的表達(dá)水平比在葉中的表達(dá)水平低,這種基因表達(dá)趨勢(shì)與在鹽脅迫條件下的的表達(dá)趨勢(shì)相似(表4)。PtrMYB17、PtrMYB139和PtrMYB168只在葉中被干旱誘導(dǎo)表達(dá)2倍以上,在根和莖中的表達(dá)水平變化不明顯;PtrMYB164和PtrMYB185在根和葉中可被干旱誘導(dǎo)表達(dá),而在莖中的表達(dá)水平則無(wú)明顯變化;PtrMYB162在莖和葉中可被干旱誘導(dǎo)表達(dá),而在根中的表達(dá)水平則無(wú)明顯變化;PtrMYB96在干旱脅迫條件下,無(wú)論在根和莖中還是葉中,其表達(dá)水平變化不明顯,均未超過(guò)2倍?梢奝trMYB96雖然響應(yīng)鹽脅迫,但對(duì)干旱脅迫無(wú)明顯應(yīng)答(表4)。說(shuō)明有些楊樹MYB基因在干旱脅迫條件下也表現(xiàn)出一定的組織特異性。表4楊樹MYB基因應(yīng)答PEG脅迫表達(dá)模式基因名稱根的相對(duì)表達(dá)量莖的相對(duì)表達(dá)量葉的相對(duì)表達(dá)量PtrMYB171.932±0.571.231±0.072.930±0.15PtrMYB961.540±0.061.667±0.371.808±0.55PtrMYB1391.488±0.201.833±0.132.294±0.09PtrMYB1621.065±0.423.813±0.232.299±
圖1楊樹MYB結(jié)構(gòu)域氨基酸序列比對(duì)表3楊樹MYB基因應(yīng)答鹽脅迫表達(dá)模式基因名稱根的相對(duì)表達(dá)量莖的相對(duì)表達(dá)量葉相對(duì)表達(dá)量PtrMYB171.429±0.051.136±0.076.948±0.92PtrMYB961.244±0.101.265±0.357.101±0.48PtrMYB1391.609±0.621.392±0.388.052±0.99PtrMYB1626.704±0.212.918±0.024.262±0.43PtrMYB1649.501±1.262.427±0.0410.797±0.97PtrMYB1682.519±08.750±0.117.714±1.15PtrMYB1854.454±0.241.902±0.988.558±0.39PtrMYB2122.655±0.062.934±0.054.212±0.90注:表中數(shù)據(jù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。2.3楊樹MYB基因應(yīng)答干旱脅迫表達(dá)模式在干旱迫條件下,,8個(gè)MYB基因在葉中均被誘導(dǎo)表達(dá),但多數(shù)基因在根和莖中的表達(dá)水平比在葉中的表達(dá)水平低,這種基因表達(dá)趨勢(shì)與在鹽脅迫條件下的的表達(dá)趨勢(shì)相似(表4)。PtrMYB17、PtrMYB139和PtrMYB168只在葉中被干旱誘導(dǎo)表達(dá)2倍以上,在根和莖中的表達(dá)水平變化不明顯;PtrMYB164和PtrMYB185在根和葉中可被干旱誘導(dǎo)表達(dá),而在莖中的表達(dá)水平則無(wú)明顯變化;PtrMYB162在莖和葉中可被干旱誘導(dǎo)表達(dá),而在根中的表達(dá)水平則無(wú)明顯變化;PtrMYB96在干旱脅迫條件下,無(wú)論在根和莖中還是葉中,其表達(dá)水平變化不明顯,均未超過(guò)2倍?梢奝trMYB96雖然響應(yīng)鹽脅迫,但對(duì)干旱脅迫無(wú)明顯應(yīng)答(表4)。說(shuō)明有些楊樹MYB基因在干旱脅迫條件下也表現(xiàn)出一定的組織特異性。表4楊樹MYB基因應(yīng)答PEG脅迫表達(dá)模式基因名稱根的相對(duì)表達(dá)量莖的相對(duì)表達(dá)量葉的相對(duì)表達(dá)量PtrMYB171.932±0.571.231±0.072.930±0.15PtrMYB961.540±0.061.667±0.371.808±0.55PtrMYB1391.488±0.201.833±0.132.294±0.09PtrMYB1621.065±0.423.813±0.232.299±
【作者單位】: 林木遺傳育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(東北林業(yè)大學(xué));
【基金】:國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(201610225001)
【分類號(hào)】:Q943.2
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本文編號(hào):2528275
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