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香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表達特性分析

發(fā)布時間:2019-08-16 06:45
【摘要】:在獲得MaTPS2基因全長序列的基礎(chǔ)上,采用同源序列比對、聚類分析、實時定量PCR等技術(shù)初步探討香蕉MaTPS2基因的功能。從香蕉A基因組中獲得一條3 277bp MaTPS2全長序列,包含一個完整的開放閱讀框1 344bp,編碼蛋白含447個氨基酸。其氨基酸理化性質(zhì)分析表明,MaTPS2蛋白屬于不穩(wěn)定疏水性蛋白,具有一個結(jié)構(gòu)域GT1-TPS。通過與已知植物的TPS氨基酸同源序列比對,同源性達77.95%。系統(tǒng)發(fā)育樹進化關(guān)系分析表明,MaTPS2編碼的氨基酸序列與銀杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)鄰近,說明二者的親緣關(guān)系較近。器官特異性分析表明,MaTPS2在香蕉植株的根、球莖、假莖、葉、花各器官中均有表達,其中在球莖、假莖和葉中表達量較多,在果實中表達量較低。在ABA、干旱、鹽害和枯萎病菌脅迫處理下,MaTPS2表達量升高,在ACC脅迫處理下,MaTPS2表達量顯著下降,而低溫脅迫條件下,MaTPS2表達不響應(yīng)。由此推導(dǎo),MaTPS2可能參與調(diào)控香蕉抗旱、抗病機制。植物生長調(diào)節(jié)劑ACC和ABA脅迫處理說明MaTPS2的表達可能受激素蛋白間接調(diào)控。
【圖文】:

氨基酸序列,假莖,香蕉,進化樹


中國南方果樹/SOUTHCHINAFRUITS第45卷列與銀杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)鄰近,,說明兩者的親緣關(guān)系較近(見圖2)。圖1香蕉MaTPS2氨基酸序列的保守結(jié)構(gòu)域分析在圖2系統(tǒng)發(fā)育樹內(nèi),其他植物抗逆性與植物TPS基因表達量的關(guān)系的研究已有報道。Wu等研究發(fā)現(xiàn),編碼海藻糖-6-磷酸合成酶的GbTPS基因使銀杏GinkgobilobaL.具有高度抗旱、抗寒的能力;通過在組織特異性RT-PCR表達分析,結(jié)果顯示,GbTPS可能參與樹葉的發(fā)育機制[9]。Holmstrom等通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)法AtTPS1轉(zhuǎn)入煙草中,經(jīng)干燥處理后發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因株系葉片中AtTPS1表達量較野生型株系葉片高,離體24h后仍保持鮮葉狀態(tài)[10]。因此,推測MaTPS2可能參與調(diào)控香蕉抗旱機制。圖2不同植物中TPS氨基酸序列的進化樹分析2.3MaTPS2在香蕉不同器官中表達分析MaTPS2在香蕉植株的根、球莖、假莖、葉、花各器官中均有表達,其中在球莖、假莖和葉中表達量較多,在果實中表達量最低(見圖3)。2.4MaTPS2在不同脅迫下的特異性表達分析提取經(jīng)5種非生物脅迫下香蕉根系總RNA,利用qPCR分析根系中MaTPS2的表達量看出,干旱處理使MaTPS2的表達量增加,在6h時達到極顯著,在12、24h時表達量下降,但高于正常條件下MaTPS2表達量。ACC脅迫處理下,MaTPS2表達量顯著下降,隨著時間延長而減少,24h時MaTPS2表達量降到最低值,接近于

氨基酸序列,假莖,香蕉,進化樹


中國南方果樹/SOUTHCHINAFRUITS第45卷列與銀杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)鄰近,說明兩者的親緣關(guān)系較近(見圖2)。圖1香蕉MaTPS2氨基酸序列的保守結(jié)構(gòu)域分析在圖2系統(tǒng)發(fā)育樹內(nèi),其他植物抗逆性與植物TPS基因表達量的關(guān)系的研究已有報道。Wu等研究發(fā)現(xiàn),編碼海藻糖-6-磷酸合成酶的GbTPS基因使銀杏GinkgobilobaL.具有高度抗旱、抗寒的能力;通過在組織特異性RT-PCR表達分析,結(jié)果顯示,GbTPS可能參與樹葉的發(fā)育機制[9]。Holmstrom等通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)法AtTPS1轉(zhuǎn)入煙草中,經(jīng)干燥處理后發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因株系葉片中AtTPS1表達量較野生型株系葉片高,離體24h后仍保持鮮葉狀態(tài)[10]。因此,推測MaTPS2可能參與調(diào)控香蕉抗旱機制。圖2不同植物中TPS氨基酸序列的進化樹分析2.3MaTPS2在香蕉不同器官中表達分析MaTPS2在香蕉植株的根、球莖、假莖、葉、花各器官中均有表達,其中在球莖、假莖和葉中表達量較多,在果實中表達量最低(見圖3)。2.4MaTPS2在不同脅迫下的特異性表達分析提取經(jīng)5種非生物脅迫下香蕉根系總RNA,利用qPCR分析根系中MaTPS2的表達量看出,干旱處理使MaTPS2的表達量增加,在6h時達到極顯著,在12、24h時表達量下降,但高于正常條件下MaTPS2表達量。ACC脅迫處理下,MaTPS2表達量顯著下降,隨著時間延長而減少,24h時MaTPS2表達量降到最低值,接近于
【作者單位】: 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院海口實驗站;華中農(nóng)業(yè)大學(xué);中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶作物生物技術(shù)研究所;海南省林業(yè)科學(xué)研究所;
【基金】:農(nóng)業(yè)部重點實驗室開放式課題(RRI-KLOF1403) “十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國家科技計劃(2011AA10020605) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(CARS-32) 海南省重點項目(ZDXM2015045) 海南省香蕉遺傳改良重點實驗室和�?谑邢憬镀贩N研究重點實驗室資助
【分類號】:S668.1


本文編號:2527238

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