【摘要】：利用共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析法(WGCNA)篩選出合浦珠母貝外套膜在高溫脅迫下影響顯著的1個(gè)響應(yīng)基因模塊和海水酸化脅迫下的5個(gè)響應(yīng)基因模塊,并對(duì)模塊中包含的基因進(jìn)行功能富集;分析貝殼蛋白與模塊其他基因的關(guān)聯(lián)性,構(gòu)建礦化基因的應(yīng)激網(wǎng)絡(luò)。高溫顯著響應(yīng)模塊基因富集結(jié)果顯示細(xì)胞骨架蛋白發(fā)生了顯著的變化,如ARHGEF4、SAP和myosin。酸化應(yīng)答模塊共5個(gè),響應(yīng)的基因包括呼吸相關(guān)的血紅素A合成酶、芳香族氨基酸代謝相關(guān)的酶、鈣粘蛋白和血小板反應(yīng)蛋白等。另外,高溫應(yīng)答模塊聚集了最多礦化基因,包括MSI、Tyrosinase、Fibronectin-like protein等重要的礦化基因,說明這些礦化基因?qū)囟容^為敏感。構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的結(jié)果顯示鈣離子結(jié)合蛋白、細(xì)胞骨架蛋白、蛋白質(zhì)糖基化相關(guān)的基因關(guān)系密切。
[Abstract]:using the co-expression network analysis method (WGCNA) to screen out the five response gene modules under high temperature stress and the five response gene modules under the seawater acidification stress, and carrying out function enrichment on the genes contained in the module; The relationship between the shell protein and other genes of the module is analyzed, and the stress network of the mineralization gene is constructed. The high temperature significant response module gene enrichment results in significant changes in the cell skeletal protein, such as ARHGEF4, SAP, and myosin. The response genes include respiration-related heme A synthetase, the enzyme related to the metabolism of aromatic amino acid, the calcium-binding protein and the platelet-reactive protein. In addition, the high-temperature response module gathers the most mineralization genes, including the important mineralization genes such as MSI, Tyrosinase, and Fironectin-like protein, indicating that these mineralization genes are sensitive to the temperature. The results of the gene co-expression network show that the calcium ion binding protein, the cytoskeleton protein and the protein glycosylation related genes are closely related.
【作者單位】： 中國科學(xué)院大學(xué) 廣東海洋大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院 廣東省珍珠養(yǎng)殖與加工工程技術(shù)研究中心 中國科學(xué)院海洋研究所
【基金】：現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(CARS-48)項(xiàng)目 山東省泰山學(xué)者攀登計(jì)劃共同資助
【分類號(hào)】：S917.4

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2502444