【摘要】：葫蘆素類是主要分布于葫蘆科植物中具有多種醫(yī)藥活性的四環(huán)三萜類化合物,目前藥用葫蘆素原料主要從甜瓜蒂中提取。該研究從甜瓜中克隆葫蘆素類合成關(guān)鍵酶——鯊烯合酶(SQS)的基因,并對其序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:DNA測序和BLASTRefSeqGene分析表明,克隆的甜瓜SQS基因片段具有完整的該酶基因開放閱讀框架(ORF)序列。ORF分析顯示,甜瓜SQS由417氨基酸殘基構(gòu)成,等電點為7.56。對推衍的甜瓜SQS氨基酸序列分析結(jié)果提示,該酶二級結(jié)構(gòu)以α螺旋為主。結(jié)構(gòu)域預(yù)測結(jié)果表明,SQS屬于異戊二烯合酶家族,具有法呢�；姿峒版V離子的結(jié)合位點。三級結(jié)構(gòu)預(yù)測提示,甜瓜SQS為單體酶,其活性中心主要由幾個α螺旋圍繞形成的穴狀結(jié)構(gòu)。磷酸化位點分析顯示,S~(48)處于酶活性中心相關(guān)~(47)VSRSF~(52)的模體中,而S~(196)是正選擇位點,提示這兩處磷酸化位點可能是甜瓜SQS酶活性調(diào)節(jié)的關(guān)鍵部位。以甜瓜SQS基因ORF序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹的系統(tǒng)發(fā)生分類結(jié)果與形態(tài)學(xué)分類結(jié)果一致。該研究結(jié)果為葫蘆素類的生物合成調(diào)控研究提供了新的線索和實驗依據(jù)。
[Abstract]:Cucurbitins are tetracyclic triterpenes mainly distributed in cucurbitaceae with many kinds of medical activity. at present, medicinal cucurbitins are mainly extracted from melon butts. In this study, the gene of squalene polymerase (SQS), a key enzyme of cucurbitine synthesis, was cloned from muskmelon and its sequence was analyzed by bioinformatics. The results showed that DNA sequencing and BLASTRefSeqGene analysis showed that the cloned muskmelon SQS gene fragment had a complete open reading frame (ORF) sequence of the enzyme gene. ORF analysis showed that muskmelon SQS was composed of 417amino acid residues, and the isoelectric point was 7.56. The results of SQS amino acid sequence analysis showed that the secondary structure of the enzyme was 偽 helix. The results of domain prediction show that SQS belongs to the isoprene enzyme family and has the binding sites of farinyl diphosphate and magnesium ions. The prediction of tertiary structure suggests that muskmelon SQS is a monomer enzyme, and its active center is mainly formed by several 偽 helix around the hole structure. The analysis of phosphorylation sites showed that S48 was in the motif of 47 VSRSF~ (52) associated with enzyme activity, and S196 was a positive selective site, suggesting that these two phosphorylation sites might be the key sites for the regulation of SQS enzyme activity in muskmelon. The results of phylogenetic classification based on the ORF sequence of muskmelon SQS gene were consistent with those of morphological classification. The results provide a new clue and experimental basis for the regulation of cucurbitins biosynthesis.
【作者單位】： 桂林醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室;廣西醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31260069) 廣西高等學(xué)校優(yōu)秀中青年骨干教師培養(yǎng)工程項目~~
【分類號】：S652;Q946

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：2500378