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文心蘭鐵氧還蛋白基因克隆定位及表達分析

發(fā)布時間:2019-06-03 02:09
【摘要】:采用RACE-PCR法,從‘小櫻桃’文心蘭中克隆到一個全長989bp的鐵氧還蛋白基因cDNA序列,命名為OnFd(登錄號KX461907)。OnFd基因開放閱讀框長為465bp,預(yù)測可編碼154個氨基酸;gDNA和cDNA序列比對結(jié)果顯示OnFd基因不含內(nèi)含子。生物信息學(xué)分析表明,OnFd具有1個典型的[2Fe-2S]結(jié)構(gòu)域;同源分析顯示,OnFd與玉米Fd3的相似度最高(64.29%)。蛋白亞細胞定位結(jié)果顯示OnFd定位于葉綠體。實時熒光定量PCR檢測發(fā)現(xiàn):OnFd基因在花中表達量最高,其次是葉與根,在假鱗莖中表達量最低;接種病原菌研究顯示,文心蘭感染軟腐病后,各個部位的OnFd基因表達量均呈上升趨勢,尤其是接種部位假鱗莖在接種病原菌1d后表達量便表現(xiàn)出極顯著上調(diào),并且在5個感病階段的表達量是健康植株的2.83~3.98倍。研究表明,OnFd基因可能在文心蘭響應(yīng)抗軟腐病過程中具有重要作用。
[Abstract]:A full-length 989bp cDNA sequence of ferredoxin gene, named OnFd (the length of open reading frame of accession number KX461907). OnFd gene was 465bp), was cloned from 'Cherry' Wenxin orchid by RACE-PCR, and it was predicted that it could encode 154amino acids. The results of gDNA and cDNA sequence alignment showed that OnFd gene did not contain introns. Bioinformatics analysis showed that OnFd had a typical [2Fe-2S] domain, and homology analysis showed that the similarity between OnFd and corn Fd3 was the highest (64.29%). The results of protein subcellular localization showed that OnFd was located in chloroplast. Real-time fluorescence quantitative PCR showed that the expression of OnFd gene was the highest in flowers, followed by leaves and roots, and the lowest in pseudo-bulb. The study of inoculated pathogenic bacteria showed that the expression of OnFd gene in all parts of Euphorbia pulcherrima increased significantly after inoculated with soft rot, especially after 1 day of inoculating pathogen. The expression of 2.83 脳 3.98 times as much as that of healthy plants in five susceptible stages. Studies have shown that OnFd gene may play an important role in the response of Wenxinlan to soft rot resistance.
【作者單位】: 福建農(nóng)林大學(xué)園藝植物生物工程研究所;
【基金】:福建省重大科技專項(2015NZ0002-1)
【分類號】:S682.31

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本文編號:2491592

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