【摘要】：富含亮氨酸重復序列類受體蛋白激酶(LRR-RLK)是類受體激酶(RLK)中最大的一個亞家族,它主要對植物生長、發(fā)育以及環(huán)境脅迫等方面進行調控。在本文中,我們首先利用已知數據庫(Phytozome、Smart、Softberry等)進行同源檢索和序列分析,得到234個番茄(Solanum lycopersicum,品種為亨氏1706)LRR-RLK基因(以下簡稱SlLRR-RLK);隨后根據其蛋白全長序列相似性構建了系統(tǒng)發(fā)生進化樹,將這些基因分為10個亞家族。然后我們利用MEME在線網站,分別分析了番茄各個亞家族基因胞外受體結合域(LRR域)和胞內激酶域(RLK域)的保守基序結構(Motif)的組成和排列的復雜程度,結果表明不同的亞家族呈現不同的特異性,這暗示其功能也具有多樣性。由于串聯重復在其他物種中是引起基因數目擴增的主要原因,我們分析得到在番茄中僅有12%(29/234)的基因構成串聯重復。最后我們利用實時熒光定量PCR(qRT-PCR)分析了在番茄各個組織器官中特異表達的基因,獲得一些在番茄果實發(fā)育和軟化階段表達量水平出現差異的基因,包括solyc02g081070、solyc03g118510、solyc05g007120、solyc09g055570、solyc12g010740、solyc02g091840,結果表明SlLRR-RLK基因家族在果實發(fā)育和軟化方面也存在著一定的功能,而這方面的研究至今未見報道。本文結合生物信息學和實時熒光定量PCR技術手段,首次分析和預測了茄科植物番茄(亨氏1706)LRR-RLK基因家族在果實發(fā)育和軟化方面的主要功能,將為PlLRR-RLK基因家族對果肉型植物的不同果實發(fā)育階段的功能研究提供重要的理論依據。
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【學位授予單位】：天津大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：Q943.2

【參考文獻】

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本文編號：2491332