【摘要】：以已報道的甜瓜果斑病的致病基因和多個與致病性相關(guān)的未知蛋白為試材,采用生物信息學(xué)方法研究了其致病基因,并且利用生物信息學(xué)的工具和軟件分析這些未知蛋白,以期為今后從分子水平防治果斑病奠定理論基礎(chǔ)。結(jié)果表明:通過DNAMAN軟件的比對分析,得到3個綜合匹配程度較高的未知蛋白,預(yù)測這些蛋白是由該病菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)的hrp基因簇編碼;通過Bioedit和ProtParam軟件工具分析獲得6個未知蛋白的氨基酸組成、大小、分子質(zhì)量、理論等電點和疏水性;同時運用DNAMAN軟件分析得到相對應(yīng)的二級結(jié)構(gòu)。該研究結(jié)果可為今后深入研究此類基因提供指導(dǎo)作用。
[Abstract]:The pathogenic genes of muskmelon fruit spot disease and several unknown proteins related to pathogenicity were studied by bioinformatics method, and the unknown proteins were analyzed by bioinformatics tools and software. In order to lay a theoretical foundation for the prevention and treatment of fruit spot disease at the molecular level in the future. The results showed that three unknown proteins with high degree of comprehensive matching were obtained by DNAMAN software comparison and analysis, and it was predicted that these proteins were encoded by the hrp gene cluster of the type III secretory system of the pathogen. The amino acid composition, size, molecular weight, theoretical isoelectric point and hydrophobicity of six unknown proteins were obtained by Bioedit and ProtParam software tools, and the corresponding secondary structures were obtained by DNAMAN software analysis. The results of this study can provide guidance for the further study of this kind of genes in the future.
【作者單位】： 新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(31260258)
【分類號】：S436.5

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3 ;[J];;年期

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3 通訊員 萬霞 張雯怡 記者 劉志偉;我科學(xué)家發(fā)現(xiàn)特發(fā)性基底節(jié)鈣化致病基因[N];科技日報;2012年

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5 盧蘇燕;中法科學(xué)家發(fā)現(xiàn)房顫致病基因——ＫＣＮＱ１[N];經(jīng)濟參考報;2003年

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10 記者田泓;我科學(xué)家發(fā)現(xiàn)家族性心房顫動致病基因[N];人民日報;2003年

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1 方明宏;基于熱擴散模型的致病基因預(yù)測方法研究[D];華中師范大學(xué);2015年

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6 劉笑逸;基于異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)模型的致病基因預(yù)測算法[D];西安電子科技大學(xué);2013年

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8 高次子;一原發(fā)性開角型青光眼家系的臨床特點及致病基因的篩查[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2011年

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本文編號：2485849