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青香蕉蘋果MdAFS基因序列與表達模式分析

發(fā)布時間:2019-05-17 01:36
【摘要】:以青香蕉蘋果葉片為材料,研究青香蕉蘋果‘White Winter Pearmain’α-法尼烯合酶(α-farnesene synthase,Md AFS)全長基因結(jié)構(gòu)特征及編碼蛋白質(zhì)性質(zhì),分析Md AFS基因的誘導表達模式。采用生物信息學軟件對Md AFS及其編碼蛋白質(zhì)進行詳細分析,應用MEGA 6.0對不同物種來源的AFS構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,利用q RT-PCR技術(shù)研究Md AFS誘導表達模式。α-法尼烯合酶基因(Gen Bank No:AY563622)全長1 731 bp,由576氨基酸組成,是α螺旋為主要構(gòu)成元件的混合型蛋白。不同物種的α-法尼烯合酶氨基酸序列相似度低,但α-法尼烯合酶N端RRx8W和C端的H-α1loop具有高度保守性。非生物脅迫和激素信號能誘導Md AFS基因上調(diào)表達,且MV、ABA和Me JA誘導該基因上調(diào)表達更加明顯。α-法尼烯合酶氨基酸序列相似度低,但蛋白三維結(jié)構(gòu)相似;α-法尼烯合酶在蛋白結(jié)構(gòu)和功能上具有單萜合酶特征,初步揭示了非生物脅迫和激素信號能誘導青香蕉蘋果α-法尼烯代謝途徑的關(guān)鍵酶Md AFS基因上調(diào)表達。
[Abstract]:The structural characteristics and coding protein properties of the full-length gene of 'White Winter Pearmain' 偽-farneenase (偽-farnesene synthase,Md AFS) in green banana apple leaves were studied, and the induced expression pattern of Md AFS gene was analyzed. The Md AFS and its encoded proteins were analyzed in detail by bioinformatics software, and the phylogenetic tree of AFS from different species was constructed by MEGA 6.0. The expression pattern induced by Md AFS was studied by Q RT-PCR. The full length 1731 bp, of 偽-farneenase gene (Gen Bank No:AY563622 is composed of 576amino acids and is a mixed protein with 偽 helix as the main component. The amino acid sequence similarity of 偽-farneenase in different species is low, but the N-terminal RRx8W of 偽-farneene enzyme and the H-偽 1loop of C-terminal are highly conserved. Abiotic stress and hormone signal could up-regulate the expression of Md AFS gene, and the up-regulation expression of Md AFS gene induced by MV,ABA and Me JA was more obvious. The amino acid sequence similarity of 偽-farinenase was low, but the three-dimensional structure of protein was similar. 偽-farneene enzyme has the characteristics of monoterpenoids in protein structure and function, which preliminarily reveals that abiotic stress and hormone signal can induce the up-expression of Md AFS gene, the key enzyme of 偽-farinene metabolic pathway in green banana apple.
【作者單位】: 山東農(nóng)業(yè)大學生命科學院作物生物學國家重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金項目(31370359)
【分類號】:Q943.2;S661.1

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