【摘要】：從蘋果全基因組范圍內(nèi)共鑒定出13個(gè)YABBY基因,通過聚類分析將其分為YAB1/YAB3、YAB2、INO、YAB5和CRC 5個(gè)亞家族。Md YABBY基因分布在蘋果的9條染色體上,在第16條染色體上分布最多。Md YABBY蛋白長度介于60~538個(gè)氨基酸,等電點(diǎn)為4.84~9.81,所有Md YABBY蛋白都包含有鋅指結(jié)構(gòu)和YABBY兩個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,同一個(gè)亞家族內(nèi)的成員表現(xiàn)出相似的基因結(jié)構(gòu)和蛋白保守基序分布;基因順式作用元件分析發(fā)現(xiàn),Md YABBY基因包含許多與抗逆和激素響應(yīng)有關(guān)的作用元件�；虮磉_(dá)分析發(fā)現(xiàn),Md YABBY基因在花、果和葉中的表達(dá)量較高,5個(gè)Md YABBY基因在果實(shí)發(fā)育的3個(gè)時(shí)期均明顯地上調(diào)表達(dá)。
[Abstract]:A total of 13 YABBY genes were identified from the whole genome of apple and divided into 5 subfamilies YAB1/YAB3,YAB2,INO,YAB5 and CRC by cluster analysis. Md YABBY gene was distributed on 9 chromosomes of apple. The maximum length of. Md YABBY protein on chromosome 16 was between 60 and 538 amino acids, and the isoelectric point was 4.84 and 9.81. All Md YABBY proteins contained two conserved domains: zinc finger structure and YABBY. The members of the same subfamily showed similar gene structure and protein conserved motif distribution. Cis-acting element analysis revealed that the, Md YABBY gene contained many elements related to stress resistance and hormone response. Gene expression analysis showed that the expression of, Md YABBY gene was higher in flowers, fruits and leaves, and the expression of 5 Md YABBY genes was up-regulated at three stages of fruit development.
【作者單位】： 西北農(nóng)林科技大學(xué)園藝學(xué)院;
【基金】：國家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2013BAD20B03) 國家星火計(jì)劃項(xiàng)目(2014GA850002) 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目(CARS-28) 國家蘋果改良中心楊凌分中心,陜西省農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新與攻關(guān)項(xiàng)目(2015NY114) 陜西省果業(yè)發(fā)展協(xié)同中心和陜西果業(yè)發(fā)展項(xiàng)目
【分類號】：S661.1

【參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：2460720