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基于核基因和葉綠體基因的臺灣水韭遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的分析

發(fā)布時間:2019-04-08 15:30
【摘要】:利用核基因和葉綠體基因?qū)ε_灣水韭(Isoetes taiwanensis Devol)2個居群20個樣本的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,并對臺灣水韭的保育提出了建議。核基因的檢測結(jié)果顯示,2個居群共存在18個單倍型,單倍型多樣性為0.9842,核苷酸多樣性為0.00215,居群間基因流N_m為4.26,居群間分化系數(shù)G_(st)值為0.05543;葉綠體DNA的檢測結(jié)果顯示,單倍型數(shù)目為6,單倍型多樣性為0.6211,核苷酸多樣性為0.00326。其中臺北居群的單倍型多樣性和核苷酸多樣性均比金門居群高。核基因和葉綠體基因的AMOVA分析顯示,居群內(nèi)的遺傳差異遠(yuǎn)高于居群間。臺灣水韭的核苷酸多樣性相對其他水韭屬植物較低,可能與臺灣水韭的染色體倍型以及狹域分布有關(guān)。居群結(jié)構(gòu)的形成可能和基因流以及奠基者效應(yīng)有關(guān)。宜采用原地和遷地保護的方法對居群進(jìn)行保護。
[Abstract]:The genetic diversity and genetic structure of 20 samples from two populations of (Isoetes taiwanensis Devol) were analyzed by using nuclear gene and chloroplast gene, and some suggestions for conservation of Allium solani were put forward. The results of nuclear gene analysis showed that there were 18 haplotypes in the two populations, the diversity of haplotypes was 0.9842, the diversity of nucleotides was 0.00215, and the flow of gene between populations was 4.26, The G _ (st) value of population differentiation coefficient was 0.05543; The results of chloroplast DNA showed that the number of haplotypes was 6, the diversity of haplotypes was 0.6211, and the diversity of nucleotide was 0.00326. The haplotype diversity and nucleotide diversity of Taipei population were higher than those of Jinmen population. AMOVA analysis of nuclear gene and chloroplast gene showed that the genetic difference among populations was much higher than that among populations. The nucleotide diversity of Allium solanum is lower than that of other species, which may be related to chromosome ploidy and narrow distribution of Allium taiwanensis. The formation of population structure may be related to gene flow and founder effect. The method of in-situ and in-situ protection should be adopted to protect the population.
【作者單位】: 武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院植物系統(tǒng)學(xué)與進(jìn)化生物學(xué)實驗室;武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院實驗教學(xué)中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(31170203,30870168)~~
【分類號】:Q943.2

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本文編號:2454694

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