【摘要】：肽聚糖識(shí)別蛋白(PGRPs)是機(jī)體先天免疫系統(tǒng)中的重要模式識(shí)別受體,研究對(duì)三角帆蚌的一種短型肽聚糖識(shí)別蛋白進(jìn)行了克隆與表達(dá)分析。研究采用5′、3′RACE技術(shù),對(duì)高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所得三角帆蚌PGRPS3基因(hc PGRPS3)片段分別進(jìn)行了5′,3′末端克隆,經(jīng)拼接得到hc PGRPS3 c DNA全長(zhǎng)序列。采用多種分子生物學(xué)軟件對(duì)hc PGRPS3 c DNA全長(zhǎng)序列進(jìn)行了特征分析,實(shí)時(shí)熒光定量(q RT-PCR)檢測(cè)了其組織分布,及經(jīng)肽聚糖(Peptidoglycan,PGN)和脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)刺激后其在肝胰腺中的基因表達(dá)變化。hc PGRPS3 c DNA全長(zhǎng)1438 bp,開(kāi)放閱讀框?yàn)?58 bp,編碼285個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)分子量大小為32.3 ku,p H 7.0時(shí)的理論等點(diǎn)為7.98。序列中不存在信號(hào)肽與跨膜結(jié)構(gòu)。氨基酸序列保守性分析表明,其他物種短型PGRP中,以夏威夷短尾魷PGRP4與hc PGRPS3同源性最高(51%)。q RT-PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,hc PGRPS3在性腺及肝胰腺中表達(dá)水平較高。經(jīng)PGN或LPS刺激后,肝胰腺中hc PGRPS3表達(dá)水平顯著上調(diào),表明hc PGRPS3可能在機(jī)體抗菌免疫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。
[Abstract]:Peptidoglycan recognition protein (PGRPs) is an important pattern recognition receptor in the innate immune system of human body. A short peptidoglycan recognition protein of Hyriopsis cumingii was cloned and expressed. In this study, the PGRPS3 gene (hc PGRPS3) fragment of Hyriopsis cumingii (Hyriopsis cumingii) obtained from high-throughput transcript group sequencing was cloned by 5-and 3-race techniques, respectively. The full-length hc PGRPS3 c-DNA sequence was obtained by splicing. The full length sequence of hc PGRPS3 c DNA was characterized by various molecular biological software. Real time fluorescence quantitative (Q RT-PCR) was used to detect its tissue distribution, and Peptidoglycan,PGN and Lipopolysaccharide, were used to detect its tissue distribution. The open reading frame of hc PGRPS3 c DNA 1438 bp, encoded 285amino acids in hepatopancreas, and the predicted molecular weight was 32.3 ku,p H 7.0. The theoretical equivalence of hc PGRPS3 c DNA was 7.98 when the molecular weight was 32.3 ku,p H 7.0. The open reading frame of hc PGRPS3 c DNA was 1438 bp, and the open reading frame of hc PGRPS3 c DNA was 858 bp,. There was no signal peptide and transmembrane structure in the sequence. The conservative analysis of amino acid sequence showed that among the other short PGRP species, Hawaii squid PGRP4 had the highest homology with hc PGRPS3 (51%). Q RT-PCR), and the expression level of hc PGRPS3 in gonads and hepatopancreas was higher. After stimulation with PGN or LPS, the expression level of hc PGRPS3 in hepatopancreas was significantly up-regulated, suggesting that hc PGRPS3 may play an important role in anti-bacterial immune response.
【作者單位】： 江西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;江西農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31060359) 江西省自然科學(xué)基金(20122BAB204017)資助~~
【分類號(hào)】：S917.4

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本文編號(hào)：2454328