【摘要】：肽聚糖識別蛋白(PGRPs)是機體先天免疫系統(tǒng)中的重要模式識別受體,研究對三角帆蚌的一種短型肽聚糖識別蛋白進行了克隆與表達分析。研究采用5′、3′RACE技術,對高通量轉錄組測序所得三角帆蚌PGRPS3基因(hc PGRPS3)片段分別進行了5′,3′末端克隆,經拼接得到hc PGRPS3 c DNA全長序列。采用多種分子生物學軟件對hc PGRPS3 c DNA全長序列進行了特征分析,實時熒光定量(q RT-PCR)檢測了其組織分布,及經肽聚糖(Peptidoglycan,PGN)和脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)刺激后其在肝胰腺中的基因表達變化。hc PGRPS3 c DNA全長1438 bp,開放閱讀框為858 bp,編碼285個氨基酸,預測分子量大小為32.3 ku,p H 7.0時的理論等點為7.98。序列中不存在信號肽與跨膜結構。氨基酸序列保守性分析表明,其他物種短型PGRP中,以夏威夷短尾魷PGRP4與hc PGRPS3同源性最高(51%)。q RT-PCR檢測結果顯示,hc PGRPS3在性腺及肝胰腺中表達水平較高。經PGN或LPS刺激后,肝胰腺中hc PGRPS3表達水平顯著上調,表明hc PGRPS3可能在機體抗菌免疫反應中發(fā)揮重要作用。
[Abstract]:Peptidoglycan recognition protein (PGRPs) is an important pattern recognition receptor in the innate immune system of human body. A short peptidoglycan recognition protein of Hyriopsis cumingii was cloned and expressed. In this study, the PGRPS3 gene (hc PGRPS3) fragment of Hyriopsis cumingii (Hyriopsis cumingii) obtained from high-throughput transcript group sequencing was cloned by 5-and 3-race techniques, respectively. The full-length hc PGRPS3 c-DNA sequence was obtained by splicing. The full length sequence of hc PGRPS3 c DNA was characterized by various molecular biological software. Real time fluorescence quantitative (Q RT-PCR) was used to detect its tissue distribution, and Peptidoglycan,PGN and Lipopolysaccharide, were used to detect its tissue distribution. The open reading frame of hc PGRPS3 c DNA 1438 bp, encoded 285amino acids in hepatopancreas, and the predicted molecular weight was 32.3 ku,p H 7.0. The theoretical equivalence of hc PGRPS3 c DNA was 7.98 when the molecular weight was 32.3 ku,p H 7.0. The open reading frame of hc PGRPS3 c DNA was 1438 bp, and the open reading frame of hc PGRPS3 c DNA was 858 bp,. There was no signal peptide and transmembrane structure in the sequence. The conservative analysis of amino acid sequence showed that among the other short PGRP species, Hawaii squid PGRP4 had the highest homology with hc PGRPS3 (51%). Q RT-PCR), and the expression level of hc PGRPS3 in gonads and hepatopancreas was higher. After stimulation with PGN or LPS, the expression level of hc PGRPS3 in hepatopancreas was significantly up-regulated, suggesting that hc PGRPS3 may play an important role in anti-bacterial immune response.
【作者單位】： 江西師范大學生命科學學院;江西農業(yè)大學動物科學學院;
【基金】：國家自然科學基金項目(31060359) 江西省自然科學基金(20122BAB204017)資助~~
【分類號】：S917.4

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