【摘要】：[目的]對貴州黑山羊和黔北麻羊進(jìn)行RBP4基因多態(tài)位點(diǎn)的篩選,為從分子水平探究RBP4基因?qū)?dòng)物繁殖性能的調(diào)控機(jī)制提供理論依據(jù)。[方法]采用DNA混池結(jié)合直接測序法分析RBP4基因外顯子4在貴州黑山羊和黔北麻羊中的單核苷酸多態(tài)性,利用生物信息學(xué)軟件分析SNP位點(diǎn)對RBP4基因mRNA二級結(jié)構(gòu)的影響。[結(jié)果]RBP4基因外顯子4在貴州黑山羊和黔北麻羊中均存在4-T214C突變位點(diǎn),且為同義突變。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,外顯子4-T214C突變導(dǎo)致RBP4基因mRNA二級結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,自由能降低,結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性增大。[結(jié)論]在貴州黑山羊和黔北麻羊中檢測到RBP4基因外顯子4的1個(gè)SNP位點(diǎn),該突變位點(diǎn)影響了RBP4基因mRNA的二級結(jié)構(gòu)。
[Abstract]:[aim] to screen the polymorphic sites of RBP4 gene in Guizhou Black Sheep and Qianbei Ma Sheep, so as to provide a theoretical basis for exploring the regulatory mechanism of RBP4 gene on animal reproductive performance at molecular level. [methods] single nucleotide polymorphism of exon 4 of RBP4 gene in Guizhou Black Sheep and Northern Guizhou Ma Sheep was analyzed by DNA mixed pool and direct sequencing, and the effect of SNP locus on mRNA secondary structure of RBP4 gene was analyzed by bioinformatics software. [results] there were 4-T214C mutations in exon 4 of RBP4 gene in both Guizhou Black Sheep and Qianbei Ma Sheep, and they were synonymous mutations. The results of bioinformatics analysis showed that the mutation of exon 4-T214C resulted in the change of secondary structure of RBP4 gene mRNA, the decrease of free energy and the increase of structural stability. [conclusion] A SNP site of exon 4 of RBP4 gene was detected in Guizhou Black Sheep and Qianbei Ma Sheep, which affected the secondary structure of mRNA of RBP4 gene.
【作者單位】： 遵義市畜牧站;貴州大學(xué)高原山地動(dòng)物遺傳育種與繁殖省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院貴州省動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;貴州省種畜禽種質(zhì)測定中心;
【基金】：貴州省科技重大專項(xiàng)子項(xiàng)目(“黔北麻羊高繁殖力配套系建設(shè)及產(chǎn)業(yè)化示范”,黔科合重大專項(xiàng)字[2013]6008)
【分類號】：S827

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本文編號：2443431