【摘要】：采用基因組DNA提取法和目的基因PCR擴增對嗜線蟲致病桿菌(Xenorhabdus nematophila)HB310(Xn HB310)菌株中的pirA和pirB基因進行克隆及生物信息學分析。結(jié)果表明,pirA全長408 bp,pirB全長1 290 bp;其蛋白PirA分子量為14.9 kDa,含135個氨基酸,PirB分子量為48.2 kDa,含429個氨基酸;二級結(jié)構(gòu)分析表明PirA無α-螺旋,含12個β折疊,PirB含8個α螺旋和12個β折疊;亞細胞定位表明PirA和PirB主要分布在細胞核;PirA不含跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽,PirB含有跨膜結(jié)構(gòu)域和凝集素結(jié)構(gòu)域,不含信號肽。
[Abstract]:The pirA and pirB genes of (Xenorhabdus nematophila) HB310 (Xn HB310) were cloned and analyzed by genomic DNA extraction and PCR amplification. The results showed that the molecular weight of the protein PirA was 14.9 kDa, and the molecular weight of PirB was 48.2 kDa, and 429 amino acids, respectively. The total length of pirA 408 bp,pirB was 1 290 bp;, and the molecular weight of PirB was 14.9 kDa,. The secondary structure analysis showed that there were no 偽-helix in PirA, 12 尾-folds in PirB, 8 偽-helix and 12 尾-fold in PirB, subcellular localization showed that PirA and PirB were mainly distributed in nucleus. PirA contains no transmembrane domain and signal peptide, while PirB contains transmembrane domain and lectin domain, and does not contain signal peptide.
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學植物保護學院;河北省承德市灤平國有林場管理處;
【基金】：河北省自然科學基金(C2016204107) 河北省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系棉花創(chuàng)新團隊(HBCT2013030201)
【分類號】：S476

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本文編號：2441032