【摘要】：采用基因組DNA提取法和目的基因PCR擴(kuò)增對(duì)嗜線蟲致病桿菌(Xenorhabdus nematophila)HB310(Xn HB310)菌株中的pirA和pirB基因進(jìn)行克隆及生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,pirA全長(zhǎng)408 bp,pirB全長(zhǎng)1 290 bp;其蛋白PirA分子量為14.9 kDa,含135個(gè)氨基酸,PirB分子量為48.2 kDa,含429個(gè)氨基酸;二級(jí)結(jié)構(gòu)分析表明PirA無α-螺旋,含12個(gè)β折疊,PirB含8個(gè)α螺旋和12個(gè)β折疊;亞細(xì)胞定位表明PirA和PirB主要分布在細(xì)胞核;PirA不含跨膜結(jié)構(gòu)域和信號(hào)肽,PirB含有跨膜結(jié)構(gòu)域和凝集素結(jié)構(gòu)域,不含信號(hào)肽。
[Abstract]:The pirA and pirB genes of (Xenorhabdus nematophila) HB310 (Xn HB310) were cloned and analyzed by genomic DNA extraction and PCR amplification. The results showed that the molecular weight of the protein PirA was 14.9 kDa, and the molecular weight of PirB was 48.2 kDa, and 429 amino acids, respectively. The total length of pirA 408 bp,pirB was 1 290 bp;, and the molecular weight of PirB was 14.9 kDa,. The secondary structure analysis showed that there were no 偽-helix in PirA, 12 尾-folds in PirB, 8 偽-helix and 12 尾-fold in PirB, subcellular localization showed that PirA and PirB were mainly distributed in nucleus. PirA contains no transmembrane domain and signal peptide, while PirB contains transmembrane domain and lectin domain, and does not contain signal peptide.
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院;河北省承德市灤平國(guó)有林場(chǎng)管理處;
【基金】：河北省自然科學(xué)基金(C2016204107) 河北省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系棉花創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(HBCT2013030201)
【分類號(hào)】：S476

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 龔永興;楊懷文;楊秀芬;劉崢;袁京京;;嗜線蟲致病桿菌北京變種的型變進(jìn)程及抗生素相關(guān)性質(zhì)的研究[J];河北農(nóng)業(yè)科學(xué);2007年02期

2 龔永興;楊懷文;楊秀芬;劉崢;袁京京;;嗜線蟲致病桿菌北京變種基因組文庫(kù)的構(gòu)建及抗生素活性克隆的篩選[J];中國(guó)生物防治;2007年04期

3 龔永興;楊懷文;楊秀芬;劉崢;袁京京;;嗜線蟲致病桿菌北京變種質(zhì)粒形態(tài)的研究[J];植物保護(hù);2008年05期

4 袁京京,楊秀芬,簡(jiǎn)恒,楊懷文,龐在堂;嗜線蟲致病桿菌高產(chǎn)菌株的選育[J];中國(guó)生物防治;2004年01期

5 黃武仁;楊秀芬;楊懷文;劉崢;袁京京;;嗜線蟲致病桿菌的抑菌物質(zhì)及抑菌活性[J];天然產(chǎn)物研究與開發(fā);2006年01期

6 安欣;王國(guó)紅;王永宏;張興;;伯氏嗜線蟲致病桿菌Xenorhabdus bovienii YL002對(duì)4種抗生素抗性突變株的篩選及抑菌活性分析[J];中國(guó)生物防治學(xué)報(bào);2012年04期

7 李明華,宮春波,王萍;嗜線蟲致病桿菌CB6菌株培養(yǎng)特性的初步研究[J];微生物學(xué)雜志;2005年04期

8 張園;南宮自艷;王勤英;文旭;;嗜線蟲致病桿菌HB310對(duì)五種蘋果病原菌抑菌活性的影響[J];北方園藝;2012年20期

9 楊秀芬,楊懷文,簡(jiǎn)恒,劉崢,袁京京;高毒力殺蟲細(xì)菌嗜線蟲致病桿菌CB6菌株的培養(yǎng)基優(yōu)化[J];中國(guó)生物防治;2004年02期

10 潘映紅,楊秀芬,楊夕慶,李艷飛,劉崢,簡(jiǎn)恒,楊懷文;嗜線蟲致病桿菌CB6菌株對(duì)棉鈴蟲的生物活性[J];中國(guó)生物防治;2004年04期

相關(guān)會(huì)議論文 前7條

1 曾洪梅;魏明敏;邱德文;楊秀芬;袁京京;楊懷文;;嗜線蟲致病桿菌遺傳轉(zhuǎn)化體系的建立及抗生素生物合成相關(guān)基因的研究[A];中國(guó)微生物學(xué)會(huì)《第二屆全國(guó)農(nóng)業(yè)微生物研究及產(chǎn)業(yè)化研討會(huì)》和《第十一屆全國(guó)殺蟲微生物學(xué)術(shù)研討會(huì)》暨《湖北省暨武漢市微生物學(xué)會(huì)和內(nèi)蒙古微生物學(xué)會(huì)2008年會(huì)》論文摘要[C];2008年

2 楊秀芬;楊懷文;簡(jiǎn)恒;劉崢;袁京京;;嗜線蟲致病桿菌北京變種控制植物疫病[A];第三屆全國(guó)綠色環(huán)保農(nóng)藥新技術(shù)、新產(chǎn)品交流會(huì)暨第二屆全國(guó)生物農(nóng)藥研討會(huì)論文集[C];2004年

3 黃武仁;朱昌雄;楊秀芬;楊懷文;許鴻章;簡(jiǎn)恒;;嗜線蟲致病桿菌代謝產(chǎn)物CB6-1的提取、分離與結(jié)構(gòu)鑒定[A];第三屆全國(guó)綠色環(huán)保農(nóng)藥新技術(shù)、新產(chǎn)品交流會(huì)暨第二屆全國(guó)生物農(nóng)藥研討會(huì)論文集[C];2004年

4 王歡;王勤英;李國(guó)勛;張翠芝;;嗜線蟲致病桿菌HB310-27菌株對(duì)幾種害蟲的殺蟲活性[A];我國(guó)2003年草原病蟲鼠害發(fā)生與防治情況以及2004年發(fā)生趨勢(shì)預(yù)測(cè)與防治對(duì)策研討會(huì)論文集[C];2004年

5 楊云艷;孔繁芳;李立濤;南宮自艷;宋萍;王勤英;;嗜線蟲致病桿菌對(duì)Bt抗性種群小菜蛾的毒力以及與Bt協(xié)同增效作用[A];公共植保與綠色防控[C];2010年

6 曾洪梅;邱德文;楊秀芬;張雨良;尹富仕;楊懷文;;嗜線蟲致病桿菌昆蟲拒食蛋白的研究[A];2008年中國(guó)微生物學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2008年

7 李立濤;文旭;趙亞楠;孔繁芳;王勤英;;嗜線蟲致病桿菌與七種殺蟲劑混配的增效作用[A];公共植保與綠色防控[C];2010年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

1 龔永興;嗜線蟲致病桿菌北京變種抗生素抗性相關(guān)基因的研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2006年

2 劉崢;嗜線蟲致病桿菌CB6菌株殺蟲活性相關(guān)分子機(jī)制[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2003年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 郭薔薇;EnvZ/OmpR及環(huán)境pH調(diào)控嗜線蟲致病桿菌YL001抑菌活性的初步研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

2 許鵬;嗜線蟲致病桿菌YL001抑菌活性成分研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

3 薛仁風(fēng);伯氏嗜線蟲致病桿菌蛋白酶抑制因子基因的克隆、表達(dá)及生物活性的研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2009年

4 馮珊珊;嗜線蟲致病桿菌對(duì)非靶標(biāo)生物的安全性評(píng)價(jià)[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

5 史翠紅;嗜線蟲致病桿菌對(duì)小菜蛾作用方式及殺蟲機(jī)理的研究[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

6 楊君;嗜線蟲致病桿菌血腔毒素的純化及其致病機(jī)理的研究[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

7 楊云艷;嗜線蟲致病桿菌Xnpt毒素酶解特性的研究[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

8 文旭;嗜線蟲致病桿菌HB310菌株幾丁質(zhì)酶基因的克隆及其可濕性粉劑的研制[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

9 李立濤;嗜線蟲致病桿菌的殺蟲機(jī)理及其水懸浮劑的研究[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

10 張園;嗜線蟲致病桿菌Txp40蛋白毒素的分離純化及作用靶標(biāo)的研究[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

，

本文編號(hào)：2441032