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合成基因線路規(guī);O(shè)計(jì)面臨的挑戰(zhàn)

發(fā)布時(shí)間:2019-03-08 10:56
【摘要】:隨著合成基因線路規(guī)模的增加,傳統(tǒng)的合成基因線路設(shè)計(jì)思路的瓶頸逐漸凸顯,許多之前被忽略的因素對大規(guī)模基因線路的性能可能造成顯著影響,這對合成基因線路的設(shè)計(jì)帶來了新的挑戰(zhàn)。本文重點(diǎn)梳理了基因表達(dá)噪聲和競爭效應(yīng)兩方面對基因線路性能的影響,闡釋了二者間的緊密聯(lián)系,并基于理性設(shè)計(jì)的思路,從模擬-數(shù)字運(yùn)算設(shè)計(jì)、網(wǎng)絡(luò)拓?fù)湓O(shè)計(jì)、基因線路中的信息傳遞理論和動(dòng)態(tài)信號等方面,歸納總結(jié)了解決這些問題的潛在方案,并展望了規(guī);铣苫蚓路理性設(shè)計(jì)的未來發(fā)展方向。
[Abstract]:With the increase of the size of synthetic gene circuit, the bottleneck of traditional synthetic gene circuit design is becoming more and more prominent, and many previously neglected factors may have a significant impact on the performance of large-scale gene circuit. This brings new challenges to the design of synthetic gene circuits. This paper focuses on the influence of gene expression noise and competition effect on gene circuit performance, explains the close relationship between the two, and based on the rational design idea, from the analog-digital computing design, network topology design, In terms of information transmission theory and dynamic signal in gene circuits, the potential solutions to these problems are summarized, and the future development direction of rational design of large-scale synthetic gene circuits is prospected.
【作者單位】: 清華大學(xué)合成與系統(tǒng)生物學(xué)研究中心生物信息學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化系;清華信息科學(xué)與技術(shù)國家實(shí)驗(yàn)室(籌)生物信息學(xué)研究部;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(Nos.61322310,31371341) 清華大學(xué)自主科研項(xiàng)目(No.20141081175)資助~~
【分類號】:Q78

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本文編號:2436734

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