耐碳青霉烯類鮑曼不動(dòng)桿菌轉(zhuǎn)座子基因檢測(cè)及同源性分析
[Abstract]:Objective to investigate the distribution and homology of transposon gene Tn2006,Tn2008 of Acinetobacter baumannii, a carbapenem resistant drug, and to provide laboratory evidence for nosocomial infection control. Methods 91 strains of acinetobacter baumannii resistant to carbapenem were collected. Transposon genes Tn2006 and Tn2008, were detected by PCR and amplified products were sequenced and analyzed by BLAST. Repeat sequence primer polymerase chain reaction (REP-PCR) was used to analyze the homology of CRAB, multilocus sequence typing (multilocus sequence typing,MLST was used to analyze the homology of 23 CRAB strains, and Bio Numerics software was used to analyze the minimal spanning tree. Results among 91 CRAB strains, 40 strains were positive for Tn2006 gene and negative for Tn2008 gene. By using REP-PCR method, 91 strains of CRAB were divided into 7 types, namely, Acanthophora, EF and G, with 79 strains, 4 strains, 2 strains, 1 strain, 2 strains and 1 strain respectively. Type A was subdivided into two subtypes: A1 and A2, respectively. There were 46 strains and 33 strains, all the tested hospitals showed A strains. 23 strains of CRAB were classified into 8 ST types by MLST typing, including 9 ST92 type, 5 ST195 type, 3 ST365 type, 2 ST138 type, 1 ST75 type and 1 ST381 type. Two new STs types were found. STnl (1-15-3-2-2-56-3) and STn2 (1-81-3-2-2-3-3). Conclusion the clinical isolated CRAB in this area is prevalent, mainly A type, mainly transmitted by transposon Tn2006. ST92 and ST195 are the main ST types of CRAB in this area.
【作者單位】: 中南大學(xué)湘雅醫(yī)院;長(zhǎng)沙市第一醫(yī)院;
【基金】:中南大學(xué)中央高;究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金資助(No.2013zzts317) 湖南省發(fā)改委(湘發(fā)改高技[2012]1493號(hào)) 湖南省自然科學(xué)基金(No.14JJ7003)
【分類號(hào)】:R378
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,本文編號(hào):2419933
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