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興義鴨MEF2A基因克隆及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2019-01-04 13:53
【摘要】:為了獲取鴨MEF2A基因完整編碼區(qū)(CDS)序列,進(jìn)一步揭示其遺傳機理。本試驗采用興義鴨為研究對象,采用RT-PCR方法克隆獲取MEF2A基因CDS區(qū)序列,經(jīng)重組質(zhì)粒測序、拼接,試驗初步獲得了興義鴨MEF2A基因完整編碼區(qū)序列,得到1 479 bp片段,包含起始密碼子和終止密碼子,編碼492個氨基酸,表達(dá)蛋白分子量為53.14 k D。經(jīng)序列對比,在G~(429)A、T~(661)A、A~(1423)G、A~(1426)G和G~(1467)A分別發(fā)生了單核苷酸突變,其中T~(661)A和A~(1423)G突變分別導(dǎo)致Cys(半胱氨酸)到Ser(絲氨酸)、Glu(谷氨酸)到Lys(賴氨酸)的改變,其他位點均屬于同義突變。試驗對興義鴨MEF2A蛋白的理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)特點進(jìn)行了簡單分析,為下一步研究MEF2A蛋白特性及其作用機制奠定理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to obtain the complete coding region (CDS) sequence of duck MEF2A gene, the genetic mechanism was further revealed. In this experiment, Xingyi duck was used to clone and obtain the CDS sequence of MEF2A gene by RT-PCR method. After sequencing and splicing of recombinant plasmid, the complete coding region sequence of MEF2A gene of Xingyi duck was preliminarily obtained, and 1 479 bp fragment was obtained. It contains start codon and stop codon and encodes 492 amino acids, and the molecular weight of the expressed protein is 53.14 KD. By sequence comparison, single nucleotide mutations were observed in G429A429AT66A66A ~ (1423) G ~ (1426) G and G ~ (1467) A, respectively. T661A and A1423 G mutations resulted in the changes of Cys (cysteine) to Ser (serine), Glu (glutamic acid) to Lys (lysine), respectively. The other sites were synonymous mutations. The physical and chemical properties and structural characteristics of Xingyi duck MEF2A protein were analyzed in order to lay a theoretical foundation for the further study of the characteristics of MEF2A protein and its mechanism of action.
【作者單位】: 貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;高原山地動物遺傳育種與繁殖省部共建教育部重點實驗室;
【基金】:教育部科學(xué)技術(shù)研究重點項目“貴州省地方鴨品種屠宰性狀相關(guān)基因的克隆與SNPs檢測”(項目號:211168);鴨MEF2基因家族的克隆與組織表達(dá)規(guī)律的研究[黔科合LH字(2015)7677號]共同資助
【分類號】:S834

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本文編號:2400375

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