【摘要】：目的:黃芪作為傳統(tǒng)補氣中藥具有悠久歷史,從黃芪中已經(jīng)提取出多種有效成分。目前黃芪的基因組還未進行測序,因此基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預(yù)測基因模型,將有助于黃芪在醫(yī)藥領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用。方法:本文基于黃芪轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)以及已有的親緣關(guān)系相近物種全基因組序列,對黃芪轉(zhuǎn)錄組的unigene在基因組中的情況進行預(yù)測分析。結(jié)果:預(yù)測結(jié)果表明,黃芪和大豆Glycine max、蒺藜苜蓿Medicago truncatula、百脈根Lotus japonicus 3種植物有較近的親緣關(guān)系,和蒺藜苜蓿比對上的基因數(shù)目是2 039條,堿基相似度是90.14%;和大豆比對上的基因數(shù)是1 948條,堿基相似度是90.40%;和百脈根比對上的基因數(shù)是1 003條,堿基相似度是89.77%。結(jié)論:黃芪與3種植物比對上的基因在3種植物的各染色體上,以及染色體外基因組上均有分布。
[Abstract]:Objective: Astragalus membranaceus has a long history as a traditional Chinese medicine for tonifying qi, and many active components have been extracted from Astragalus membranaceus. At present, the genome of Astragalus membranaceus has not been sequenced, so predicting gene model based on transcriptome data will be helpful to the wide application of Astragalus in medicine field. Methods: based on the transcriptional data of Astragalus membranaceus (Astragalus membranaceus) and the whole genome sequence of related species, the unigene of Astragalus membranaceus transcriptiongroup in genome was predicted and analyzed. Results: the predicted results showed that there was a close relationship between Astragalus membranaceus and Soybean Glycine max, Tribulus terrestris Medicago truncatula, Alfalfa Lotus japonicus, the number of genes compared with Tribulus terrestris alfalfa was 2 039, and the similarity of base was 90.14%. The number of genes compared with soybean is 1 948, the similarity of base is 90.40, and the number of genes compared with 100 veins is 1 003, and the similarity of base is 89.77. Conclusion: the genes in comparison between Astragalus membranaceus and three species of plants are distributed on the chromosomes of the three species and on the genome outside the chromosomes.
【作者單位】： 黑龍江中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院;
【基金】：黑龍江省杰出青年基金(JC201101) 國家自然科學(xué)基金(81274010) 黑龍江中醫(yī)藥大學(xué)“優(yōu)秀創(chuàng)新人才支持計劃”(2012001) 哈爾濱市優(yōu)秀學(xué)科帶頭人基金(2014RFXXJ122) 黑龍江省教育廳科學(xué)技術(shù)研究項目(12541743)
【分類號】：S567.239

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