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酒酒球菌β-葡萄糖苷酶基因克隆及生物信息學分析

發(fā)布時間:2018-12-20 22:04
【摘要】:【目的】從分子水平上揭示酒酒球菌β-葡萄糖苷酶基因(bgl)的結構特點,為β-葡萄糖苷在酒酒球菌中的代謝研究提供理論依據(jù)。【方法】采用PCR法從4株優(yōu)良的酒酒球菌(SD-1d,SD-2gf,31-DH和NM-2c)中克隆目的基因,并對其編碼產(chǎn)物進行生物信息學分析。【結果】bgl基因含有一個完整的開放閱讀框,全長2 215 bp,編碼737個氨基酸,起始密碼子為TTG,終止密碼子為TAA。生物信息學分析均顯示該蛋白疏水性較弱,無信號肽,無跨膜區(qū),屬于糖苷水解酶家族3成員�!窘Y論】bgl基因編碼產(chǎn)物為1個81 625.3 u蛋白,具有一個明顯的β-葡萄糖苷酶活性位點,為非分泌蛋白,主要存在于細胞質中。
[Abstract]:[objective] to reveal the structural characteristics of 尾 -glucosidase gene (bgl) of Bacillus cereus at molecular level. To provide a theoretical basis for the study of 尾 -glucoside metabolism in Bacillus cereus. [methods] the target genes were cloned from four excellent strains of SD-1d,SD-2gf,31-DH and NM-2c by PCR method. The bgl gene contains a complete open reading frame. The total length of 2 215 bp, encodes 737 amino acids, and the initial codon is TTG, terminator codon is TAA.. Bioinformatics analysis showed that the protein had weak hydrophobicity, no signal peptide, no transmembrane region, and belonged to 3 members of the glycoside hydrolase family. [conclusion] the encoding product of bgl gene was 1 81 625.3 u protein. It has an obvious 尾-glucosidase activity site, which is a non-secretory protein and mainly exists in the cytoplasm.
【作者單位】: 西北農林科技大學葡萄酒學院;西北農林科技大學園藝學院;陜西省葡萄與葡萄酒工程技術研究中心;西北農林科技大學合陽葡萄試驗示范站;
【基金】:國家重點研發(fā)計劃項目(2016YFD0400504) 國家現(xiàn)代農業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系建設專項(nycytx-30-ch-03)
【分類號】:Q811.4;TS262.6

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