一種兼具生物和物理特征的E基因簽名方法——以p53家族基因?yàn)槔?/H1>
發(fā)布時(shí)間：2018-12-14 02:24
【摘要】：在原來(lái)的具有生物特性的基因簽名方法上,引入具有一定的物理特性的核苷酸游離電子的平均能量(EIIP),建立了一種新的E基因簽名方法。定義了兩序列間的E歐氏距離及e均方差公式,并對(duì)相關(guān)物種進(jìn)行層次聚類(lèi)分析。通過(guò)對(duì)20個(gè)物種的p53家族基因m RNA完整的CDS序列進(jìn)行E基因簽名得出,在每種基因中均有,物種關(guān)系越近,其基因簽名相似度越高。將聚類(lèi)結(jié)果與原來(lái)的基因簽名方法的聚類(lèi)結(jié)果作對(duì)比,發(fā)現(xiàn)了E基因簽名方法更準(zhǔn)確,從而更有利于深入了解p53家族基因的性質(zhì)。
[Abstract]:Based on the original genetic signature method with biological characteristics, a new E gene signature method was established by introducing the average energy (EIIP), of nucleotide free electrons with certain physical properties. The E Euclidean distance and e mean square error formula between two sequences are defined, and the related species are analyzed by hierarchical clustering. Based on the E gene signature of the complete CDS sequence of p53 gene m RNA from 20 species, it was found that the closer the species relationship was, the higher the similarity of gene signature was. By comparing the clustering result with that of the original gene signature method, it is found that the E gene signature method is more accurate, which is beneficial to the further understanding of the properties of p53 family genes.
【作者單位】： 江南大學(xué)理學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(No.11271163)
【分類(lèi)號(hào)】：Q811.4
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本文編號(hào)：2377738
本文鏈接：http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/2377738.html
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5 李文林;楊國(guó)宇;李宏基;郭豫杰;魯維飛;;豬Reg家族基因的克隆與原核表達(dá)[A];全國(guó)動(dòng)物生理生化第十一次學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2010年
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7 田望;侯聰聰;李樂(lè)攻;;OsHKT1;1和OsHKT1;5(SKC1)的電生理特性和調(diào)節(jié)[A];中國(guó)植物生理學(xué)會(huì)第十次會(huì)員代表大會(huì)暨全國(guó)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要匯編[C];2009年
8 李敏;郭遲鳴;張玉霞;趙婷婷;崔欣欣;王換樂(lè);陳亮;;DUF1644家族基因SIDP364＆SIDP361在鹽脅迫應(yīng)答中的功能研究[A];全國(guó)園藝植物生長(zhǎng)繁育技術(shù)及應(yīng)用研討會(huì)論文集[C];2012年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前5條
1 李秋蘋(píng);OsHAP家族基因的功能研究和粒形基因GL3.2的圖位克隆[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
2 張銳;棉花COL家族基因的鑒定、表達(dá)與進(jìn)化分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
3 張雁;維吉尼亞鏈霉菌IBL14中CYP105家族基因生理功能和甾醇類(lèi)定向轉(zhuǎn)化機(jī)理研究[D];安徽大學(xué);2017年
4 夏吉星;煙粉虱氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族基因注釋與功能分析及羧酸酯酶家族基因注釋[D];沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年
5 金丹;豬Sirtuin家族基因的克隆及脂肪生成中SIRT3的功能研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條
1 張超;84K楊HD2亞家族基因的克隆與表達(dá)分析[D];東北林業(yè)大學(xué);2015年
2 Nguyen Thi Hung（阮氏興）;小麥IQD家族基因的克隆及功能研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
3 沈雷定;MiR156家族基因在柑橘階段發(fā)育以及成花調(diào)控中的作用[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
4 王燕;飛蝗表皮蛋白Obstructor家族基因的分子特性及功能研究[D];山西大學(xué);2015年
5 顏麗美;GIS家族基因調(diào)控?cái)M南芥開(kāi)花的分子作用機(jī)制的初步研究[D];浙江大學(xué);2014年
6 姚文;福州若干野生蕉ISSR分析、離體繁殖及APX克隆與表達(dá)分析[D];福建農(nóng)林大學(xué);2015年
7 陳蘭平;甘蔗蔗糖磷酸合成酶家族基因演化和功能研究[D];福建師范大學(xué);2015年
8 潘舒;水稻OsTHE1家族基因結(jié)構(gòu)與功能的研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
9 田麗梅;番茄IMPα/β和LYK家族基因的鑒定、表達(dá)模式分析和功能研究[D];浙江大學(xué);2016年
10 張守偉;不同生育期組大豆品種FT家族基因的自然變異分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2016年
，本文編號(hào)：2377738
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