【摘要】：多穗柯具有甜味和保健功效,其中黃酮類化物是主要活性物質。為獲取多穗柯轉錄組數(shù)據(jù)庫以及黃酮類化合物生物合成相關基因,該研究用RNA-Seq中的Illumina Hi Seq 4000對多穗柯嫩葉進行轉錄組測序,共獲得6 Gb數(shù)據(jù),拼接后得到41 043條Unigene,與7個基因數(shù)據(jù)庫進行比對,可歸類于51個GO分類中,涉及到237個KEGG標準代謝通路。找到黃酮合成相關基因28條。通過Micro Satallite(MISA)軟件分析篩選到18 161個SSR,其中單堿基重復最豐富,有7 346個。此研究得到大量轉錄本信息,為多穗柯的分子生物學研究提供了寶貴的轉錄組數(shù)據(jù)庫資源。
[Abstract]:Corca polyphylla has sweet taste and health care, of which flavonoids are the main active substances. In order to obtain multipanicle offset transcriptional database and flavonoid biosynthesis related genes, Illumina Hi Seq 4000 in RNA-Seq was used to sequence the transcripts of young leaves. 6 Gb data were obtained and 41 043 Unigene, were obtained after splicing. Compared with 7 gene databases, it can be classified into 51 GO taxonomies, involving 237 KEGG standard metabolic pathways. 28 genes related to flavonoid synthesis were found. 18 161 SSR, were screened by Micro Satallite (MISA) software, among which the single base repeats were the most abundant, there were 7 346. A large number of transcripts were obtained in this study, which provided valuable transcriptome database resources for the molecular biology of Cortex mandshurica.
【作者單位】： 華北理工大學生命科學院;百色學院農(nóng)業(yè)與食品工程學院;
【基金】：國家自然科學基金項目(31570683) 河北省教育廳科研項目(QN2014102) 華北理工大學培育基金項目(SP201508)
【分類號】：S567.19

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本文編號：2370173