【摘要】：本試驗旨在對陸川豬FAM134B基因進(jìn)行克隆及生物信息學(xué)分析。本研究利用Gen Bank公布的豬序列設(shè)計引物,應(yīng)用RT-PCR擴(kuò)增得到目的基因片段,應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析和預(yù)測了陸川豬FAM134B基因的理化性質(zhì)與二級結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示:陸川豬FAM134B基因編碼區(qū)全長1 107 bp,編碼368個氨基酸;陸川豬FAM134B基因與與金華豬(JX854456.1)、牛(KM587693.1)、山羊(KF684947.1)、人(NM_001034850.2)、小鼠(NM_001034851.2)、大鼠(NM_001034912.1)、非洲爪蟾(NM_001126975.1)序列相似性分別為87.80%、87.44%、86.9%、68.47%、67.01%、67.29%、61.44%,結(jié)合系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,結(jié)果表明不同物種FAM134B基因在進(jìn)化過程中具有高度保守性。通過比較分析發(fā)現(xiàn),陸川豬FAM134B基因CDS序列區(qū)比NCBI公布的金華豬FAM134B序列(JX854456.1)多了一段129 bp序列,比預(yù)測的豬FAM134B序列(XM_003483804.2)少了一段371 bp,這提示所擴(kuò)增得到的陸川豬FAM134B基因有可能是另外一種剪接體。本研究成功克隆陸川豬FAM134B基因完整的CDS序列,為今后FAM134B基因在陸川豬的脂肪沉積及脂肪代謝方面的研究提供基礎(chǔ)理論。
[Abstract]:The aim of this study was to clone and bioinformatics analysis of FAM134B gene in Luchuan pig. In this study, primer was designed by using pig sequence published by Gen Bank and the target gene fragment was amplified by RT-PCR. The physicochemical properties and secondary structure of FAM134B gene of Luchuan pig were analyzed and predicted by bioinformatics method. The results showed that the encoding region of FAM134B gene of Luchuan pig was 1 107 bp, encoding 368 amino acids. The association of FAM134B gene with Jinhua pig (JX854456.1), cattle (KM587693.1), goat (KF684947.1), human (NM_001034850.2), mouse (NM_001034851.2), and rat (NM_001034912.1), and the relationship between Luchuan pig FAM134B gene and Jinhua pig (JX854456.1), cattle (KM587693.1), goat (KF684947.1), human (NM_001034850.2), mouse (NM_001034851.2), rat (NM_001034912.1), The similarity of the sequence of Xenopus (NM_001126975.1) was 87.80 and 87.449.The similarity of the sequence was 68.471and 67.01and 67.29.The similarity of the sequence was 87.80 and 87.449.The phylogenetic tree was used to analyze the sequence of Xenopus laevis (Xenopus laevis). The results showed that FAM134B gene was highly conserved in the evolution of different species. By comparative analysis, it was found that the CDS region of Luchuan pig FAM134B gene was 129bp more than the Jinhua FAM134B sequence (JX854456.1) published by NCBI, and 371bp, less than the predicted FAM134B sequence (XM_003483804.2). This suggests that the amplified FAM134B gene of Luchuan pig may be another splice. In this study, the complete CDS sequence of FAM134B gene of Luchuan pig was cloned successfully, which provided the basic theory for the future study of FAM134B gene in fat deposition and fat metabolism of Luchuan pig.
【作者單位】： 廣西壯族自治區(qū)畜牧研究所廣西家畜遺傳改良重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31360544) 廣西自然科學(xué)基金項目(2011GXNSFA018109,2013GXNSFBA019117) 廣西水產(chǎn)畜牧科技推廣應(yīng)用項目(桂漁牧科201452020)共同資助
【分類號】：S828

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 李瓊?cè)A;;陸川豬優(yōu)良特性和雜交開發(fā)利用[J];養(yǎng)豬;2010年06期

2 邱曉明;羅創(chuàng)福;;廣西陸川豬林下放養(yǎng)管理技術(shù)[J];當(dāng)代畜牧;2012年11期

3 黃雅瓊;江永強(qiáng);梁文全;李呈萬;莫常信;李家洲;詹萍;曾詩媛;李桂芬;陳旭健;甘耀坤;趙仕花;阮桂文;石德順;;國家級保護(hù)品種陸川豬的發(fā)展現(xiàn)狀[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2013年07期

4 黃雅瓊;梁文全;江永強(qiáng);李呈萬;李桂芬;李家洲;陳旭健;甘耀坤;詹萍;曾詩媛;趙仕花;阮桂文;石德順;;國家保護(hù)品種陸川豬遺傳和繁育存在的問題及解決策略[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2013年10期

5 黃雅瓊;江永強(qiáng);梁文全;陳旭健;曾詩媛;李家洲;趙仕花;阮桂文;石德順;;陸川豬的生物學(xué)特征及其優(yōu)良性能的研究概況[J];家畜生態(tài)學(xué)報;2013年05期

6 ;陸川豬的選育[J];農(nóng)業(yè)科技通訊;1976年04期

7 莫義君;;農(nóng)業(yè)部斥資500萬開發(fā)品牌陸川豬[J];農(nóng)村科技開發(fā);2002年09期

8 何若鋼;李瓊?cè)A;段福君;李秀寶;張傳濤;張文明;;陸川豬雜交優(yōu)勢選育的種質(zhì)特征研究[J];畜牧與獸醫(yī);2008年10期

9 梁家攀;;“陸川豬”成廣西地理標(biāo)志保護(hù)產(chǎn)品[J];中國牧業(yè)通訊;2009年23期

10 李瓊?cè)A;覃樹華;梁文全;;廣西陸川豬的保種與雜交開發(fā)利用[J];廣西畜牧獸醫(yī);2010年02期

相關(guān)會議論文 前2條

1 何若鋼;張家富;覃小榮;羅麗萍;黃偉杰;劉丁健;劉桂武;涂興強(qiáng);;陸川豬胴體及肉品質(zhì)的研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會養(yǎng)豬學(xué)分會第五次全國會員代表大會暨養(yǎng)豬業(yè)創(chuàng)新發(fā)展論壇論文集[C];2010年

2 胡林林;秦小娥;盧晟盛;陸陽清;盧克煥;;5-Aza-dc和TSA對陸川豬體細(xì)胞核移植的影響[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物繁殖學(xué)分會第十五屆學(xué)術(shù)研討會論文集（上冊）[C];2010年

相關(guān)重要報紙文章 前10條

1 李秀翔　羅釗;陸川豬產(chǎn)業(yè)發(fā)展步入快車道[N];廣西日報;2009年

2 杜東遠(yuǎn);“陸川豬”有了文化節(jié)[N];中國企業(yè)報;2009年

3 羅釗;陸川豬農(nóng)產(chǎn)品地理標(biāo)志產(chǎn)品通過自治區(qū)專家組評定[N];廣西日報;2009年

4 羅釗;“陸川豬”品牌價值17.98億元[N];廣西日報;2011年

5 劉喬芳　黃飛聲;打造聲名遠(yuǎn)揚(yáng)的“陸川豬”[N];中國工商報;2011年

6 羅釗;陸川豬產(chǎn)品加工形成近5億元產(chǎn)值[N];廣西日報;2011年

7 梁家攀;“陸川豬”成廣西地理標(biāo)志保護(hù)產(chǎn)品[N];農(nóng)民日報;2009年

8 本報記者 焦宏;挖掘名豬資源 延長產(chǎn)業(yè)鏈條[N];中國畜牧獸醫(yī)報;2010年

9 李秀翔　羅釗;百億產(chǎn)業(yè) 富民強(qiáng)縣[N];廣西日報;2010年

10 張裕星　記者 黃福強(qiáng);陸川打造畜牧綠色產(chǎn)業(yè)[N];中國縣域經(jīng)濟(jì)報;2010年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條

1 張家富;陸川豬若干種質(zhì)特性基礎(chǔ)研究[D];廣西大學(xué);2012年

，

本文編號：2364233