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2012~2015年H9N2亞型AIV分離株HA基因的克隆及序列分析

發(fā)布時間:2018-11-28 12:55
【摘要】:為了解近年來中國部分地區(qū)H9N2亞型禽流感病毒流行特點及遺傳進化情況,利用RT-PCR方法擴增2012~2015年分離的17株H9N2亞型禽流感病毒的HA基因片段,并進行序列測定和遺傳進化分析,同時對HA蛋白的裂解位點、受體結(jié)合位點和潛在的糖基化位點進行分析。結(jié)果顯示,17株H9N2亞型禽流感病毒HA基因核苷酸和推導(dǎo)的氨基酸同源性分別為87%~100%和75%~100%,均屬于Y280-like亞系毒株。HA基因裂解位點均為非連續(xù)堿性氨基酸,屬于低致病力毒株。HA基因受體結(jié)合位點149、198、234和235位氨基酸存在變異,其中,16株分離毒株的234位氨基酸由Q突變?yōu)長,表現(xiàn)出人流感病毒受體結(jié)合特征。潛在糖基化位點分析結(jié)果顯示,11株病毒在218位氨基酸處缺失1個糖基化位點,4株病毒在492位氨基酸處缺失1個糖基化位點,17株病毒在313位氨基酸處增加1個糖基化位點。研究結(jié)果表明,應(yīng)加強對H9N2亞型AIV的流行病學(xué)監(jiān)測,關(guān)注疫苗毒株與流行毒株的差異。
[Abstract]:In order to understand the epidemic characteristics and genetic evolution of H9N2 subtype avian influenza virus in some parts of China in recent years, the HA gene fragments of 17 strains of H9N2 subtype avian influenza virus isolated from 2012 to 2015 were amplified by RT-PCR method. At the same time, the cleavage sites, receptor binding sites and potential glycosylation sites of HA protein were analyzed. The results showed that the nucleotide sequence and deduced amino acid homology of HA gene of 17 strains of H9N2 subtype avian influenza virus were 87% and 75%, respectively, which belonged to Y280-like substrain. The HA gene cleavage sites were all discontinuous basic amino acids. The HA receptor binding sites of 149198234 and 235 amino acids were mutated, and the amino acids of 16 isolated strains were mutated from Q to L, showing the receptor binding characteristics of human influenza virus. The results of potential glycosylation site analysis showed that 11 strains lacked one glycosylation site at 218 amino acids, 4 lacked one glycosylation site at 492 amino acids, and 17 increased one glycosylation site at 313 amino acids. The results showed that the epidemiological monitoring of AIV subtype of H9N2 should be strengthened and the differences between vaccine strains and epidemic strains should be paid attention to.
【作者單位】: 廣州市華南農(nóng)大生物藥品有限公司;
【基金】:廣州市產(chǎn)學(xué)研協(xié)同創(chuàng)新重大專項(201508020088)
【分類號】:S852.65

【參考文獻】

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【共引文獻】

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【二級參考文獻】

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5 趙軍;柴麗娜;王澤霖;;1998~2008年中國中部H9N2亞型AIV分離毒株HA基因的進化分析[J];病毒學(xué)報;2011年02期

6 齊巖;袁潤余;張賀楠;亓文寶;單芬;胡s

本文編號:2362888


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