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擎天鳳梨SAMs基因的分離及開花期的表達分析

發(fā)布時間:2018-11-26 18:34
【摘要】:為了獲得擎天鳳梨SAMs基因,明確其在乙烯生物合成中的作用,本試驗在前期構(gòu)建全長c DNA文庫、批量EST測序的基礎(chǔ)上,對目標單克隆進行Primer Walking測序獲得了2個SAMs基因,分別命名為SAMs1和SAMs2。SAMs1基因(Gen Bank:KF787113)序列全長1 375bp,開放閱讀框1 086 bp,編碼一條361個氨基酸的序列;SAMs2基因(Gen Bank:KF787114)序列全長1 235bp,開放閱讀框945 bp,編碼一條314個氨基酸的序列。應用生物信息學方法對2個基因編碼蛋白的氨基酸組成、理化性質(zhì)、保守結(jié)構(gòu)域、二級結(jié)構(gòu)、三級晶體結(jié)構(gòu)等方面進行了預測和分析。分子系統(tǒng)進化分析表明,SAMs1與禾本科植物的SAMs基因聚為一類,與SAMs2關(guān)系較遠。對2個基因在開花期的表達變化以及乙烯釋放量變化分析表明,SAMs1基因表達與內(nèi)源乙烯的釋放水平變化趨勢一致,即在完全呈色的紅色苞片中含量最高,其次是綠色苞片,最后為綠色葉片。推測SAMs1在乙烯的生物合成中起重要作用,SAMs2參與了除乙烯生物合成外的其它SAM生物代謝過程。本試驗結(jié)果對研究擎天鳳梨的乙烯生物合成、苞片呈色機理以及催花應用具有重要意義。
[Abstract]:In order to obtain SAMs gene and clarify its role in ethylene biosynthesis, two SAMs genes were obtained by Primer Walking sequencing on the basis of the construction of full-length c DNA library and batch EST sequencing. They were named SAMs1 and SAMs2.SAMs1 gene (Gen Bank:KF787113), respectively. The open reading frame 1086 bp, encodes a 361 amino acid sequence. The sequence of SAMs2 gene (Gen Bank:KF787114) is 1 235 BP, and open reading frame 945 bp, encodes a 314 amino acid sequence. The amino acid composition, physicochemical properties, conserved domain, secondary structure and tertiary crystal structure of two gene encoded proteins were predicted and analyzed by bioinformatics. Molecular phylogenetic analysis showed that SAMs1 was closely related to SAMs gene of Gramineae plants and had a far relationship with SAMs2. The analysis of the expression changes of two genes at anthesis and ethylene release showed that the SAMs1 gene expression was consistent with the change trend of endogenous ethylene release level, that is, the content of SAMs1 gene was the highest in the completely colored red bracts, followed by the green bracts. Finally, green leaves. It is suggested that SAMs1 plays an important role in ethylene biosynthesis, and SAMs2 is involved in the biosynthesis of SAM except ethylene biosynthesis. The results of this experiment are of great significance for the study of ethylene biosynthesis, the color mechanism of bracts and the application of flower promotion.
【作者單位】: 浙江省蕭山棉麻研究所;
【基金】:浙江省自然科學基金(LQ13C150002) 浙江省公益性技術(shù)應用研究計劃項目(2012C22085)
【分類號】:S682.3

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本文編號:2359304

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