【摘要】：【目的】獲得番茄雄性不育基因的候選基因,提高番茄雄性不育基因定位的準確性,為該雄性不育基因的克隆及功能機制研究提供理論基礎(chǔ)。【方法】以一個與苗期綠莖基因緊密連鎖的花粉敗育型材料為母本,以一個苗期紫莖可育系為父本,通過集群分離(BSA)法分別建立30個F2單株的不育和可育DNA池,基于簡化基因組測序(SLAF-Seq)技術(shù)檢測足夠量的簡化基因組擴增片段,通過關(guān)聯(lián)分析,獲得目標雄性不育基因的候選區(qū)域,并利用GO數(shù)據(jù)庫對關(guān)聯(lián)區(qū)域內(nèi)的基因進行功能注釋。【結(jié)果】通過SLAF測序共獲得20.27 Mb的序列量;共獲得103 250個SLAF標簽,標簽整體平均深度達160.39倍;完成了2個混合池間SLAF標簽標記的多態(tài)性分析,共獲得多態(tài)性標記6 892個;利用2個混合池進行關(guān)聯(lián)分析,共得到8個與目標雄性不育基因相關(guān)的候選區(qū)域,區(qū)域平均大小為0.29Mb,區(qū)域內(nèi)共有27個差異標記,146個候選基因。【結(jié)論】利用SLAF測序技術(shù)對番茄雄性不育基因進行了初步定位。
[Abstract]:[objective] to obtain candidate genes for tomato male sterility gene, and to improve the accuracy of location of male sterility gene in tomato. [methods] A pollen abortion type material closely linked to green stem gene at seedling stage was used as female parent and a purple stem fertile line at seedling stage as male parent. The sterile and fertile DNA pools of 30 F2 plants were established by cluster isolation (BSA) method. Sufficient simplified genomic amplification fragments were detected based on simplified genome sequencing (SLAF-Seq). Candidate regions of the target male sterility gene were obtained, and functional annotation of the genes in the associated region was carried out by using GO database. [results] 20.27 Mb sequence was obtained by SLAF sequencing. A total of 103,250 SLAF tags were obtained, with a total average depth of 160.39 times, and a total of 6892 polymorphic markers were obtained through the polymorphism analysis of SLAF tags between two mixed pools. Eight candidate regions associated with the target male sterility gene were obtained by association analysis with two mixed pools. The average size of the candidate regions was 0.29 Mb, and there were 27 differential markers in the region. [conclusion] SLAF sequencing was used to localize male sterile genes in tomato.
【作者單位】： 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)與園藝學(xué)院;新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝作物研究所;
【基金】：公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(201303115) 大宗蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系烏魯木齊試驗站項目(CARS-25-G-51) 新疆維吾爾自治區(qū)園藝學(xué)重點學(xué)科基金項目(2016-10758-3)
【分類號】：S641.2

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 張紅;吳海波;李寐華;熊韜;王廣智;伊鴻平;;基于super-BSA技術(shù)開發(fā)甜瓜含糖量和酸度性狀的功能性分子標記[J];中國瓜菜;2015年06期

2 王柏柯;楊生保;余慶輝;徐明;王文魁;羅淑萍;;加工番茄種質(zhì)資源的SSR分析[J];植物遺傳資源學(xué)報;2014年01期

3 郭艷萍;張改生;程海剛;朱展望;張龍雨;牛娜;馬守才;李紅霞;;小麥粘類CMS育性恢復(fù)基因的SSR分子標記與定位[J];核農(nóng)學(xué)報;2009年05期

【共引文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 王柏柯;李寧;唐亞萍;王強;楊濤;楊生保;帕提古麗;余慶輝;高杰;;基于簡化基因組測序技術(shù)的番茄雄性不育基因定位[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2017年06期

2 齊東霞;張映;劉富中;A.Artemyeva;I.Gashkova;;中俄茄子種質(zhì)資源遺傳多樣性研究[J];植物遺傳資源學(xué)報;2017年03期

3 王柏柯;李寧;唐亞萍;王強;楊濤;楊生保;帕提古麗;余慶輝;高杰;;番茄雄性不育基因的SRAP分子標記定位[J];山東農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2017年02期

4 桂安勝;聶迎彬;馬麗;徐紅軍;李瑞博;劉小芳;孔德真;張曉科;穆培源;;小麥雄性不育系A(chǔ)L18A育性恢復(fù)基因的QTL定位[J];麥類作物學(xué)報;2017年01期

5 陳浣;夏菲;吳新儒;孫玉合;;集群分離分析法在植物基因定位上的應(yīng)用[J];基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué);2016年06期

6 連世超;雷夢林;張瑞軍;白志元;張海平;衛(wèi)保國;;大豆細胞質(zhì)雄性不育恢復(fù)基因的標記定位[J];山西農(nóng)業(yè)科學(xué);2016年05期

7 丁麗雪;李濤;李植良;徐小萬;李穎;王恒明;王永飛;馬三梅;黎振興;;番茄AT-hook基因家族的鑒定及脅迫條件下的表達分析[J];植物遺傳資源學(xué)報;2016年02期

8 楊生保;李寧;楊濤;王柏柯;唐亞萍;王強;帕提古麗;張貴仁;余慶輝;;基于SSR標記的制干辣椒品種資源遺傳多樣性分析[J];分子植物育種;2015年04期

9 李志寬;祝萬萬;馬守才;張改生;趙新亮;張鵬飛;牛娜;王軍衛(wèi);;小麥T型細胞質(zhì)雄性不育恢復(fù)基因Rf1和Rf4的SSR標記分析[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報;2014年09期

10 王春平;羅坤;趙惠燕;張改生;李丹;高歡歡;鄧明;劉蘭;;14份小麥種質(zhì)資源抗麥長管蚜遺傳多樣性的SSR分析[J];核農(nóng)學(xué)報;2011年04期

【二級參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 伊鴻平;吳明珠;馮炯鑫;張永兵;;中國新疆哈密瓜資源與品種改良研究進展[J];園藝學(xué)報;2013年09期

2 苗麗麗;劉秀林;溫義昌;;關(guān)聯(lián)分析在QTL定位中的應(yīng)用[J];山西農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年02期

3 張勇;毛浩量;王柏柯;彭剛;甘中祥;李倍金;張錄霞;余慶輝;;幾個加工番茄新品種在不同地區(qū)的適應(yīng)性研究[J];新疆農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年05期

4 楊景華;王士偉;劉訓(xùn)言;楊加付;張明方;;高等植物功能性分子標記的開發(fā)與利用[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年11期

5 李紅霞;張改生;張龍雨;牛娜;;粘類小麥育性恢復(fù)基因的遺傳分析及SSR分子標記[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2008年04期

6 張赤紅;張京;趙會英;張云霞;李珍;Michael Baum;;應(yīng)用SSR標記對61個國家大麥遺傳多樣性的研究[J];植物遺傳資源學(xué)報;2008年01期

7 王效寧;韓東飛;云勇;孟衛(wèi)東;嚴小微;楊慶文;;利用SSR標記分析海南普通野生稻的遺傳多樣性[J];植物遺傳資源學(xué)報;2007年02期

8 宋建;陳杰;陳火英;劉楊;莊天明;;利用SSR分子標記分析番茄的遺傳多樣性[J];上海交通大學(xué)學(xué)報(農(nóng)業(yè)科學(xué)版);2006年06期

9 金鳳媚;薛俊;郟艷紅;劉仲齊;;番茄遺傳資源的聚類分析研究[J];華北農(nóng)學(xué)報;2006年06期

10 王日升;李楊瑞;楊麗濤;李立志;方鋒學(xué);李文嘉;;番茄栽培品種SSR標記和形態(tài)標記的遺傳多樣性分析[J];熱帶亞熱帶植物學(xué)報;2006年02期

【相似文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 宋洪元,丁建剛,曹必好,雷建軍,宋明;人工雄性不育基因及恢復(fù)基因表達載體的構(gòu)建[J];西南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2004年03期

2 陳玉輝,許向陽,李景富,李桂英;雄性不育基因工程及其在蔬菜上的應(yīng)用[J];中國生物工程雜志;2004年06期

3 魏兵強;王蘭蘭;陳靈芝;;辣椒胞質(zhì)雄性不育基因的分子標記[J];西北農(nóng)業(yè)學(xué)報;2010年10期

4 孫國鳳;;利用非對稱細胞融合法向甘藍導(dǎo)入雄性不育基因[J];生物技術(shù)通報;1989年01期

5 張文英;陳紹莉;;蔬菜雄性不育基因工程[J];上海蔬菜;2010年02期

6 鄒禮平,陳錦華;雄性不育基因TA29-Barnase轉(zhuǎn)化番茄的初步研究[J];孝感學(xué)院學(xué)報;2004年03期

7 劉大文,戴景瑞,謝友菊,王守才;玉米雄性不育基因和恢復(fù)基因表達載體的構(gòu)建與鑒定[J];種子;1999年01期

8 鄧迎海,周洪生;玉米雄性不育基因的利用[J];玉米科學(xué);1998年02期

9 鄧景揚,高忠麗;小麥顯性雄性不育基因的發(fā)現(xiàn)與利用——太谷不育小麥鑒定總結(jié)[J];作物學(xué)報;1980年02期

10 鄧景揚,高忠麗;小麥顯性雄性不育基因的發(fā)現(xiàn)、鑒定及其在遺傳學(xué)和育種學(xué)上的價值[J];中國科學(xué)(B輯 化學(xué) 生物學(xué) 農(nóng)學(xué) 醫(yī)學(xué) 地學(xué));1982年01期

相關(guān)會議論文 前2條

1 鄧明華;文錦芬;鄒學(xué)校;朱海山;張竹青;趙凱;;辣椒核質(zhì)互作雄性不育系9704A線粒體雄性不育基因片段分析[A];中國園藝學(xué)會2010年學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2010年

2 陳琛;莊木;張揚勇;劉玉梅;楊麗梅;程斐;方智遠;;一個與甘藍顯性雄性不育基因連鎖的EST-SSR標記[A];中國園藝學(xué)會2010年學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2010年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前1條

1 張新梅;甘藍顯性雄性不育基因Ms-cd1的精細定位[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2010年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前6條

1 肖純梅;大白菜細胞核復(fù)等位雄性不育基因定位[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

2 季晨飛;歐亞種葡萄遺傳圖譜構(gòu)建和雄性不育基因及部分性狀相關(guān)QTL的定位[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

3 朱莎;番茄雄性不育基因（ps-2）的分子標記研究[D];西南大學(xué);2006年

4 邢虎成;番茄ps-2雄性不育基因的PCR分析與定位[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

5 黃和艷;甘藍（Brassica Oleracea var. Capitata）顯性雄性不育基因分子標記輔助育種研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2005年

6 王真;丹參雄性不育基因的AFLP標記[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2012年

，

本文編號：2352448