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瘤背石磺肌肉生長抑制素基因的克隆及組織表達分析

發(fā)布時間:2018-11-20 05:11
【摘要】:為探究石磺由海洋向陸地進化過程中肌肉生長和發(fā)育的分子機制,實驗以石磺科貝類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),采用RACE方法從瘤背石磺肌肉中首次克隆到MSTN cDNA的全長并做了相應(yīng)的組織表達分析。結(jié)果顯示,瘤背石磺MSTN基因cDNA全長2667 bp,包括1650 bp的開放閱讀框,374 bp的5′端非翻譯區(qū),643 bp的3'端非翻譯區(qū),共編碼549個氨基酸。預(yù)測該基因編碼的蛋白質(zhì)原子總量為8776,分子式為C2774H4331N783O862S26,分子質(zhì)量約為63.27 ku,理論等電點為6.02,信號肽預(yù)測結(jié)果顯示,N端具有21個氨基酸長度的信號肽。瘤背石磺MSTN具有MSTN的共同特征,包括蛋白酶水解位點RSRR和C端多肽生物活性區(qū)以及9個保守的半胱氨酸殘基。通過進化樹分析,瘤背石磺MSTN與加州海兔MSTN的親緣關(guān)系最近。RT-PCR結(jié)果顯示,MSTN基因在各個組織中均有表達;含肌纖維組織中的表達量低于內(nèi)臟器官的表達量,在肝胰腺中的表達量最高,腹足表達量最低。MSTN基因一級結(jié)構(gòu)具有很高的保守性,說明該基因在進化上的限制性和功能的重要性;同時該基因在石磺非肌肉組織中表達,表明該基因不僅有抑制肌肉生長的作用,還參與其他生命活動的調(diào)節(jié)。
[Abstract]:In order to explore the molecular mechanism of muscle growth and development during the evolution of stone sulfonate from ocean to land, the experiment was based on the transcriptome data of shellfish. RACE method was used to clone the full length of MSTN cDNA from the sarcomatous muscle for the first time and the corresponding tissue expression was analyzed. The results showed that the total length of cDNA of MSTN gene was 2667 bp, including open reading frame of 1650 bp, 5 'untranslated region of 374 bp and 3' terminal untranslated region of 643 bp, encoding 549 amino acids. The total amount of protein atoms encoded by the predicted gene is 8776, the molecular formula is C2774H4331N783O862S26, and the molecular mass is about 63.27 ku, the theoretical isoelectric point is 6.02. The signal peptide prediction results show that the N-terminal has 21 amino acid length signal peptides. MSTN has the common characteristics of MSTN, including protease hydrolysis site (RSRR), C-terminal polypeptide bioactive region and 9 conserved cysteine residues. According to phylogenetic tree analysis, the relationship between MSTN and MSTN was close. RT-PCR results showed that MSTN gene was expressed in all tissues. The expression of MSTN gene in the primary structure of the MSTN gene was highly conserved, but the highest in the hepatopancreas and the lowest in the gastropods, as compared with that in the visceral organs, and the expression level in the muscle-containing fibers was lower than that in the visceral organs. It shows the importance of the restriction and function of the gene in evolution. At the same time, the gene was expressed in non-muscle tissue, indicating that the gene not only inhibits muscle growth, but also participates in the regulation of other life activities.
【作者單位】: 上海海洋大學(xué)省部共建水產(chǎn)種質(zhì)資源發(fā)掘與利用教育部重點實驗室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(41276157) 上海高校水產(chǎn)學(xué)一流學(xué)科建設(shè)項目~~
【分類號】:S917.4

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