【摘要】：【目的】克隆廣西巴馬小型豬過氧化物酶增殖物激活受體γ基因(PPARγ),并確定其在不同組織中的表達情況,為后續(xù)研究該基因在豬支原體肺炎(MPS)中的作用機制打下基礎(chǔ)。【方法】利用RT-PCR克隆廣西巴馬小型豬PPARγ基因,并進行BLAST比對分析及其推導蛋白的生物信息學分析;以實時熒光定量PCR檢測PPARγ基因在18月齡廣西巴馬小型豬心臟、脾臟、肺臟、腎臟、大腸、小腸、肌肉和脂肪中的表達情況�！窘Y(jié)果】廣西巴馬小型豬PPARγ基因開放閱讀框序列1515 bp,編碼504個氨基酸。廣西巴馬小型豬PPARγ基因推導氨基酸序列與Gen Bank已發(fā)表的豬PPARγ基因(FJ436399.1)推導氨基酸序列同源性最高,達100.0%;而與牛(NM_181024.2)、人類(NM_005037.5)、獼猴(NM_001032860.1)、鼠(NM_001308354.1)和鴻雁(KJ019822.1)的同源性分別為92.9%、91.8%、91.5%、90.5%和83.5%,表明PPARγ基因高度保守。PPARγ蛋白分子量為57380.91 Da,理論等電點(p I)為6.88,不穩(wěn)定系數(shù)49.26,脂肪指數(shù)為88.21,親水性平均水平為-0.293,為親水性蛋白,其二級結(jié)構(gòu)主要是α-螺旋,占總數(shù)的39.09%。PPARγ基因在廣西巴馬小型豬大腸組織中的表達量最高,極顯著高于其他組織(P0.01),而在腎臟、心臟和肌肉組織中的表達量極低。【結(jié)論】PPARγ基因在18月齡廣西巴馬小型豬的各組織中均有表達,但不同組織中的表達水平存在明顯差異,可能與其在不同組織中的功能差異有關(guān)。
[Abstract]:[objective] to clone the peroxidase proliferator activated receptor 緯 gene (PPAR 緯) from Guangxi Bama miniature pig and to determine its expression in different tissues. [methods] RT-PCR was used to clone the PPAR 緯 gene of Guangxi Bama miniature pig, and the BLAST comparison analysis and the bioinformatics analysis of the deduced protein were carried out. Real-time fluorescence quantitative PCR was used to detect PPAR 緯 gene in the heart, spleen, lung, kidney, large intestine and small intestine of 18-month-old Guangxi Bama miniature pig. Expression of PPAR 緯 gene in muscle and fat. [results] 1515 bp, encoding 504 amino acids in PPAR 緯 gene of Guangxi Bama miniature pig. The deduced amino acid sequence of PPAR 緯 gene of Guangxi Bama miniature pig was the highest homology with the deduced amino acid sequence of PPAR 緯 gene (FJ436399.1) published by Gen Bank. The homology with NM_181024.2, NM_005037.5, NM_001032860.1, NM_001308354.1 and KJ019822.1 was 92.91.8and 91.5, respectively. 90.5% and 83.5%, indicating that the PPAR 緯 gene is highly conserved, the molecular weight of PPAR 緯 protein is 57380.91 Da, the theoretical isoelectric point (p I) is 6.88, the coefficient of instability is 49.26, the fat index is 88.21, and the average hydrophilic level is -0.293. It is a hydrophilic protein, and its secondary structure is mainly 偽 -helix. The expression of 39.09%.PPAR 緯 gene in the large intestine of Guangxi Bama miniature pig is the highest, which is significantly higher than that in other tissues (P0.01), but in the kidney. The expression of PPAR 緯 gene was very low in heart and muscle tissue. [conclusion] PPAR 緯 gene was expressed in all tissues of 18-month-old Guangxi Bama miniature pig, but there were significant differences in expression level between different tissues. It may be related to the functional differences in different tissues.
【作者單位】： 廣西大學動物科學技術(shù)學院;
【基金】：國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系廣西生豬創(chuàng)新團隊建設(shè)項目(nycytxgxcxtd-03-15) 廣西家畜遺傳育種改良重點實驗室開放項目(2015GXKLLGI-09)
【分類號】：Q78;S858.28

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本文編號：2339999