【摘要】：為了解我國(guó)主要對(duì)蝦養(yǎng)殖區(qū)的白斑綜合征病毒(WSSV)膠原蛋白基因(wsv001)蛋白結(jié)構(gòu)變異情況,以2015年13個(gè)省市發(fā)病地區(qū)采集的57份WSSV陽(yáng)性樣品為模板,用特異引物對(duì)目的片段進(jìn)行擴(kuò)增,連接轉(zhuǎn)化擴(kuò)增片段并進(jìn)行測(cè)序分析。結(jié)果顯示,57份WSSV陽(yáng)性樣品中,擴(kuò)增出現(xiàn)條帶的樣品共有18份。氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示,擴(kuò)增的wsv001片段所編碼氨基酸出現(xiàn)三類變異,包括18個(gè)氨基酸小片段缺失,121個(gè)氨基酸大片段缺失及氨基酸插入,此外,還有8個(gè)氨基酸存在突變。結(jié)果表明,我國(guó)不同地區(qū)wsv001基因及其編碼氨基酸存在明顯缺失變異。對(duì)wsv001蛋白結(jié)構(gòu)缺失變異的分析,為進(jìn)一步對(duì)其蛋白功能和WSSV毒株毒力及WSSV對(duì)環(huán)境適應(yīng)能力的研究提供參考。
[Abstract]:In order to understand the structural variation of (WSSV) collagen gene (wsv001) of white spot syndrome virus (WSSV) in main shrimp culture areas in China, 57 WSSV positive samples collected from 13 provinces and cities in 2015 were used as template. The target fragment was amplified with specific primers, ligated and transformed into the amplified fragment and sequenced. The results showed that 18 of 57 WSSV positive samples were amplified. The results of amino acid sequence alignment showed that there were three kinds of variations in amino acids encoded by the amplified wsv001 fragment, including 18 small amino acid deletion, 121 large amino acid deletion and amino acid insertion, in addition, there were 8 amino acid mutations. The results showed that the wsv001 gene and its encoded amino acids in different regions of China were significantly deleted and mutated. The analysis of structural deletion of wsv001 protein provides a reference for further study on its protein function, virulence of WSSV strain and adaptability of WSSV to environment.
【作者單位】： 農(nóng)業(yè)部海洋漁業(yè)可持續(xù)發(fā)展重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所;上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;青島海洋科學(xué)與技術(shù)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室海洋漁業(yè)科學(xué)與食物產(chǎn)出過(guò)程功能實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(2012CB114401) 農(nóng)業(yè)部948項(xiàng)目(2016-X56)
【分類號(hào)】：S945.4

【參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2335387