【摘要】：肌內(nèi)脂肪含量是影響牦牛肉質(zhì)品質(zhì)的一個(gè)重要因素,可直接影響其肉的嫩度和風(fēng)味。過氧化物酶體增殖激活受體PPARα、PPARγ和PPARδ基因是調(diào)控牦牛肌內(nèi)脂肪沉積的相關(guān)候選基因。牦牛生長性狀與脂肪沉積之間具有一定的關(guān)聯(lián)系,因此,揭示牦牛PPARα、PPARγ和PPARδ基因的遺傳變異特征,及牦牛生長性狀顯著相關(guān)的候選分子標(biāo)記,為牦牛分子育種積累資料。以192頭牦牛血樣為材料,通過DNA池測序和PCR-HRM(英文全寫,HRM)等技術(shù)檢測PPARα、PPARγ和PPARδ基因的SNPs。利用DNA混合池、直接測序法和高分辨率溶解曲線對PPARα、PPARγ、PPARδ進(jìn)行基因分型,分析其在牦牛群體中基因多態(tài)性,并對192頭牦牛在上述位點(diǎn)的多樣性與其生長性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,以期為牦牛遺傳資源的保護(hù)利用與新品種選育提供科學(xué)依據(jù)。本研究主要獲得了以下結(jié)果:1.PPARα基因多態(tài)性與生長性狀相關(guān)性分析牦牛PPARα基因中發(fā)現(xiàn)三個(gè)SNPs。遺傳變異特征分析顯示,SNP1(g.44399A/C)、SNP2(g.53261A/G)和SNP3(g.61281T/C)位點(diǎn)屬于中度多態(tài)性。連鎖不平衡和單倍型分析表明,牦牛PPARα基因SNP1(g.44399A/C)多態(tài)位點(diǎn)和SNP2(g.53261G/A)多態(tài)位點(diǎn)之間為弱連鎖,牦牛PPARα基因SNP1(g.44399A/C)多態(tài)位點(diǎn)和SNP3(g.61281T/C)多態(tài)位點(diǎn)之間為弱連鎖,而牦牛PPARα基因SNP2(g.53261G/A)多態(tài)位點(diǎn)和SNP3(g.61281T/C)多態(tài)位點(diǎn)之間為強(qiáng)連鎖,單倍型CAT屬于優(yōu)勢單倍型(頻率為48.2%)。方差分析表明,單個(gè)的SNP與牦牛生長性狀有著顯著或極顯著的關(guān)聯(lián)。牦牛PPARα基因的3個(gè)SNPs與其生長性狀顯著相關(guān)。2.PPARγ基因多態(tài)性與生長性狀性分析牦牛PPARγ基因外顯子中僅發(fā)現(xiàn)1個(gè)SNP。遺傳變異特征分析顯示,SNP(g.87362T/C)位點(diǎn)屬于高度多態(tài)性。方差分析表明,該SNP與牦牛生長性狀有著顯著或極顯著的關(guān)聯(lián)。牦牛PPARγ基因SNP與其生長性狀顯著相關(guān)。3.PPARδ基因多態(tài)性與生長性狀相關(guān)性分析牦牛PPARδ基因內(nèi)含子中發(fā)現(xiàn)2個(gè)SNPs。遺傳變異特征分析顯示,SNP1(g.10045A/G)和SNP2(g.10226A/G)位點(diǎn)屬于中度多態(tài)性。連鎖不平衡和單倍型分析表明,牦牛PPARδ基因2個(gè)多態(tài)位點(diǎn)之間為弱連鎖,單倍型AA屬于優(yōu)勢單倍型(頻率為42.2%)。方差分析表明,單個(gè)的SNP與牦牛生長性狀有著顯著或極顯著的關(guān)聯(lián)。牦牛PPARδ基因的2個(gè)SNPs均與其生長性狀顯著相關(guān)。
[Abstract]:The content of intramuscular fat is an important factor affecting the quality of yak beef, which can directly affect the tenderness and flavor of yak meat. Peroxisome proliferation-activated receptors (PPAR 偽, PPAR 緯 and PPAR 未) are candidate genes for regulating fat deposition in yak muscle. Therefore, the genetic variation of PPAR 偽, PPAR 緯 and PPAR 未 genes in yak and candidate molecular markers significantly related to growth traits in yak were revealed to accumulate data for yak molecular breeding. The SNPs. of PPAR 偽, PPAR 緯 and PPAR 未 genes were detected by DNA pool sequencing and PCR-HRM, HRM) with 192 yak blood samples. PPAR 偽, PPAR 緯, PPAR 未 were genotyped by DNA mixed cell, direct sequencing and high resolution dissolution curve. The polymorphism of PPAR 偽, PPAR 緯 and PPAR 未 was analyzed in yak population. In order to provide scientific basis for the conservation and utilization of genetic resources of yak and breeding of new varieties. The main results of this study were as follows: the relationship between 1.PPAR 偽 gene polymorphism and growth traits was analyzed. Three SNPs. were found in PPAR 偽 gene of yak. Genetic variation analysis showed that SNP1 (g.44399A/C), SNP2 (g.53261A/G) and SNP3 (g.61281T/C) loci were moderately polymorphic. Linkage disequilibrium and haplotype analysis showed that there was a weak linkage between SNP1 (g.44399A/C) polymorphic loci and SNP2 (g.53261G/A) polymorphic loci in yak PPAR 偽 gene. There was a weak linkage between SNP1 (g.44399A/C) polymorphism and SNP3 (g.61281T/C) polymorphism of PPAR 偽 gene in yak, but strong linkage between SNP2 (g.53261G/A) polymorphism and SNP3 (g.61281T/C) polymorphic locus in PPAR 偽 gene of yak. Haplotype CAT belongs to the dominant haplotype (the frequency is 48.2%). The analysis of variance showed that there was a significant or extremely significant association between individual SNP and yak growth traits. Three SNPs of yak PPAR 偽 gene were significantly correlated with its growth traits. Analysis of 2.PPAR 緯 gene polymorphism and growth traits only one SNP. was found in the exon of PPAR 緯 gene in yak Genetic variation analysis showed that, SNP (g.87362T/C) loci were highly polymorphic. The analysis of variance showed that the SNP had significant or extremely significant association with yak growth traits. Analysis of correlation between 3.PPAR 未 Gene Polymorphism and growth traits two SNPs. were found in PPAR 未 Intron of Yak Genetic variation analysis showed that SNP1 (g.10045A/G) and SNP2 (g.10226A/G) loci were moderately polymorphic. Linkage disequilibrium and haplotype analysis showed that the two polymorphic loci of PPAR 未 gene were weakly linked, and haplotype AA belonged to the dominant haplotype (42.2%). The analysis of variance showed that there was a significant or extremely significant association between individual SNP and yak growth traits. Two SNPs of PPAR 未 gene were significantly correlated with the growth traits of yak.
【學(xué)位授予單位】：甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S823.85

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本文編號(hào)：2327153