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馬氏珠母貝STA RDL3基因的克隆與表達(dá)性分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-11 17:25
【摘要】:采用RACE技術(shù)克隆獲得馬氏珠母貝STARDL3基因c DNA全長(zhǎng)序列(Pm-STARDL3);利用熒光定量技術(shù)檢測(cè)Pm-STARDL3基因在各個(gè)組織中的表達(dá)量。結(jié)果表明,Pm-STARDL3基因c DNA序列全長(zhǎng)3 655 bp,開放閱讀框(ORF)長(zhǎng)1 491 bp,編碼496個(gè)氨基酸,5'非翻譯區(qū)(5'UTR)長(zhǎng)110 bp,3'UTR長(zhǎng)2 054 bp。PmSTARDL3氨基酸序列同源比對(duì)分析顯示與華貴類櫛孔扇貝(Mimachlamys nobilis)STARDL3的序列的相似度最高。SMART軟件分析得出,Pm-STARDL3有STARD類蛋白特有的結(jié)構(gòu)域。熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果表明Pm-STARDL3在肝胰腺中表達(dá)量最高,其后依次是外套膜、鰓與閉殼肌,各組織的表達(dá)量差異具統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05)。
[Abstract]:The full-length sequence of STARDL3 gene c DNA (Pm-STARDL3) of Pinctada martensii was cloned by RACE, and the expression of Pm-STARDL3 gene in various tissues was detected by fluorescence quantitative technique. The results showed that the length of c DNA of Pm-STARDL3 gene was 3 655 bp, open reading frame (ORF) 1 491 bp, encoding 496 amino acids and 5 'untranslated region (5'UTR) 110 bp,. Homologous alignment analysis of 3'UTR 2054 bp.PmSTARDL3 amino acid sequence showed the highest similarity with (Mimachlamys nobilis) STARDL3 sequence of chlamys farreri. SMART software analysis showed that Pm-STARDL3 had a unique domain of STARD protein. The results of fluorescence quantitative PCR showed that the expression of Pm-STARDL3 was the highest in hepatopancreas, followed by capillaries, Gill and obturator muscle, and there was significant difference among the tissues (p0.05).
【作者單位】: 廣東海洋大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院;廣東省珍珠養(yǎng)殖與加工工程技術(shù)研究中心;
【基金】:國(guó)家自然基金“馬氏珠母貝生長(zhǎng)性狀QTLs精細(xì)定位與相關(guān)基因功能分析(31372526)” 廣東省教育廳項(xiàng)目“珍珠貝良種培育與新型育種模式(GDOU2013050211)” 廣東省海洋與漁業(yè)局科技專項(xiàng)“馬氏珠母貝選系育珠性狀測(cè)試與示范養(yǎng)殖(A201308A10)”共同資助
【分類號(hào)】:Q78;S917.4

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本文編號(hào):2325602

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