發(fā)布時間：2018-11-10 18:43

【摘要】：對上海浦東南匯地區(qū)某規(guī)模豬場豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)疑似病料進行處理,提取病毒總RNA,采用RT-PCR方法擴增Nsp2/ORF5基因,并進行基因測序。序列分析結(jié)果表明,浦東南匯分離株Nsp2蛋白均缺失481位和第533~561位30個不連續(xù)的氨基酸,同時在Nsp2編碼區(qū)出現(xiàn)與高致病性PRRSV(HP-PRRSV)代表株JXA1相同的遺傳變異現(xiàn)象。同源性分析表明,6株Nsp2、ORF5氨基酸序列與VR-2332、CH-1a、HB-2以及JXA1株的同源性分別為:40.3%~55.3%,73.5%~89.5%;54.7%~75.1%,75.5%~92.5%;50.9%~67.3%,73.5%~90.5%;72.8%~91.5%,81.5%~98.5%;而與歐洲型代表株LV株的同源性分別僅為26.2%~35.9%和44.8%~56.4%。遺傳演化分析表明,浦東南匯分離株與國內(nèi)株(CH-1a、HB-2)和VR-2332美洲代表株各自處于相對獨立的分支,遺傳關(guān)系較遠且不存在交叉現(xiàn)象,而與JXA1變異株處于同一進化分支。研究表明,浦東南匯分離株為美洲型HP-PRRSV毒株,具有一定的地理衍變特性,已從PRRSV遺傳進化樹中分離,出現(xiàn)一個新的遺傳獨立群體。
[Abstract]:The suspected (PRRSV) of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (RRRSV) was treated in a pig farm in Nanhui area, Pudong, Shanghai. The total RNA, of the virus was extracted and the Nsp2/ORF5 gene was amplified by RT-PCR method, and the gene was sequenced. The results of sequence analysis showed that the Nsp2 protein of Pudong Nanhui isolate was short of 30 discontinuous amino acids at position 581 and 533 ~ (561), and the same genetic variation occurred in the coding region of Nsp2 as that of JXA1, a representative strain of highly pathogenic PRRSV (HP-PRRSV). Homology analysis showed that the amino acid sequences of 6 Nsp2,ORF5 strains were 40.3% and 73.53.5% with VR-2332,CH-1a,HB-2 and JXA1 strains, respectively. 54.7 including 75.1 and 75.5, including 92.5 and 50.9 and 67.3, and 73.5 and 72.5, and 91.5 and 98.5, as well as 91.5 and 98.5. The homology with LV strain was only 26.235.9% and 44.8%, respectively. Genetic evolution analysis showed that the isolates of Pudong South Huihui were relatively independent of each other with CH-1a,HB-2 and VR-2332 representative strains, and the genetic relationship was far away and there was no cross phenomenon. However, it was in the same evolutionary branch as the JXA1 mutant. The results show that the isolated strain of HP-PRRSV in Pudong South Huihui is of American type and has certain geographical evolution characteristics. It has been isolated from the genetic evolution tree of PRRSV and a new genetic independent population has emerged.
【作者單位】： 上海浦東新區(qū)農(nóng)業(yè)服務(wù)中心南匯新城鎮(zhèn)站;上海浦東新區(qū)農(nóng)業(yè)服務(wù)中心書院站;上海閔行區(qū)動物疫病預(yù)防控制中心;揚州大學獸醫(yī)學院;
【基金】：上海市科技興農(nóng)推廣項目[滬農(nóng)科推字(2015)第1-5號]
【分類號】：S852.651

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本文編號：2323294