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中國水仙NtSOC1基因克隆及亞細胞定位

發(fā)布時間:2018-10-25 15:47
【摘要】:以中國水仙‘金盞銀臺’為實驗材料,采用RACE和RT-PCR技術獲得1個與開花相關的轉錄因子(SOC1)的同源基因NtSOC1。NtSOC1的cDNA全長1 603bp,含有1個687bp開放閱讀框,編碼228個氨基酸。生物信息學分析表明,NtSOC1與單子葉植物的SOC1同源基因的氨基酸序列較為相似,且在C末端同樣含有一個保守性很高的SOC1motif序列,說明NtSOC1是屬于SOC1/TM3亞家族基因。熒光定量PCR分析顯示,NtSOC1在花芽分化階段的表達量隨著花芽的分化而升高,花芽分化結束時減少,表明NtSOC1基因可能參與中國水仙的花芽分化。成功構建了NtSOC1基因表達載體pCAMBIA1302-NtSOC1,通過農桿菌轉化洋蔥表皮對編碼蛋白進行亞細胞定位結果顯示,NtSOC1基因編碼蛋白定位于細胞核,符合轉錄因子的亞細胞定位特征。該實驗結果為進一步研究NtSOC1基因的生物學功能奠定了基礎。
[Abstract]:The cDNA of the homologous gene NtSOC1.NtSOC1 of anthesis related transcription factor (SOC1) was obtained by RACE and RT-PCR from Narcissus chinensis (Narcissus chinensis) as experimental material. The cDNA contained an open reading frame of 687bp encoding 228 amino acids. Bioinformatics analysis showed that the amino acid sequence of SOC1 homologous gene of NtSOC1 and Monocotyledonous plants was similar, and a highly conserved SOC1motif sequence was also found at the C-terminal, indicating that NtSOC1 belongs to the SOC1/TM3 subfamily gene. Fluorescence quantitative PCR analysis showed that the expression of NtSOC1 increased with flower bud differentiation and decreased at the end of flower bud differentiation, suggesting that NtSOC1 gene might be involved in flower bud differentiation of Narcissus chinensis. The NtSOC1 gene expression vector pCAMBIA1302-NtSOC1, was successfully constructed and transformed into onion epidermis by Agrobacterium tumefaciens for subcellular localization of the encoded protein. The results showed that the encoded protein of NtSOC1 gene was located in the nucleus and accorded with the subcellular localization characteristics of transcription factors. The results laid a foundation for further study of the biological function of NtSOC1 gene.
【作者單位】: 福建農林大學園藝學院;
【基金】:國家自然科學基金(31601783) 福建省自然科學基金(2014J01083)
【分類號】:Q943.2;S682.21

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本文編號:2294147

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