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蜆殼花椒GID1同源基因克隆及其在種子萌發(fā)過程中的表達分析

發(fā)布時間:2018-10-25 09:48
【摘要】:GID1是赤霉素信號通路關鍵調控基因,其通路主要影響種子萌發(fā)和植物生長。本文以高通量測序構建的蜆殼花椒(Zanthoxylum dissitum)cDNA文庫為參考,克隆了蜆殼花椒3個GID1同源基因ZaGID1a、ZaGID1b、ZaGID1c。利用生物信息學對蜆殼花椒GID1同源基因的核酸序列及氨基酸序列進行分析,表明3個同源GID1序列編碼的蛋白功能區(qū)域、理化性質、系統發(fā)育、親疏水性、亞細胞信號肽定位、三級結構預測等各項生物信息學信息均指向赤霉素受體蛋白功能。同源GID1序列在蜆殼花椒種子人工萌發(fā)過程中的實時熒光定量PCR(qRT-PCR)表達量分析研究表明,ZaGID1a、ZaGID1c可能對蜆殼花椒種子萌發(fā)起關鍵調控作用,ZaGID1b與種子萌發(fā)過程的關系不明顯。
[Abstract]:GID1 is a key regulation gene of gibberellin signaling pathway which mainly affects seed germination and plant growth. Based on the (Zanthoxylum dissitum) cDNA library constructed by high throughput sequencing, three GID1 homologous genes ZaGID1a,ZaGID1b,ZaGID1c. were cloned. The nucleic acid sequence and amino acid sequence of GID1 homologous gene in Shell pepper were analyzed by bioinformatics. The results showed that three homologous GID1 sequences encoded protein functional region, physical and chemical properties, phylogeny, hydrophobicity, subcellular signal peptide localization. Bioinformatics information, such as tertiary structure prediction, all point to the function of gibberellin receptor protein. The analysis of real-time fluorescence quantitative PCR (qRT-PCR) expression of homologous GID1 sequence in the process of seed germination showed that ZaGID1a,ZaGID1c may play a key role in the seed germination, but the relationship between ZaGID1b and seed germination was not obvious.
【作者單位】: 中南林業(yè)科技大學生命科學與技術學院;中南林業(yè)科技大學環(huán)境科學與工程學院;
【基金】:國家自然科學基金(31370612) 湖南省高?萍汲晒a業(yè)化繁育項目(15CY011)~~
【分類號】:S567.19

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本文編號:2293339

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