【摘要】：以生長于廣西大廠錫多金屬礦上部(重金屬脅迫區(qū))和未受礦化或污染影響的礦區(qū)外圍(對照區(qū))的芒萁[Dicranopteris pedata(Houtt.)Nakaike]為實驗材料,對芒萁葉片進行轉(zhuǎn)錄組高通量測序,并對組裝得到的unigenes經(jīng)NCBI官方非冗余蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(Nr)、NCBI官方非冗余核苷酸序列數(shù)據(jù)庫(Nt)、KEGG直系同源數(shù)據(jù)庫(KO)、Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫(Swiss-Prot)、蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫(Pfam)、基因功能分類體系數(shù)據(jù)庫(GO)和真核生物直系同源序列數(shù)據(jù)庫(KOG)進行注釋,同時分析重金屬脅迫區(qū)和對照區(qū)芒萁葉片間的差異表達unigenes。結(jié)果顯示:測序獲得19.56 Gb clean data,其中,重金屬脅迫區(qū)和對照區(qū)芒萁葉片分別含10.14和9.42 Gb clean data。組裝得到的250 582個unigenes中有120 097個unigenes得到注釋,占unigenes總數(shù)的47.93%。與對照區(qū)相比較,重金屬脅迫區(qū)芒萁葉片中上調(diào)和下調(diào)差異表達unigenes分別有208和620個,其中120個上調(diào)差異表達unigenes注釋為代謝過程,占所有上調(diào)差異表達unigenes的57.69%;285個下調(diào)差異表達unigenes注釋為催化活性,占所有下調(diào)差異表達unigenes的45.97%。重金屬脅迫區(qū)芒萁葉片中15個unigenes與重金屬轉(zhuǎn)運和耐受相關(guān),其中c44988_g1和c84121_g1的相對表達量分別極顯著和顯著高于對照區(qū)。研究結(jié)果顯示:芒萁響應(yīng)自然金屬礦化或礦山重金屬污染的基因可以用于生物地球化學(xué)找礦和土壤重金屬污染檢測。
[Abstract]:Osmunda dichotoma (Dicranopteris pedata (Houtt.) Nakaike) grown in the upper part of Dachang tin polymetallic ore deposit (heavy metal stress area) and the outer area (control area) not affected by mineralization or pollution were used as experimental materials. The unigenes was assembled by NCBI official non-redundant protein sequence database (Nr), NCBI official nonredundant nucleotide sequence database (Nt), KEGG homologous database (KO), Swiss-Prot database (Swiss-Prot) and protein family database (Pfam), gene functional classification system database. (GO) and Eukaryotic homologous sequence database (KOG) were annotated. Expression of unigenes. in leaves of Osmunda japonicus under heavy metal stress and control The results showed that 19.56 Gb clean data, were obtained by sequencing. The leaves of Osmunda japonica were 10.14 Gb clean data. and 9.42 Gb clean data. in heavy metal stress region and control area, respectively. Of the 250582 unigenes assembled, 120,097 unigenes were annotated, accounting for 47.93% of the total unigenes. There were 208,620 unigenes upregulation and down-regulation in the leaves of Osmunda japonicus under heavy metal stress, and 120 of them up-regulated the differential expression of unigenes as a metabolic process. 57.69and 285 down-regulated differentially expressed unigenes were noted as catalytic activity, and 45.97% of all down-regulated differentially expressed unigenes. 15 unigenes were related to heavy metal transport and tolerance in the leaves of Osmunda japonicus under heavy metal stress. The relative expression of c44988_g1 and c84121_g1 were significantly higher than those of the control. The results show that the genes that respond to natural metal mineralization or mine heavy metal pollution can be used for biogeochemical prospecting and soil heavy metal contamination detection.
【作者單位】： 廣西大學(xué)農(nóng)學(xué)院;廣東工業(yè)大學(xué)計算機學(xué)院;桂林理工大學(xué)廣西隱伏金屬礦產(chǎn)勘查重點實驗室;桂林理工大學(xué)地球科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(41363003;40972220)
【分類號】：Q943.2

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前7條

1 陳楊;蒙夢平;宋慈安;;植物對土壤中微量元素的吸收與轉(zhuǎn)移及對生物地球化學(xué)異常形成的影響——以廣西鹽田嶺錫石硫化物礦床為例[J];地球與環(huán)境;2012年02期

2 楊勝香;田啟建;梁士楚;周耀渝;鄒慧成;;湘西花垣礦區(qū)主要植物種類及優(yōu)勢植物重金屬蓄積特征[J];環(huán)境科學(xué);2012年06期

3 劉足根;楊國華;楊帆;劉雷;方紅亞;黃精明;;贛南鎢礦區(qū)土壤重金屬含量與植物富集特征[J];生態(tài)學(xué)雜志;2008年08期

4 徐金鴻;徐瑞松;夏斌;;廣東鼎湖山斑巖鉬礦區(qū)生物地球化學(xué)特征[J];地球與環(huán)境;2006年01期

5 陳代演,鄒振西,任大銀;植物找礦法在尋找鉈礦床中的初步應(yīng)用[J];礦物巖石地球化學(xué)通報;2000年04期

6 馬躍良;廣東省河臺金礦生物地球化學(xué)特征及遙感找礦意義[J];礦物學(xué)報;2000年01期

7 季峻峰,崔衛(wèi)東,孫承轅;湖南黃金洞金礦床植物地球化學(xué)勘查的初步研究[J];物探與化探;1992年06期

【共引文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 鄒承武;宋瑋;宋慈安;雷良奇;;基于RNA-Seq技術(shù)分析在金屬礦上部生長的芒萁的差異表達基因[J];植物資源與環(huán)境學(xué)報;2017年02期

2 李鳳梅;楊勝香;曹建兵;彭清靜;符待君;龍華來;;湘西典型錳渣庫主要優(yōu)勢植物種類及重金屬耐性特征[J];重慶師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2017年04期

3 張靜;蔡靜如;許建新;劉文竹;沈彥會;錢瑭璜;劉建華;;蕨類植物在生態(tài)修復(fù)中的應(yīng)用研究進展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2017年04期

4 趙玉紅;拉巴曲吉;羅布;王向濤;楊路存;方江平;;銅、鎘、鉛、鋅對4種豆科植物種子萌發(fā)的影響[J];種子;2017年01期

5 劉詩敏;高良敏;邱增羽;黃肖萌;楊茗;雒建偉;;淮南部分采煤沉陷復(fù)墾區(qū)土地中植物重金屬的富集特征比較研究[J];山東工業(yè)技術(shù);2017年02期

6 劉敏;武化民;李秀峰;謝慧敏;陳會明;;土壤重金屬污染植物修復(fù)的發(fā)展現(xiàn)狀[J];資源節(jié)約與環(huán)保;2016年11期

7 王小玲;劉騰云;幸學(xué)俊;李茜;高柱;;硅對Cd、Pb、Cu、Zn正交脅迫下水稻丙二醛含量的影響[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);2016年22期

8 張然然;羅鵬林;劉遠河;康薇;;大冶銅綠山礦區(qū)優(yōu)勢草本植物重金屬富集能力測定[J];化學(xué)與生物工程;2016年11期

9 田桃;曾敏;周航;徐s，

本文編號：2293156