【摘要】：以生長(zhǎng)于廣西大廠錫多金屬礦上部(重金屬脅迫區(qū))和未受礦化或污染影響的礦區(qū)外圍(對(duì)照區(qū))的芒萁[Dicranopteris pedata(Houtt.)Nakaike]為實(shí)驗(yàn)材料,對(duì)芒萁葉片進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序,并對(duì)組裝得到的unigenes經(jīng)NCBI官方非冗余蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)(Nr)、NCBI官方非冗余核苷酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)(Nt)、KEGG直系同源數(shù)據(jù)庫(kù)(KO)、Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫(kù)(Swiss-Prot)、蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫(kù)(Pfam)、基因功能分類(lèi)體系數(shù)據(jù)庫(kù)(GO)和真核生物直系同源序列數(shù)據(jù)庫(kù)(KOG)進(jìn)行注釋,同時(shí)分析重金屬脅迫區(qū)和對(duì)照區(qū)芒萁葉片間的差異表達(dá)unigenes。結(jié)果顯示:測(cè)序獲得19.56 Gb clean data,其中,重金屬脅迫區(qū)和對(duì)照區(qū)芒萁葉片分別含10.14和9.42 Gb clean data。組裝得到的250 582個(gè)unigenes中有120 097個(gè)unigenes得到注釋,占unigenes總數(shù)的47.93%。與對(duì)照區(qū)相比較,重金屬脅迫區(qū)芒萁葉片中上調(diào)和下調(diào)差異表達(dá)unigenes分別有208和620個(gè),其中120個(gè)上調(diào)差異表達(dá)unigenes注釋為代謝過(guò)程,占所有上調(diào)差異表達(dá)unigenes的57.69%;285個(gè)下調(diào)差異表達(dá)unigenes注釋為催化活性,占所有下調(diào)差異表達(dá)unigenes的45.97%。重金屬脅迫區(qū)芒萁葉片中15個(gè)unigenes與重金屬轉(zhuǎn)運(yùn)和耐受相關(guān),其中c44988_g1和c84121_g1的相對(duì)表達(dá)量分別極顯著和顯著高于對(duì)照區(qū)。研究結(jié)果顯示:芒萁響應(yīng)自然金屬礦化或礦山重金屬污染的基因可以用于生物地球化學(xué)找礦和土壤重金屬污染檢測(cè)。
[Abstract]:Osmunda dichotoma (Dicranopteris pedata (Houtt.) Nakaike) grown in the upper part of Dachang tin polymetallic ore deposit (heavy metal stress area) and the outer area (control area) not affected by mineralization or pollution were used as experimental materials. The unigenes was assembled by NCBI official non-redundant protein sequence database (Nr), NCBI official nonredundant nucleotide sequence database (Nt), KEGG homologous database (KO), Swiss-Prot database (Swiss-Prot) and protein family database (Pfam), gene functional classification system database. (GO) and Eukaryotic homologous sequence database (KOG) were annotated. Expression of unigenes. in leaves of Osmunda japonicus under heavy metal stress and control The results showed that 19.56 Gb clean data, were obtained by sequencing. The leaves of Osmunda japonica were 10.14 Gb clean data. and 9.42 Gb clean data. in heavy metal stress region and control area, respectively. Of the 250582 unigenes assembled, 120,097 unigenes were annotated, accounting for 47.93% of the total unigenes. There were 208,620 unigenes upregulation and down-regulation in the leaves of Osmunda japonicus under heavy metal stress, and 120 of them up-regulated the differential expression of unigenes as a metabolic process. 57.69and 285 down-regulated differentially expressed unigenes were noted as catalytic activity, and 45.97% of all down-regulated differentially expressed unigenes. 15 unigenes were related to heavy metal transport and tolerance in the leaves of Osmunda japonicus under heavy metal stress. The relative expression of c44988_g1 and c84121_g1 were significantly higher than those of the control. The results show that the genes that respond to natural metal mineralization or mine heavy metal pollution can be used for biogeochemical prospecting and soil heavy metal contamination detection.
【作者單位】： 廣西大學(xué)農(nóng)學(xué)院;廣東工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院;桂林理工大學(xué)廣西隱伏金屬礦產(chǎn)勘查重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;桂林理工大學(xué)地球科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(41363003;40972220)
【分類(lèi)號(hào)】：Q943.2

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2293156